[发明专利]含单分子标签的测序接头和测序文库的构建方法有效

专利信息
申请号: 201811483755.6 申请日: 2018-12-06
公开(公告)号: CN109576347B 公开(公告)日: 2021-03-12
发明(设计)人: 张晓妮;许明炎;方文;屈宏越 申请(专利权)人: 深圳海普洛斯医疗器械有限公司
主分类号: C12Q1/6806 分类号: C12Q1/6806;C12N15/10;C12N15/11;C40B50/06;C40B80/00
代理公司: 深圳舍穆专利代理事务所(特殊普通合伙) 44398 代理人: 黄贤炬
地址: 518000 广东省深圳市龙华区观湖*** 国省代码: 广东;44
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摘要:
搜索关键词: 分子 标签 接头 序文 构建 方法
【权利要求书】:

1.一种含单分子标签的测序接头,其特征在于:

通过第一核苷酸单链与第二核苷酸单链部分结合而形成,

其中,所述第一核苷酸单链包括单分子标签和第一测序引物序列,并且

所述第二核苷酸单链包括样本标签、以及与所述第一测序引物序列部分互补的第二测序引物序列。

2.如权利要求1所述的测序接头,其特征在于:

所述测序接头为Y字型接头。

3.如权利要求1所述的测序接头,其特征在于:

所述第一核苷酸单链还包括第一通用引物序列,并且

所述第二核苷酸单链还包括第二通用引物序列。

4.如权利要求1所述的测序接头,其特征在于:

所述单分子标签为用于标记不同DNA片段的随机的碱基序列。

5.如权利要求1所述的测序接头,其特征在于:

所述样本标签为用于区别不同样本的固定的碱基序列。

6.如权利要求1或4所述的测序接头,其特征在于:

所述单分子标签的序列为SEQ ID NO:5-10。

7.如权利要求1或5所述的测序接头,其特征在于:

所述样本标签的序列为SEQ ID NO:18-23。

8.如权利要求1所述的测序接头,其特征在于:

所述单分子标签的长度为4bp至20bp。

9.如权利要求1所述的测序接头,其特征在于:

所述样本标签的长度为4bp至20bp。

10.如权利要求1所述的测序接头,其特征在于:

所述第二核苷酸单链的5’端使用磷酸基团修饰。

11.如权利要求1所述的测序接头,其特征在于:

所述第一核苷酸单链与所述第二核苷酸单链通过退火而部分结合。

12.如权利要求1所述的测序接头,其特征在于:

所述第一核苷酸单链为5’-AATGATACGGCGACCACCGAGATCTACACNNNNNNNNACACTCTTTCCCTACACGACGCTCTTCCGATCT-3’,所述第二核苷酸单链为5’PHO-CAAGCAGAAGACGGCATACGAGATXXXXXXXXGTCTCGTGGGCTCGG;

在所述第一核苷酸单链中,所述第一测序引物序列为SEQ ID NO:1,所述第一通用引物序列为SEQ ID NO:2,其中,所述单分子标签为NNNNNNNN;

在所述第二核苷酸单链中,所述第二测序引物序列为SEQ ID NO:3,所述第二通用引物序列为SEQ ID NO:4,其中,所述样本标签为XXXXXXXX。

13.一种测序文库的构建方法,其特征在于:

包括:

(a)提取DNA;

(b)将DNA进行片段化处理;

(c)对所获得的DNA片段进行末端修复和加A尾;

(d)在步骤(c)所获得的DNA片段两端连接含有权利要求1-12中任一项所述的单分子标签的接头;

(e)以步骤(d)获得的DNA接头连接产物为模板,以两端接头的通用引物为正反向引物,进行PCR扩增并得到PCR产物;以及

(f)进行PCR产物纯化。

14.如权利要求11所述的测序文库的构建方法,其特征在于:

所述步骤(c)中,DNA片段的大小为100bp至250bp之间。

15.如权利要求11所述的测序文库的构建方法,其特征在于:

在步骤(f)中,利用磁珠法对所述PCR产物进行纯化。

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