[发明专利]含单分子标签的测序接头和测序文库的构建方法有效
申请号: | 201811483755.6 | 申请日: | 2018-12-06 |
公开(公告)号: | CN109576347B | 公开(公告)日: | 2021-03-12 |
发明(设计)人: | 张晓妮;许明炎;方文;屈宏越 | 申请(专利权)人: | 深圳海普洛斯医疗器械有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6806 | 分类号: | C12Q1/6806;C12N15/10;C12N15/11;C40B50/06;C40B80/00 |
代理公司: | 深圳舍穆专利代理事务所(特殊普通合伙) 44398 | 代理人: | 黄贤炬 |
地址: | 518000 广东省深圳市龙华区观湖*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 分子 标签 接头 序文 构建 方法 | ||
1.一种含单分子标签的测序接头,其特征在于:
通过第一核苷酸单链与第二核苷酸单链部分结合而形成,
其中,所述第一核苷酸单链包括单分子标签和第一测序引物序列,并且
所述第二核苷酸单链包括样本标签、以及与所述第一测序引物序列部分互补的第二测序引物序列。
2.如权利要求1所述的测序接头,其特征在于:
所述测序接头为Y字型接头。
3.如权利要求1所述的测序接头,其特征在于:
所述第一核苷酸单链还包括第一通用引物序列,并且
所述第二核苷酸单链还包括第二通用引物序列。
4.如权利要求1所述的测序接头,其特征在于:
所述单分子标签为用于标记不同DNA片段的随机的碱基序列。
5.如权利要求1所述的测序接头,其特征在于:
所述样本标签为用于区别不同样本的固定的碱基序列。
6.如权利要求1或4所述的测序接头,其特征在于:
所述单分子标签的序列为SEQ ID NO:5-10。
7.如权利要求1或5所述的测序接头,其特征在于:
所述样本标签的序列为SEQ ID NO:18-23。
8.如权利要求1所述的测序接头,其特征在于:
所述单分子标签的长度为4bp至20bp。
9.如权利要求1所述的测序接头,其特征在于:
所述样本标签的长度为4bp至20bp。
10.如权利要求1所述的测序接头,其特征在于:
所述第二核苷酸单链的5’端使用磷酸基团修饰。
11.如权利要求1所述的测序接头,其特征在于:
所述第一核苷酸单链与所述第二核苷酸单链通过退火而部分结合。
12.如权利要求1所述的测序接头,其特征在于:
所述第一核苷酸单链为5’-AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACACNNNNNNNNACACTCTTTCCCTACACGACGCTCTTCCGATCT-3’,所述第二核苷酸单链为5’PHO-CAAGCAGAAGACGGCATACGAGATXXXXXXXXGTCTCGTGGGCTCGG;
在所述第一核苷酸单链中,所述第一测序引物序列为SEQ ID NO:1,所述第一通用引物序列为SEQ ID NO:2,其中,所述单分子标签为NNNNNNNN;
在所述第二核苷酸单链中,所述第二测序引物序列为SEQ ID NO:3,所述第二通用引物序列为SEQ ID NO:4,其中,所述样本标签为XXXXXXXX。
13.一种测序文库的构建方法,其特征在于:
包括:
(a)提取DNA;
(b)将DNA进行片段化处理;
(c)对所获得的DNA片段进行末端修复和加A尾;
(d)在步骤(c)所获得的DNA片段两端连接含有权利要求1-12中任一项所述的单分子标签的接头;
(e)以步骤(d)获得的DNA接头连接产物为模板,以两端接头的通用引物为正反向引物,进行PCR扩增并得到PCR产物;以及
(f)进行PCR产物纯化。
14.如权利要求11所述的测序文库的构建方法,其特征在于:
所述步骤(c)中,DNA片段的大小为100bp至250bp之间。
15.如权利要求11所述的测序文库的构建方法,其特征在于:
在步骤(f)中,利用磁珠法对所述PCR产物进行纯化。
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