[发明专利]一种混合库基因编辑T1代烟株筛选方法有效

专利信息
申请号: 201811482766.2 申请日: 2018-12-05
公开(公告)号: CN109406729B 公开(公告)日: 2021-03-16
发明(设计)人: 李雪梅;高茜;曾婉俐;向海英;杨光宇;米其利;李晶;黄海涛;宋春满 申请(专利权)人: 云南中烟工业有限责任公司
主分类号: G01N33/00 分类号: G01N33/00;G01N35/00;C12Q1/6869
代理公司: 北京市领专知识产权代理有限公司 11590 代理人: 陈有业;任文娟
地址: 650231 云*** 国省代码: 云南;53
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摘要:
搜索关键词: 一种 混合 基因 编辑 t1 代烟株 筛选 方法
【权利要求书】:

1.一种混合库基因编辑T1代烟株筛选方法,其特征在于,包括:

(1)使用掌上电脑采集样品信息并与服务器终端进行无线连接;

(2)根据掌上电脑与服务器终端无线连接的结果对烟叶样品进行管理,实时完成需进行烟叶样品采集的烟株的筛选、烟叶样品的采集、签收、处理、存储、派样、检测、验余样品存储和验余样品处置的操作;并将检测结果反馈给烟株种植人员,从而完成混合库基因编辑T1代烟株筛选;所述步骤(2),其包括:

(21)对基因编辑后的烟株T0代种子进行点种和编码,并在苗期进行DNA测序,将烟株的DNA测序结果及对应的烟株编码上传至服务器终端;所述T0代种子为基因编辑再生苗烟株的种子,所述T1代烟株为T0代种子种出来的苗烟株;

(22)观察哪些烟株已经达到现蕾期,使用掌上电脑对现蕾期烟株编码进行扫描,根据烟株编码对应的DNA测序结果和是否为首次采集对烟株进行筛选是否进行烟叶采集,从而完成烟株的筛选操作;

(23)采集烟叶样品装入样品袋中并封口,通过蓝牙连接便携式打印机进行样品编码并打印,将打印后的样品编码贴在样品袋上并上传至服务器终端,从而完成烟叶样品采集的操作;

(24)烟叶样品处理部门对采集的烟叶样品进行处理,然后存储在编码对应的固定位置,并采用掌上电脑扫描样品编码将存储位置上传至服务器终端,从而完成烟叶样品处理和存储操作;

(25)烟叶样品派送部门将存储的烟叶样品派送给相应的检测人员并上传至服务器终端,从而完成烟叶样品派送操作;

(26)检测完成后剩余样品退给样品存储部门,存储部门使用掌上电脑进行编码后存储,并上传至服务器终端;

(27)样品检测人员将检测结果在电脑上记录并上传给服务器终端,烟株种植人员根据检测结果及烟株表型记录情况完成混合库基因编辑T1代烟株筛选工作。

2.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述步骤(21),其包括:

(211)对基因编辑后的分化苗烟株进行挂牌编码,每棵分化苗烟株均有其对应的独立编码;

(212)在苗期进行分子采样并进行DNA测序,测序分两步进行:第一步测序烟株是否有sgRNA插入,第二步测序烟株是否有基因编辑;

(213)将烟株的DNA测序结果及对应的烟株编码上传至服务器终端。

3.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述步骤(22),其包括:

(221)使用掌上电脑对烟株编码进行扫描,根据服务器终端进行判定烟株是否为首次烟叶采集,若是则是需要采集烟叶样品的烟株;反之则不采集烟叶样品;

(222)得到步骤(221)为需要采集的烟株,继续使用掌上电脑对烟株编码进行扫描,根据服务器终端对应的DNA测序结果判断是否采集烟叶样品。

4.根据权利要求3所述的方法,其特征在于,所述步骤(222),其包括:

(2221)根据服务器终端对应的DNA测序结果对烟株进行判定,将烟株分为四类,第一类:无需采样,DNA测序结果无sgRNA插入且无编辑;第二类:需采样,DNA测序结果有sgRNA插入但无编辑;第三类:需采样且重点关注,DNA测序结果有sgRNA插入且有编辑;第四类:需采样且重点关注,DNA测序结果无sgRNA插入且有编辑,第五类:需采样,其为未进行基因编辑处理的母本烟株;

(2222)将第二类、第三类、第四类和第五类烟株进行扫描并上传至服务器终端,从而完成烟株的筛选操作。

5.根据权利要求1所述的方法,其特征在于,所述步骤(23),其还包括:

(231)同时在掌上电脑上记录烟株是否有特殊表型,所述特殊表型为叶色白化或黄化、叶面蜡质化革质化、叶缘内缩、主茎多分枝;

(232)将特殊表型和具有特殊表型对应的烟株编码上传至服务器终端。

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