[发明专利]一种药物预测方法、装置、服务器及存储介质

权利要求书

1.一种药物预测方法，其特征在于，应用于服务器，所述方法包括：

从基于网络的细胞反应印记整合资料库中获取药物扰动后的基因组表达谱数据，并对所述基因组表达谱数据进行预处理；

将预处理后的基因组表达谱数据转换成药物扰动下的差异表达秩序列；

从基因表达综合数据库中获取病原体感染表达谱数据，并对所述病原体感染表达谱数据进行预处理；

根据预处理后的病原体感染表达谱数据构建病原体感染印记基因集；

通过基因集富集分析算法将所述药物扰动下的差异表达秩序列和所述病原体感染印记基因集进行比对，得到富集分数，并判断所述富集分数是否为负；其中，所述判断所述富集分数是否为负，包括：

判断所述病原体感染印记基因集中的上调基因是否倾向位于药物扰动下的差异表达秩序列的底部和/或判断所述病原体感染印记基因集中的下调基因是否倾向于位于药物扰动下的差异表达秩序列的顶部，若是，则所述富集分数为负；

若是，则通过所述富集分数构建病原体和药物的关联网络，获取富集分数靠前的关联关系；

对所述富集分数靠前的关联关系以及病原体和药物的聚类结果进行分析，获得未知病原体的防治药物；

其中，所述将预处理后的基因组表达谱数据转换成药物扰动下的差异表达秩序列，包括：

计算基因的差异表达量，根据基因的差异表达量从高到低将基因从上到下排列，得到秩序列；所述计算基因的差异表达量为估算每个基因在实验条件较之对照条件下表达量的倍数差异值；

选取秩序列中的所有基因作为药物扰动下的差异表达秩序列。

2.根据权利要求1所述方法，其特征在于，所述根据预处理后的病原体感染表达谱数据构建病原体感染印记基因集，包括：

根据预处理后的病原体感染表达谱数据通过计算差异表达和提取表达谱印记构建病原体感染印记基因集。

3.根据权利要求2所述方法，其特征在于，所述根据预处理后的病原体感染表达谱数据通过计算差异表达和提取表达谱印记构建病原体感染印记基因集，包括：

计算所述预处理后的病原体基因的差异表达量；

根据所述差异表达量将所述预处理后的病原体基因进行排序，获得病原体感染下的差异表达秩序列；

选取所述病原体感染下的差异表达秩序列中的部分秩序列作为病原体感染印记基因集。

4.根据权利要求1所述方法，其特征在于，所述构建病原体和药物的关联网络，包括：

构建权重为富集分数，节点为病原体和药物的二分网络。

5.根据权利要求1所述方法，其特征在于，所述对所述基因组表达谱数据进行预处理，包括：

通过减少批次效应和/或选取可信代表对所述基因组表达谱数据进行预处理。