[发明专利]一种尿液游离DNA提取试剂盒及提取方法在审
申请号: | 201811259276.6 | 申请日: | 2018-10-26 |
公开(公告)号: | CN109207476A | 公开(公告)日: | 2019-01-15 |
发明(设计)人: | 王煜;李佩;洪梅;罗喜鹏;王龙;周甘霖;张青 | 申请(专利权)人: | 王煜 |
主分类号: | C12N15/10 | 分类号: | C12N15/10 |
代理公司: | 北京轻创知识产权代理有限公司 11212 | 代理人: | 杨立;徐苏明 |
地址: | 410000 湖南省长沙市高新区谷苑*** | 国省代码: | 湖南;43 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 游离DNA 洗涤液 乙醇 尿液 表面活性剂 金属螯合剂 提取试剂盒 裂解液 试剂盒 胍盐 氯化钠 选择性提取 核酸片段 提取效率 洗脱液 醇类 磁珠 羟基 | ||
1.一种尿液游离DNA提取试剂盒,其特征在于,包括裂解液、洗涤液A、洗涤液B、洗脱液和羟基磁珠;
所述裂解液包括胍盐、金属螯合剂、表面活性剂、醇类、Tris-HCl和氯化钠;
所述洗涤液A包括胍盐、金属螯合剂、表面活性剂、乙醇和Tris-HCl,所述乙醇的体积浓度为30%~40%;
所述洗涤液B包括金属螯合剂、表面活性剂、乙醇和Tris-HCl,所述乙醇的体积浓度为75%~85%。
2.根据权利要求1所述的一种尿中游离DNA提取试剂盒,其特征在于,所述胍盐选自盐酸胍和异硫氰酸胍中的一种或两种,所述金属螯合剂选自乙二胺四乙酸、乙二胺四乙酸二钠和乙二胺四乙酸二钾中的一种或多种;所述表面活性剂选自Triton X-100、Tween-20、NP-40、脱氧胆酸钠和十二烷基硫酸钠中的一种或多种,所述醇类为乙醇和异丙醇中的任一种或两种。
3.根据权利要求2所述的一种尿液游离DNA提取试剂盒,其特征在于,所述胍盐为异硫氰酸胍,所述金属螯合剂为乙二胺四乙酸,所述表面活性剂为Triton X-100,所述醇类为异丙醇。
4.根据权利要求1所述的一种尿液游离DNA提取试剂盒,其特征在于,所述裂解液中胍盐、金属螯合剂、表面活性剂、醇类、Tris-HCl和氯化钠的工作浓度分别为3~5M、20~30mM、4%~6%(v/v)、30%~50%(v/v)、40~60mM和90~110mM,所述裂解液的pH值为7.0~8.0;所述洗涤液A中胍盐、金属螯合剂、表面活性剂和Tris-HCl的工作浓度分别为2.5~3.5M、0.5~1.5mM、0.8%~1.2%(v/v)和8~12mM,所述洗涤液A的pH值为7.0~8.0;所述洗涤液B中金属螯合剂、表面活性剂和Tris-HCl的工作浓度分别为0.5~1.5mM、0.08%~0.12%(v/v)和8~12mM,所述洗涤液B的pH值为7.0~8.0。
5.根据权利要求1所述的一种尿液游离DNA提取试剂盒,其特征在于,所述洗脱液中含有0.4~0.6mM的EDTA和8~12mM的Tris-HCl,所述洗脱液的pH为7.5~8.5。
6.根据权利要求1所述的一种尿液游离DNA提取试剂盒,其特征在于,所述羟基磁珠为表面修饰有硅羟基的超顺磁性纳米微球,所述羟基磁珠以磁珠混悬液的形式存在,所述羟基磁珠的浓度为40~60mg/mL。
7.根据权利要求1-6任一项所述的一种尿液游离DNA提取试剂盒,其特征在于,所述试剂盒还包括蛋白酶K。
8.一种尿液游离DNA的提取方法,其特征在于,采用权利要求1-7任一项所述的试剂盒进行提取,包括以下步骤:
(a)将尿液样品进行预处理,然后加入裂解液和羟基磁珠,上下颠倒混匀,孵育;
(b)磁力吸附,待羟基磁珠完全吸附时去除液体;
(c)加入洗涤液A,悬浮,磁力吸附,待羟基磁珠完全吸附时去除液体;
(d)加入洗涤液B,悬浮,磁力吸附,待羟基磁珠完全吸附时去除液体;
(e)重复步骤(d),并去除残留的乙醇;
(f)加入洗脱液,重新悬浮,孵育,期间晃动使核酸充分洗脱;
(g)磁力吸附,待羟基磁珠完全吸附时将核酸溶液转移,得到游离DNA提取液。
9.根据权利要求8所述的尿液游离DNA的提取方法,其特征在于,步骤(a)中加入蛋白酶K。
10.根据权利要求9所述尿液游离DNA的提取方法,其特征在于,步骤(a)中,所述裂解液的添加体积为预处理后尿液样品体积的1~2倍,以每mL预处理后的尿液样品计,蛋白酶K的添加量为1~3mg,羟基磁珠的添加量为0.15~1mg,孵育时间为30min,孵育时,上下颠倒混匀;步骤(c)中,所述洗涤液A的添加体积为预处理后尿液样品体积的0.3~0.5倍;步骤(d)中所述洗涤液B的添加体积为预处理后尿液样品体积的0.3~0.5倍;所述步骤(c)和步骤(d)中的悬浮为:涡旋使羟基磁珠充分悬浮;所述步骤(c)和步骤(d)中的去除液体为:吸弃液体,并离心去除容器内壁的液滴;步骤(f)中,所述洗脱液的添加体积为预处理后尿液样品体积的2%-5%,所述孵育的温度为55℃~58℃,孵育时间为5~10min。
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