[发明专利]基于傅里叶变换红外吸收光谱的微生物分型分析方法

权利要求书

1.一种基于傅里叶变换红外吸收光谱的微生物分型分析方法，其特征在于，所述分析方法选择在多糖所在的波数范围900-1200cm^-1进行分析，进而对微生物分型。

2.根据权利要求1所述的基于傅里叶变换红外吸收光谱的微生物分型分析方法，其特征在于，将充分去除培养基的细菌悬浊液涂布在氟化钙晶片上，置于烘箱中，待样品悬浊液烘干后，进行红外吸收光谱的收集，将所得到的谱图进行基线调整、滤波器拟合平滑、一阶导数和二阶导数的获取、有效值严重缺失谱图的剔除、数据归一化、数据的对数转化后进行聚类分析。

3.根据权利2所述的基于傅里叶变换红外吸收光谱的微生物分型分析方法，其特征在于，菌种复苏后，挑选单菌落于LB肉汤培养基中37℃恒温摇床，进行培养得到细菌混合物，去除培养基后得到细菌悬浊液。

4.根据权利2所述的基于傅里叶变换红外吸收光谱的微生物分型分析方法，其特征在于，细菌悬浊液涂布在氟化钙晶片后，烘干，细菌悬浊液在晶片表面形成一层薄膜，固定在晶片上。

5.根据权利2所述的基于傅里叶变换红外吸收光谱的微生物分型分析方法，其特征在于，红外吸收谱图收集时光源选择近红外光，扫描波数范围为500-4000cm^-1，谱图分辨率为4cm^-1，扫描循环数为62，扫描速度为21次每分钟。

6.根据权利2所述的基于傅里叶变换红外吸收光谱的微生物分型分析方法，其特征在于，所述基线调整为：利用数据软件在全谱范围进行背景扣除，然后截取波数范围900-4000cm^-1进行基线调整，将谱图两端调零，同时将将波数范围1800-2800cm^-1采用分段式调至与零位齐平。

7.根据权利2所述的基于傅里叶变换红外吸收光谱的微生物分型分析方法，其特征在于，基线调整后的谱图，对单一谱图采用滤波器拟合平滑，得到原始谱图的一阶导数和二阶导数谱图；然后对所有谱图进行质量筛选，若谱图有效数值缺失比例大于百分之五十，则将该张单一谱移除，而剩余谱图中若出现数值缺失，则用原始数据中最小值的一半代替；处理后的数据，再用四分位间距对数据进行过滤；然后进行分位数归一化处理，同时将数据做对数转化；对处理好的数据，进行划层次聚类分析，达到鉴定和分型的目的。

8.根据权利7所述的基于傅里叶变换红外吸收光谱的微生物分型分析方法，其特征在于，所述划层次聚类为凝聚型层次聚类，先将每个对象视为一个簇，然后以欧氏距离为依据将距离最小的两个簇合并成一个新簇，然后重新计算新簇间的距离，间距离最小的两个簇合并成一个簇，循环直到所有对象都在一个簇中。

9.根据权利1所述的基于傅里叶变换红外吸收光谱的微生物分型分析方法，其特征在于，所述分析方法选择在多糖所在的波数范围900-1185cm^-1进行分析，进而对微生物分型。