[发明专利]用于穿山甲亲子鉴定的SSR荧光标记引物及应用有效

专利信息
申请号: 201811220793.2 申请日: 2018-10-19
公开(公告)号: CN109182546B 公开(公告)日: 2021-11-30
发明(设计)人: 陈金平;李慧明;李林妙;晋学君 申请(专利权)人: 广东省科学院动物研究所
主分类号: C12Q1/6888 分类号: C12Q1/6888;C12Q1/686;C12N15/11
代理公司: 广州科粤专利商标代理有限公司 44001 代理人: 刘明星;朱聪聪
地址: 510260 广东*** 国省代码: 广东;44
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摘要:
搜索关键词: 用于 穿山甲 亲子鉴定 ssr 荧光 标记 引物 应用
【权利要求书】:

1.用于穿山甲亲子鉴定的SSR荧光标记引物,其特征在于,所述引物为:

M13MJ-F2 F: TTTCATACCGGGAAGTCCAC; R: ATGGTCCTAACACCACGGAG;

M13MJ-F3 F: CACCTGCATGTACCCCTTTT; R: CCCCCTCAAAATACCACCTT;

M13MJ-F4 F: GAGAGAAAGGGGAAAATCGG; R: TGATAGGATGTGAGGAGGGG;

M13MJ-F5 F: TGGGGTCTGCTGTTTTCATT; R: CTCCCTCTGTAGGTTGCCCT;

M13MJ-F7 F: AGAAGTGATTTGCACCCCTG; R: CAGTGGCCAGAATGGAGATT;

M13MJ-F8 F: GTCATGCATGGAAGACAGGA; R: GTCTGGCTGAAATGGAAAGG;

M13MJ-F9 F: CCCTATGAGGTGGGCACTAA; R: AACTCCATCAAAGGTGTGGC;

M13MJ-F10 F: CCCAGATCCAAAATGAATGG; R: TGCTGATGTTCACTCTTGCC;

M13MJ-F11 F: ATCCACCTAGGAACCTCAGC; R: GACTCTTCGGGATTTCACACA;

M13MJ-F12 F: ATCCACCTAGGAACCTCAGC; R: GACTCTTCGGGATTTCACACA;

M13MJ-F16 F: TTCCCTTCATCTGTTTTGCC; R: CAGCACTGCCAAGGTCTGTA;

M13MJ-F17 F: GTAATGGGGTATGTGGTGGG; R: TCCCTGTTCAAACGGAATTT;

M13MJ-F20 F: CAGTGCTCATCACATAGCAGG; R: CATGCCTAGTGTTTCACGTTG

M13MJ-F24 F: TTCAGCCAGGGTCTCTCAGT; R: TGGGGTTTTTCCTCAATCTG;

M13MJ-F25 F: CCAGAGAAAGGTAGGAGCCA; R: TCCAGAAAACAGACCCAAGG。

2.权利要求1所述的引物在穿山甲亲子鉴定中的应用。

3.权利要求1所述的引物在制备穿山甲亲子鉴定试剂盒中的应用。

4.一种穿山甲亲子鉴定的方法,其特征在于,包括以下步骤:

A、合成权利要求1引物对正向5’端加M13接头的正向引物,所述的M13接头序列为CACGACGTTGTAAAACGAC;合成通用引物M13的正向5’端添加荧光基团的正向引物;所述的通用引物M13的正向引物序列为CACGACGTTGTAAAACGAC;

B、提取穿山甲DNA作为模板,使用权利要求1引物对正向5’端加M13接头的正向引物、反向引物、通用引物M13的正向5’端添加荧光基团的正向引物,进行PCR扩增,对PCR产物进行基因型判定,采用Cervus软件计算等位基因数,观测杂合度与期望杂合度,哈迪温伯格平衡检验,多态信息含量、单独排除率和累积排除率,根据基因型分析结果联合使用排除法与似然法进行亲子关系的鉴定。

5. 根据权利要求4所述的穿山甲亲子鉴定的方法,其特征在于,所述的PCR扩增程序采用降落PCR,具体条件为:95 ℃预变性10 min;95 ℃变性15 s;退火温度30 s从62至52 ℃,每2个循环降退火温度2 ℃,72 ℃延伸2 min;95 ℃变性15 s;52 ℃退火温度30 s;72 ℃延伸2 min;30个循环; 72 ℃延伸10 min。

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