[发明专利]一种靶向结合CD133蛋白的核酸适配体及其筛选方法和用途有效

专利信息
申请号: 201811484443.7 申请日: 2018-12-06
公开(公告)号: CN109536503B 公开(公告)日: 2021-03-02
发明(设计)人: 朱栩杭;葛明华;那仁满都拉;黄萍;杨畅;李清林;兰霞斌;曹君;温庆良;黄煜庆;周菁楠 申请(专利权)人: 浙江省肿瘤医院
主分类号: C12N15/115 分类号: C12N15/115;C12N15/10;A61K47/54;A61K31/704;A61P35/00
代理公司: 宁波鄞州全方专利商标事务所(普通合伙) 33242 代理人: 楼瑜舟;刘永斌
地址: 310022 浙*** 国省代码: 浙江;33
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摘要:
搜索关键词: 一种 靶向 结合 cd133 蛋白 核酸 适配体 及其 筛选 方法 用途
【说明书】:

发明提供了一种靶向结合CD133蛋白的核酸适配体及其筛选方法和用途,核酸适配体序列如SEQ ID NO.1,本发明采用细胞筛选的方法从ssDNA文库中筛选出靶向结合CD133蛋白的适配体,并对筛选出的ssDNA通过高通量测序的方法进行检测,最终通过流式细胞术等方法对所得序列的稳定性以及亲和性的分析,挑选出适配体AP‑1‑M。然后通过免疫荧光法证明适配体AP‑1‑M能够特异性地靶向结合CD133蛋白,并和表达CD133蛋白的ATC细胞结合从而起到靶向输送的作用,为ATC的靶向治疗提供新的思路和方法。

技术领域

本发明属于生物制药领域,特别涉及一种靶向结合CD133蛋白的核酸适配体。

背景技术

甲状腺癌(thyroid carcinoma)是最常见的甲状腺恶性肿瘤,约占全身恶性肿瘤的1%。按照其恶性程度可分为分化型甲状腺癌(DTC),低分化型甲状腺癌(PDTC),未分化型甲状腺癌(ATC)。ATC由于能迅速扩展到颈部,会引起呼吸窘迫和食管梗阻,极易出现淋巴结和远处转移,其中位生存期少于6个月,甚至1年内的生存率只有10%。然而,目前人们对ATC的分子机制尚不明确,诊断和治疗方法有限,因此,迫切的需要更好的诊断和治疗的方法。

CD133蛋白为细胞膜蛋白超家族成员,含有865个氨基酸、分子量约为120kDa的糖蛋白,其分子结构包括:细胞外N-端,2个细胞外Loop环,5次跨膜结构域,一个59个氨基酸的细胞C-端和8个N-糖基化端。CD133蛋白的预测大小为97kDa,但实际的糖基化CD133的分子量为120kDa。近年来,研究者发现CD133蛋白存在于多种干细胞样的肿瘤细胞表面,其中包括肝癌、结肠癌以及卵巢癌。

核酸适配体,又称化学抗体,具有精准的靶向性,由单链的核糖核苷酸或脱氧核糖核苷酸构成。虽然多数核酸适配体本身没有治疗作用,但核酸适配体可以与毒性药物相连接组成靶向适配体偶联物,可以将药物“精确”地运送到靶细胞,使得适配体偶联药物被靶细胞内吞,在细胞内部释放药物诱导凋亡,既有效地提高了肿瘤局部的药物浓度,又可极大地降低体内其它组织、器官的毒性,从而达到真正靶向增效减毒的作用。

CD133蛋白存在于多种干细胞样的肿瘤细胞表面,其中包括肝癌、结肠癌以及卵巢癌,这为临床上筛选和研究新型药物提供了较好的特异性靶点,从而为研发更加安全有效的分子靶向药物提供了的思路。

此外,也有研究报道CD133蛋白在未分化型甲状腺癌(Anaplastic thyroidcarcinoma,ATC)中有表达,但是目前缺少合适的适配体用于未分化型甲状腺癌治疗研究。

发明内容

本发明的膜蛋白CD133为适配体,能够靶向结合。可以用于ATC的靶向治疗及研究。

本发明的目的是提供一种用于靶向结合CD133蛋白的单链DNA核酸适配体。

根据本发明的其中一方面,提供了一种靶向结合CD133蛋白的核酸适配体,该靶向结合CD133蛋白的核酸适配体为单链DNA核酸适配体。

根据本发明的其中一方面,提供了一种靶向结合CD133蛋白的核酸适配体,该靶向结合CD133蛋白的核酸适配体序列如序列表中SEQ ID NO.1

,其序列为:

5’-TACCAGCCGTTTCCCCGGAGGGTCACCCCTGACGCATTCGGTTGAC-3’。

根据本发明的其中一方面,提供了一种筛选靶向结合CD133蛋白的核酸适配体的方法,方法步骤为:

a、采用细胞筛选的方法从ssDNA文库中筛选出靶向结合CD133蛋白的适配体;

b、对步骤a筛选出的ssDNA通过高通量测序的方法进行检测,并对序列的稳定性以及亲和性的分析,筛选出靶向结合CD133蛋白的核酸适配体;

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