[发明专利]一种深度学习的高欠采样超极化气体肺部MRI重建方法有效
申请号: | 201811332971.0 | 申请日: | 2018-11-09 |
公开(公告)号: | CN109410289B | 公开(公告)日: | 2021-11-12 |
发明(设计)人: | 周欣;段曹辉;邓鹤;肖洒;李海东;孙献平;叶朝辉 | 申请(专利权)人: | 中国科学院精密测量科学与技术创新研究院 |
主分类号: | G06T11/00 | 分类号: | G06T11/00;G06T7/11;G06N3/08 |
代理公司: | 武汉宇晨专利事务所(普通合伙) 42001 | 代理人: | 李鹏;王敏锋 |
地址: | 430071 湖*** | 国省代码: | 湖北;42 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 深度 学习 采样 超极化 气体 肺部 mri 重建 方法 | ||
本发明公开了一种深度学习的高欠采样超极化气体肺部MRI重建方法。包括以下步骤:构建构建超极化气体肺部MRI图像训练集,设计级联CNN模型,进行CNN模型训练,根据训练得到的级联CNN模型获得重建图像,本发明利用级联CNN模型,而且在损失函数中加入肺部轮廓信息,能够在高欠采样倍数下得到精确的重建图像,显著地加快成像速度。
技术领域
本发明涉及磁共振成像(Magnetic Resonance Imaging,MRI)、深度学习、欠采样重建等技术领域,具体涉及一种深度学习的高欠采样超极化气体肺部MRI重建方法,适用于加快超极化惰性气体(如129Xe、3He等)肺部MRI的成像速度,并提高成像质量。
背景技术
MRI是一种非侵入、无电离辐射的影像学方法,可以为临床提供高分辨率的结构和功能信息。传统MRI以氢质子为观测对象,而肺部主要由空腔组成,氢质子密度低,因此肺部是传统MRI的盲区。自旋交换光抽运技术可以将惰性气体(如3He、129Xe等)的极化度提高103~105倍,从而使气体肺部MRI成为可能。129Xe在组织和血液中具有较好的溶解性,因此超极化129Xe MRI不仅能够对肺部通气功能和微结构进行成像,还能评价肺部的气-气交换和气-血交换功能,从而为肺部疾病的早期诊断和预后监测提供一种全新手段。
超极化129Xe气体的纵向磁化矢量具有不可恢复性,在采样过程中随射频激发次数呈指数衰减[He Deng et al.Journal of Magnetic Resonance,2016,263:92-100.]。此外,大部分超极化气体MRI方法需要屏气,而较长的屏气时间对肺部疾病患者而言具有很大挑战性,因此迫切需要发展快速成像技术。并行成像、radial和spiral等方法可以加快超极化气体MRI的成像速度,但是这些方法依赖特殊的硬件或序列。基于压缩感知的MRI(称为Compressed Sensing-Magnetic Resonance Imaging,CS-MRI)是一种能够以远低于奈奎斯特采样频率欠采k空间数据从而加快成像速度的技术,无需特定硬件和序列[Sa Xiao etal.Journal of Magnetic Resonance,2018,290:29-37.]。但是,CS-MRI技术也存在一些限制:1)CS-MRI采样轨迹必须满足不相关性准则;2)CS-MRI常用的稀疏变换不足以描述复杂的生物组织结构,例如基于TV的稀疏变换在重建结果中会引入阶梯伪影,小波变换可能会引起块状伪影;3)CS-MRI的非线性重建算法涉及迭代计算,需要较长的重建时间;4)超参数的选择对CS-MRI的重建效果有很大影响,不合适的超参数会造成重建结果过平滑或存在残留的欠采样伪影。
近年来深度学习在图像分类、语音识别、图像复原、超分辨率重建等领域取得很大进展。深度学习尤其是卷积神经网络(Convolutional Neural Networks,CNN)也被用于MRI欠采样重建领域[Taejoon Eoet al.IEEE Transactions on Medical Imaging,2018,80:2188-2201.]。基于深度学习的欠采样重建通过训练CNN学习欠采样图像和参考图像(通常将全采样图像作为参考图像)之间的非线性关系。相比于CS-MRI,基于深度学习的MRI欠采样重建方法在重建速度、图像质量、加速倍数等方面具有显著优势。目前基于深度学习的MRI欠采样重建主要以脑部、膝关节等MRI的图像为研究对象,原因是这类图像具有高分辨率、高信噪比、数据量大等优势,可以为深度学习训练提供高质量的参考图像。然而,因超极化气体纵向磁化矢量不可再生(随激发次数和激发时间快速衰减),导致超极化气体MRI的图像易受噪声和伪影影响,信噪比低,易丢失细节信息等。这使得将深度学习推广应用于超极化气体MRI欠采样重建面临很大困难。
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