[发明专利]一种用于检测淋巴瘤、淋巴转移癌良恶性程度的分级模型及其应用

说明书

本发明涉及一种用于检测淋巴瘤、淋巴转移癌的分级模型及其应用，所述模型通过计算印记基因缺失表达量、印记基因拷贝数异常表达量和印记基因总表达量对印记基因在淋巴瘤和淋巴转移癌中的变化进行分级。本发明所述检测模型和装置，以直观的方法表现了印记缺失在淋巴瘤和癌症淋巴转移病人的组织和细胞样本上的表现，通过对印记基因原位标记的方法，客观、直观、早期、精确地检测出印记(迹)基因的变化，并可以提供量化的模型，为淋巴瘤和淋巴转移癌的诊断做出巨大贡献。

技术领域

本发明涉及生物技术领域，涉及基因诊断领域，涉及一种分级模型及其应用，涉及一种用于检测淋巴瘤、淋巴转移癌良恶性程度的分级模型及其应用，具体涉及一组印记基因在检测淋巴瘤、淋巴转移癌良恶性程度的分级模型及其组成的装置。

背景技术

淋巴瘤是起源于淋巴造血系统的恶性肿瘤，主要由病毒感染、免疫缺陷、电离辐射和化学药物等原因引起，好发于20-40岁的青壮年。2012年恶性淋巴瘤全球新增病例38.6万例，死亡20.0万例，中国新诊断病例约8.8万例，死亡5.2万例，并且近年来仍然在以每年4％的速度增长。淋巴瘤可以发生在人体的任何部位，早期症状仅为无痛性淋巴结肿大，容易被病人忽略，也容易与感染引起的反应性淋巴结增生混淆。由于淋巴瘤是一大类异质性很高的肿瘤的集合，按照WHO的病理分类标准，可以分为上百种类型，各种分型之间在病理表现和预后都具有很大的差异，因此淋巴瘤的诊断和治疗都比较困难。淋巴瘤总体上可以分为高度侵袭性、中等侵袭性和惰性淋巴瘤，高度侵袭性的淋巴瘤5年生存率通常不到30％，而某些类型的惰性淋巴瘤5年生存率可以达到90％，一些中等侵袭性的淋巴瘤如果能够早期发现和治疗，生存期可以达到5-10年甚至更长，因此开发一种准确率更高的恶性淋巴瘤早期检测技术具有重大意义。

除淋巴瘤外，淋巴结肿大也可能由癌症转移引起，肺癌、乳腺癌、食道癌、甲状腺癌、结直肠癌和膀胱癌等多种癌症都会发生淋巴转移。目前病理上判断淋巴结中是否有转移的癌细胞通常是依据形态观察，但是在癌转移的早期，淋巴结中癌细胞的数量还较少，通过形态观察可能会遗漏，因此开发一种准确鉴别淋巴结中是否有癌细胞转移的技术，可以帮助医生确定手术切除范围和淋巴结清扫范围，并知道后续治疗方案的选择，对降低手术后的复发率、延长生存期具有重大意义。

传统病理学对细胞的良恶性诊断是基于细胞的大小，形态，浸润性和周边细胞组织的关系来作出判断的。它对细胞(癌症)的早期变化的发现有很大的局限性，因此细胞分子水平的癌症诊断方法，一度成为研究热点。随着人们在分子生物学领域的不断深入研究，越来越多的分子检测技术被运用到癌症诊断中。

癌症的产生是随时间推移而累积的表观遗传改变和基因上的变异所导致的不受控制的细胞生长/分裂。传统病理学诊断根据细胞和组织的大小，形态和结构上的变异，从而做出淋巴瘤良恶性判断。随着分子生物学的发展与深入，越来越多的分子检测技术被应用于恶性淋巴瘤症的检测。从癌症的发展过程分析，分子层面的改变(表观遗传学和基因学)远早于细胞形态和组织结构的变异。所以分子生物学检测对癌症早期的检测更敏感。

基因组印记是表观遗传学中基因调控的一种方式。其特点是，通过甲基化来自特定亲代的等位基因，使某个基因只有一个等位基因表达，而另一个则陷入基因沉默状态。该种类的基因，被称为印迹(记)基因。印迹缺失是印迹基因去甲基化导致沉默状态的等位基因被激活并且开始基因表达的一种表观遗传改变。大量研究表明，该现象(印迹缺失)普遍存在于各类癌症并且发生时间早于细胞和组织形态改变。与此同时，在健康细胞中，印迹缺失比例极低，与癌细胞成鲜明对比。所以，印迹基因的甲基化状态可以作为病理标记，通过特定分子检测技术，对细胞异常状态进行分析。

基于上述原因，目前的恶性淋巴瘤诊断需要新的检测系统和检测模型，基于患者活检样本，解析恶性淋巴瘤在细胞层面上存在的分子标记物变化，以此提供更精确的预诊和诊断信息。

发明内容