[发明专利]基因标志物在儿童呼吸道合胞病毒感染诊断中的应用

说明书

本发明公开了基因标志物在儿童呼吸道合胞病毒感染诊断中的应用，所述基因标志物为PAFAH2与TYSND1，PAFAH2与TYSND1在RSV感染的儿童中表达下调，提示可以通过检测PAFAH2与TYSND1的表达水平诊断儿通RSV感染疾病。

技术领域

本发明属于生物医药领域，涉及基因标志物在儿童呼吸道合胞病毒感染诊断中的应用。

背景技术

呼吸道合胞病毒(Respiratory syncytial virus，RSV)，是有包膜的单负链无节段的RNA病毒，其基因组由大约1,5000个核苷酸组成，包含10个基因，从3’端开始分别编码非结构蛋白1(NS1)、非结构蛋白2(NS2)、核衣壳蛋白(N)、磷蛋白(P)、基质蛋白(M)、小疏水蛋白(SH)、糖蛋白(G)、融合蛋白(F)、M2ORF1/ORF2蛋白(M2-1/M2-2)和大蛋白(L)共11种病毒蛋白。RSV经呼吸道传播，人是其唯一的天然宿主，某些情况下亦可传播至非人灵长类动物。RSV呈世界性分布，仅有一个血清型，可根据抗原反应性分为A，B两个亚组，A亚组在全球多数地区处于优势流行。

RSV是导致幼儿急性下呼吸道感染的最重要的病原体，可导致包括毛细支气管炎和肺炎在内的严重下呼吸道疾病。研究显示，因呼吸道疾病住院治疗的婴幼儿中，毛细支气管炎病例中RSV检出率可达43％，肺炎病例中检出率为25％。儿童是RSV的主要易感人群，至2周岁时超过95％的儿童已感染过RSV。相比于其他常见呼吸道病毒，如流感病毒和副流感病毒，RSV更易引发下呼吸道感染，而急性下呼吸道感染是世界范围内导致儿童死亡的主要原因之一。

随着研究的深入，人们发现，RSV作为呼吸道最常见的病原体之一，在感染人类呼吸道上皮细胞的过程中，必然会引起宿主细胞基因的表达发生变化，这种变化对病毒在宿主细胞中的复制、以及与机体抗病毒免疫系统产生相互作用。病毒与宿主的相互作用贯穿于病毒的整个生命周期，仅从病毒角度进行研究不足以完整认识RSV的致病机制。病毒对宿主细胞的嗜性、宿主细胞对病毒复制容许性的差异、病毒抗性细胞的出现及机体对病毒的清除，都提示宿主细胞内存在能够直接影响或决定病毒感染与复制过程的关键因子，对这些关键宿主因子的全面认识，有助于阐明病毒致病机制，发现新的诊断和治疗靶点。

发明内容

为了弥补现有技术的不足，本发明的目的在于提供一种与儿童呼吸道合胞病毒感染相关的宿主因子，所述宿主因子有利于阐释RSV的致病机制，实现RSV的早期检测和提供抗病毒靶点。

为了实现上述目的，本发明采用如下技术方案：

本发明的第一方面提供了检测基因标志物的试剂在制备诊断儿童呼吸道合胞病毒感染产品中的应用，所述基因标志物选自PAFAH2、TYSND1的一种或两种。

进一步，所述产品包括通过测序技术、核酸杂交技术、核酸扩增技术、蛋白免疫技术检测基因标志物水平的试剂。

进一步，所述试剂选自：

特异性识别所述基因的探针；或

特异性扩增所述基因的引物；或

特异性结合所述基因编码的蛋白的抗体或配体。

进一步，特异性扩增PAFAH2的引物序列如SEQ ID NO.1～2所示，特异性扩增TYSND1的引物序列如SEQ ID NO.3～4所示。

本发明的第二方面提供了体外检测样本中本发明第一方面中所述的基因标志物表达水平的产品，所述产品包括制剂、核酸膜条、芯片或试剂盒；其中，“样本”是包含细胞或细胞物质的可从中获取核酸、多肽、或其它分析物的物质。

进一步，所述芯片包括基因芯片、蛋白质芯片，其中基因芯片包括针对基因标志物的特异性引物或寡核苷酸探针，蛋白质芯片包括特异性结合基因标志物编码的蛋白的抗体或配体。

进一步，所述试剂盒包括：