[发明专利]一种绵羊多羔性状的SNP分子标记及其检测用引物组、试剂盒和应用

说明书

本发明提供了一种绵羊多羔性状的SNP分子标记及其检测用引物组、试剂盒和应用，属于SNP分子标记技术领域。本发明所述SNP分子标记含有位于绵羊第7号染色体上第89431097bp处多态性为C/G的核苷酸序列。通过对所述SNP位点进行分型即可确定待测绵羊产羔性能：当所述SNP位点为G碱基时，绵羊具有单胎产多羔性状；当所述位点为C碱基时，绵羊无单胎产多羔性状。本发明还提供了在绵羊育种过程中，筛选所述SNP位点为G碱基的绵羊进行后续育种的应用。所述应用方法具有灵敏度高，准确性高，性价比高的特点，可在绵羊育种过程中将具有单胎产多羔性状的GG纯合个体和CG杂合个体选留下来，从而提高绵羊的繁殖力。

技术领域

本发明属于SNP分子标记技术领域，具体涉及一种绵羊多羔性状的SNP分子标记及其检测用引物组、试剂盒和应用。

背景技术

产羔性状是绵羊的重要经济性状之一。因此，提高绵羊每胎的产羔数是提升生产经济效益的重要措施。产羔数是一个极其复杂的性状，受到饲料、遗传背景、饲养环境等诸多因素的影响，其中以遗传背景最为重要，不同品种绵羊之间的繁殖力具有显著的差异性。

应用基因组学方法的研究能在整个基因组的水平筛选出与绵羊繁殖性状相关的候选基因和分子标记，使学者们能够更深入的理解绵羊多羔性状的遗传机理，可对我国绵羊业的可持续发展将带来巨大的经济效益。目前，研究最多的是绵羊FecB基因。然而，实践中根据FecB基因型推断只产单羔的++型小尾寒羊中仍然能够观测到连续的高产羔数现象。由此推断小尾寒羊还存在其他的多羔主效基因。因此，需要进一步鉴定其他多羔主效基因以及致因突变位点，以望更准确地预测绵羊例如小尾寒羊等的多羔形状。

发明内容

有鉴于背景技术中存在的问题，本发明的目的在于提供一种与绵羊多羔性状相关的SNP分子标记及其检测用引物组、试剂盒和应用。

本发明提供了一种绵羊多羔性状的SNP分子标记，所述SNP分子标记含有位于绵羊第7号染色体上第89431097bp处多态性为C/G的核苷酸序列。

优选的，所述SNP分子标记含有如SEQ ID No.1所示的核苷酸序列，所述核苷酸序列的第200bp处多态性为C/G。

本发明提供了用于检测上述SNP分子标记的引物组，其特征在于，包括第一引物、第二引物和延伸引物；

所述第一引物的核苷酸序列如SEQ ID No.2所示；

所述第二引物的核苷酸序列如SEQ ID No.3所示；

所述延伸引物的核苷酸序列如SEQ ID No.4所示。

本发明提供了用于检测上述SNP分子标记的试剂盒，包括dNTPs、Taq DNA聚合酶、MgCl₂、PCR反应缓冲液和SAP酶，还包括上述引物组。

优选的，所述引物组中第一引物和第二引物的使用浓度独立为0.45～0.55μmol/L；所述引物组中的延伸引物的浓度为0.6～1.3μmol/L。

优选的，所述试剂盒还包括基因型为GG的标准阳性模板DNA。

本发明还提供了一种检测上述SNP分子标记的方法，包括以下步骤：

1)提取待测绵羊的基因组DNA；

2)以待测绵羊的基因组DNA为模板，利用所述引物组中的第一引物和第二引物进行PCR扩增反应获得PCR扩增产物；

3)用SAP酶对步骤2)中获得的PCR扩增产物进行消化获得消化后的产物；

4)以消化后的产物为模板，利用所述引物组中的延伸引物进行延伸反应获得延伸产物；

5)对所述延伸产物进行分析，确定所述SNP位点的基因型。