[发明专利]基于UBXN11基因多态性位点预测A(H7N9)易感人群的用途及试剂盒及方法有效
| 申请号: | 201811545165.1 | 申请日: | 2018-12-17 |
| 公开(公告)号: | CN109536600B | 公开(公告)日: | 2021-11-05 |
| 发明(设计)人: | 张曦;赵雪;秦胜营;贺林;滕峥;袁政安;李崇山;王嘉瑜;房方皓;匡小舟 | 申请(专利权)人: | 上海市疾病预防控制中心;上海交通大学 |
| 主分类号: | C12Q1/6883 | 分类号: | C12Q1/6883;C12N15/11 |
| 代理公司: | 上海天翔知识产权代理有限公司 31224 | 代理人: | 吕伴 |
| 地址: | 200336 上*** | 国省代码: | 上海;31 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 基于 ubxn11 基因 多态性 预测 h7n9 感人 用途 试剂盒 方法 | ||
1.检测 UBXN11基因的多态性位点基因型的试剂在制备预测H7N9禽流感易感人群的试剂盒中的应用,其特征在于,所述的UBXN11基因多态性位点为 rs189256251,UBXN11基因的rs189256251多态性位点有两种基因型,分别为CT和CC,当rs189256251多态性位点基因型为CT时,预测样本为H7N9禽流感易感人群;
当rs189256251多态性位点基因型为CC时,预测样本为H7N9禽流感非易感人群;
所述试剂包含以下组成部分:
(1)检测UBXN11基因的多态性位点基因型的引物,包含用于检测SNP rs189256251的扩增引物和用于检测SNP rs189256251的延伸引物;
(2)PCR反应缓冲液,MgCl2,水和dNTP;
(3)Taq DNA聚合酶;
(4)PCR产物纯化酶;
(5)单碱基延伸反应酶及相应缓冲液;
其中,所述的用于检测SNP rs189256251的扩增引物为:
5’-ACGTTGGATGATCAGTAGGAAGGCCTGTTC-3’;
5’-ACGTTGGATGAGCCAGGAGTCACCCAACAC-3’;
所述的用于检测SNP rs189256251的延伸引物为:
5’-CCCATTCTCAGACTTGATG-3’;
所述的rs189256251多态性位点所在的基因序列为:
GATCTCAAAG GCAGAGGCAT CCATGACCCT GGGGACCAGG CAGAGCAGAT CAGGCTGGGCAGTGGGACCA GAGCCCCTCT GTGGCCCTGG CCCTGCCCTG CACCCACCTG GCCTGCGCTA GCAGAGCTCGCACGTCCCCA ATGGTGTTGT CAGGCTGCAT CATCAGTAGG AAGGCCTGTT CCCCATTCTC AGACTTGATGB GCAGCATGGA GAGCGGGGGT GCCGGCGTGT TGGGTGACTC CTGGCTCCTG CACAGCCCAGAGGCCATCAG CACGCGGTGA CCCAACGCCC CCAGGCCCTC ACCTCCTCAT CCCGCCCTCA CCTCTCTCGCTCAGCGGCCA AGGTGGGCGT CTCCACCACA ATCTCCTGGA TCCGGGCAGG CAATGGGCAG CAGTTCTGGA;
其中,B为rs189256251对应的特异性位点,特异性位点为C时对应CC基因型;特异性位点为T时对应CT基因型。
2.如权利要求1所述的检测 UBXN11基因的多态性位点基因型的试剂在制备预测H7N9禽流感易感人群的试剂盒中的应用,其特征在于,
所述PCR反应缓冲液为:
Tris-Cl缓冲液,浓度为10mM,并将其pH调节到8.3-8.8之间;
所述dNTP为脱氧核糖核苷三磷酸,浓度为25mM;
所述MgCl2浓度为25mM;
所述水为HPLC级别。
3.如权利要求1所述的检测 UBXN11基因的多态性位点基因型的试剂在制备预测H7N9禽流感易感人群的试剂盒中的应用,其特征在于,所述Taq DNA聚合酶浓度为5U/ul。
4.如权利要求1所述的检测 UBXN11基因的多态性位点基因型的试剂在制备预测H7N9禽流感易感人群的试剂盒中的应用,其特征在于,所述PCR产物纯化酶为:虾碱性磷酸酶,浓度为1.7U/ul。
5.如权利要求1所述的检测 UBXN11基因的多态性位点基因型的试剂在制备预测H7N9禽流感易感人群的试剂盒中的应用,其特征在于,所述单碱基延伸反应酶及相应缓冲液为:iPLEX酶及反应缓冲液和水,所述水为HPLC级别。
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