[发明专利]一种鉴定水稻低直链淀粉含量基因Wx-hp基因型的分子标记及其应用在审
| 申请号： | 201811357954.2 | 申请日： | 2018-11-15 |
| 公开（公告）号： | CN109207632A | 公开（公告）日： | 2019-01-15 |
| 发明（设计）人： | 刘毅;刘国兰;毕俊国;张安宁;王飞名;孔德艳;王加红;余新桥;罗利军 | 申请（专利权）人： | 上海市农业生物基因中心 |
| 主分类号： | C12Q1/6895 | 分类号： | C12Q1/6895;C12N15/11 |
| 代理公司： | 北京科亿知识产权代理事务所(普通合伙) 11350 | 代理人： | 周倜 |
| 地址： | 200335 *** | 国省代码： | 上海;31 |
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| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 低直链淀粉含量基因 条带 不同基因 分子标记 种鉴定 水稻 水稻基因组DNA 分子标记引物 共显性标记 水稻品质 引物标记 基因型 纯合 等量 扩增 引物 杂合 育种 改良 基因 应用 进程 | ||
1.一种鉴定水稻低直链淀粉含量基因Wx-hp基因型的分子标记，其特征在于：其特异引物序列为
正向外引物Wx-hp-OUT F：5’- TGGATGGATGTGTAATGTTGTGTT -3’
反向外引物Wx-hp-OUT R：5’- TTTGAAGTATGGGTTGTTGTTGAG -3’
正向内引物Wx-hp-IN F：5’- GAGTCGACCGTGTGTTCATAGG -3’
反向内引物Wx-hp-IN R：5’- TCTCCAGGAATGACGGATTGT -3’。
2.根据权利要求1所述的鉴定水稻低直链淀粉含量基因Wx-hp基因型的分子标记，其特征在于：应用于水稻低直链淀粉含量种质资源鉴定和标记辅助选择育种。
3.根据权利要求1所述的鉴定水稻低直链淀粉含量基因Wx-hp基因型的分子标记，其特征在于：用于水稻低直链淀粉含量基因Wx-hp基因型的鉴定包括以下步骤：
i、提取供试水稻样品基因组DNA；
ii、将权利要求1所述的四条分子标记引物Wx-hp-OUT F、Wx-hp-OUT R、Wx-hp-IN F和Wx-hp-IN R加入到同一PCR反应体系，对步骤i中所提取基因组进行PCR扩增，获得扩增产物；
iii、通过2%的琼脂糖凝胶电泳检测所述扩增产物，如果有665bp和382bp的两条特征条带，则表示所述样品为Wx-hp基因纯合；如果有665bp和325bp的两条特征条带，则表示所述样品不含有Wx-hp基因；如果同时存在665bp、382bp和325bp的三条特征条带，则表示所述样品为为Wx-hp基因杂合。
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