[发明专利]一种利用CDDP标记构建重楼属植物指纹图谱的方法在审
| 申请号: | 201811182101.X | 申请日: | 2018-10-11 |
| 公开(公告)号: | CN109055603A | 公开(公告)日: | 2018-12-21 |
| 发明(设计)人: | 周武先;卢超;由金文;张美德;何银生;段媛媛;程天周 | 申请(专利权)人: | 湖北省农业科学院中药材研究所;恩施程丰农业综合开发有限公司 |
| 主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12Q1/6858 |
| 代理公司: | 西安嘉思特知识产权代理事务所(普通合伙) 61230 | 代理人: | 刘长春 |
| 地址: | 445000 湖北省恩施*** | 国省代码: | 湖北;42 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 重楼属植物 指纹图谱 多态性引物 标记构建 重楼属 分子生物学技术 遗传多样性分析 筛选 种质资源鉴定 基因组DNA 电泳检测 发育阶段 核心引物 形态鉴定 常规的 构建 可用 参考 检测 | ||
1.一种利用CDDP标记构建重楼属植物指纹图谱的方法,其特征在于,包括重楼属植物基因组DNA的提取与检测;CDDP多态性引物的筛选;利用筛选的CDDP多态性引物对重楼属植物进行PCR扩增与电泳检测;选取核心引物构建重楼属植物的CDDP指纹图谱。
2.根据权利要求1所述利用CDDP标记构建重楼属植物指纹图谱的方法,其特征在于,包括步骤:
1)采集重楼属植物,提取重楼属植物基因组DNA,并检测基因组DNA的完整性和浓度;
2)选取两种重楼属植物的基因组DNA进行CDDP多态性引物的筛选;
3)利用筛选的CDDP多态性引物对重楼属植物进行PCR扩增与电泳检测;
4)从CDDP多态性引物中选取核心引物,构建重楼属植物的CDDP指纹图谱。
3.根据权利要求2所述利用CDDP标记构建重楼属植物指纹图谱的方法,其特征在于,在步骤1)中,所采集的重楼属植物资源包括七叶一枝花(Paris polyphylla)、狭叶重楼(P.polyphylla var.stenophylla)、华重楼(P.polyphylla var.chinensis)、金线重楼(P.delavayi)、长药隔重楼(P.polyphylla var.thibetica)、球药隔重楼(P.fargesii)、短瓣球药隔重楼(P.fargesii var.brevipetalata)、白花重楼(P.palyphylla var.alba)、宽瓣球药隔重楼(P.fargesii var.latipetala)、滇重楼(P.palyphylla var.yunnanensis)、黑籽重楼(P.thibetica)、无辦黑籽重楼(P.var.apetala)、具柄重楼(P.fargesiivar.petiolata)。
4.根据权利要求2所述利用CDDP标记构建重楼属植物指纹图谱的方法,其特征在于,在步骤2)中,所选择的两种重楼属植物为华重楼(P.polyphylla var.chinensis)、长药隔重楼(P.polyphylla var.thibetica)。
5.根据权利要求2所述利用CDDP标记构建重楼属植物指纹图谱的方法,其特征在于,在步骤3)中,CDDP-PCR扩增的反应体系为:20μl反应体系中包含10.5μL 2×Taq Master Mix,5.4μL 2.5μmol·L-1的引物,1.8μL的DNA(50ng·μL-1),加灭菌ddH2O补齐体积至20μL;
CDDP-PCR扩增程序为:94℃,5min;然后94℃,0.5min,45-55℃,1min,72℃,1.5min,40个循环;循环结束后72℃再延伸10min。
6.根据权利要求2所述利用CDDP标记构建重楼属植物指纹图谱的方法,其特征在于,在步骤4)中,选取3个核心引物构建重楼属植物的CDDP指纹图谱。
7.根据权利要求6所述利用CDDP标记构建重楼属植物指纹图谱的方法,其特征在于,所述3个核心引物的信息分别为:序列5′-ACSCCSATCCACCGG-3′,退火温度45.0℃;序列5′-CACGAGGACCTSCAGG-3′,退火温度45.9℃;序列5′-CACTACCGCGGSCTSCG-3′,退火温度51.5℃。
8.根据权利要求2所述利用CDDP标记构建重楼属植物指纹图谱的方法,其特征在于,在步骤4)中,利用筛选的核心引物对重楼属植物资源的基因组DNA进行PCR扩增,统计条带的有无,以重楼属植物编号为横行,分子量大小为纵行,有带标记为实心黑色方框,无带标记为空白方框,构建重楼属植物的CDDP指纹图谱。
9.权利要求1所述利用CDDP标记构建重楼属植物指纹图谱的方法在重楼属种质资源鉴定、遗传多样性分析中的应用。
10.根据权利要求9所述应用,其特征在于,用于鉴定未知重楼属植物时,首先按权利要求1所述方法构建未知重楼属植物的CDDP指纹图谱的构建,将其与按权利要求1所述方法已构建的CDDP指纹图谱进行比对分析,当CDDP指纹图谱吻合度达到95%时,判定是同一种;当CDDP指纹图谱介于90%-95%时,判定为是近缘种;当CDDP指纹图谱吻合度低于90%时,判定不属于已知重楼属植物。
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