[发明专利]与藏绵羊高原低氧适应性相关的遗传标记及其应用

说明书

本发明提供与藏绵羊高原低氧适应性相关的遗传标记，其特征在于：其位于HMOX1基因上，存在四个优势基因型AA、BB、AB和AC；当藏绵羊的基因型为AA、BB和AC时，藏绵羊高原低氧适应性良好；当藏绵羊的基因型为AB时，藏绵羊高原低氧适应性差。本发明还提供其在选育高原低氧适应性良好的藏绵羊中的应用。本发明公开的遗传标记能够用于鉴定藏绵羊高原低氧适应性的高低，还能够用于选育高原低氧适应性良好的藏绵羊。

技术领域

本发明属于分子生物学技术领域，具体涉及与藏绵羊高原低氧适应性相关的遗传标记及其应用。

背景技术

血红素加氧酶(Hem oxygenase,HMOX)是血红素代谢中的关键限速酶，其通过将血红素氧化生成胆绿素，随后由胆绿素还原酶将其转化为胆红素的代谢通路将体内多余的血红素代谢掉。通过催化血红素降解产生的代谢产物在抗氧化、抗炎症、防御细胞凋亡、传递神经元信息和调节血管紧张度等方面发挥重要作用(Shibahara et al.,1999；McCoubreyet al.,1997；Sun et al.,2003；李艳丽等,2017)。血红素加氧酶存在3种异构酶形式：应激诱导型的HMOX1、组成型的HMOX2及功能尚不明确的HMOX3(Sun et al.,2003)。当细胞和组织处于应激状态时，HMOX1可作为保护性蛋白被诱导，以防御体内由细胞因子介导的细胞损伤(Ryter et al.,2006；Lin et al.,2007；Hachfi et al.,2012)。研究发现在缺氧条件下，不同种属、不同类型的细胞中HMOX1的表达变化不同(李瑶等，2005)，并且在人群中，HMOX1启动子多态性可能降低了HMOX1基因的表达水平(马志明等,2005)，而HMOX1-413A/T位点的多态性可能与HMOX1基因启动子区突变使HMOX1的表达增强(Buis et al,.2008)。

藏绵羊(Ovis aries)是我国三大原始绵羊品种之一，主要分布在我国的青藏高原地区以及与之毗邻的川、甘、滇等高寒牧区，存栏量2500多万只，是青藏高原和中国羊业的主体，由于复杂的地域环境，使藏绵羊在长期进化过程中产生一种非可逆、可遗传的形态结构和生理生化方面的改变过程，从而形成了独特的低氧适应策略来维持自身的氧平衡(Storz et al.,2010；Ding et al.,2014)。目前国内外低氧适应研究主要集中在人的低氧适应的生理生化、分子调控机制以及表观遗传机制领域，对高原动物低氧适应的生理生化和分子遗传机理还缺乏系统研究。

发明内容

为了解决现有技术中存在的问题，本发明选择藏绵羊(高海拔)和湖羊(低海拔)为研究对象，通过测定其血液指标及HMOX1基因遗传多样性，并分析二者之间的关联性，筛选得到藏绵羊适应高原低氧遗传相关的分子标记，为进一步研究藏绵羊高原低氧适应生理机制和分子遗传机制提供基础数据。

本发明提供与藏绵羊高原低氧适应性相关的遗传标记，其位于HMOX1基因上，存在四个优势基因型AA、BB、AB和AC；当藏绵羊的基因型为AA、BB和AC时，藏绵羊高原低氧适应性良好；当藏绵羊的基因型为AB时，藏绵羊高原低氧适应性差；

所述基因型AA，在HMOX1基因c.3691处为C/C，在c.3736处为G/G，在c.3775处为G/G；

所述基因型BB，在HMOX1基因c.3691处为T/T，在c.3736处为A/A，在c.3775处为G/G；

所述基因型AC，在HMOX1基因c.3691处为C/T，在c.3736处为A/G，在c.3775处为G/A；

所述基因型AB，在HMOX1基因c.3691处为C/T，在c.3736处为G/A，在c.3775处为G/G。

本发明提供用于检测权利要求1所述遗传标记的引物对，所述引物对为：

上游引物：GATAGAACGCAACAAGGAGAA

下游引物：CCTGGAGTCGCTGAACATAG。