[发明专利]用于牦牛亲权鉴定的SSR分子标记、引物组及其应用

说明书

本发明提供了一种用于牦牛亲权鉴定的SSR分子标记、引物组及其应用，涉及亲权鉴定术领域。该用于牦牛亲权鉴定的SSR分子标记包含scaffold2072、scaffold341和scaffold1139三个位点，在给定候选双亲基因型，排除候选双亲的条件下，累计非父排除概率可达到99％，缓解了现有技术中存在的缺乏牦牛亲权鉴定分子标记的技术问题。该引物组用于扩增上述SSR分子标记，可特异性的扩增出SSR分子标记中的各位点，具有良好的特异性。

技术领域

本发明涉亲权鉴定术领域，尤其是涉及一种用于牦牛亲权鉴定的SSR分子标记、引物组及其应用。

背景技术

素有“高原之舟”美誉的牦牛，是唯一适应青藏高原特殊生态环境的牛种，是我国高原人民群众的重要生产和生活资料。能为牧民提供奶、肉、毛、役力、燃料等生产和生活必需品，是西部少数民族地区畜牧业经济中不可缺少的重要畜种。我国现有牦牛1 400多万头，主要分布在以青藏高原为中心的青海、西藏、四川、甘肃、云南、新疆等地的藏族同胞聚居区。其饲养方式还保持着原始的纯天然放牧方式。

牦牛的饲养主要为野外放牧，公母畜之间的繁殖交配并不是在牧民计划下的选种选配，而是仍停留在自然交配的水平上。全年中的大部分时间，牦牛被放牧在草原上。公母牛混养，没有准确的交配记录，不能判断新生牛犊父权归属、也不清楚牦牛个体之间的亲缘关系以及是否存在近交等，给牦牛的保种和选育带来很大困难。这就迫切的需要一种实用的亲权鉴定方法来解决这些问题。

以微卫星标记为基础的亲权鉴定技术是目前动物亲权鉴定中应用最为广泛最可靠的手段之一。但是目前有关于牦牛亲权鉴定的研究十分少见。

有鉴于此，特提出本发明。

发明内容

本发明的第一目的在于提供一种用于牦牛亲权鉴定的SSR分子标记，该分子标记可以有效的鉴定牦牛亲本和子代的亲权关系。

本发明的第二目的在于提供一种用于扩增上述SSR分子标记的引物组，可成功扩增出上述用于牦牛亲权鉴定的SSR分子标记。

本发明的第三目的在于提供一种用于牦牛亲权鉴定的试剂盒，该试剂盒包含上述用于牦牛亲权鉴定的SSR分子标记。

本发明的第四目的在于提供一种牦牛亲权鉴定的方法。

本发明的第五目的在于提供一种上述用于牦牛亲权鉴定的SSR分子标记、上述用于扩增上述SSR分子标记的引物组、上述用于牦牛亲权鉴定的试剂盒或上述牦牛亲权鉴定的方法的应用。

为解决上述技术问题，本发明特采用如下技术方案：

本发明提供了一种用于牦牛亲权鉴定的SSR分子标记，所述SSR分子标记包括scaffold2072、scaffold341和scaffold1139；具有如下表所示的位点信息：

优选地，所述SSR分子标记还包括scaffold879、scaffold2036、scaffold2058、scaffold1000、scaffold1649、scaffold4112、scaffold506、scaffold1645、scaffold2687、scaffold1210、scaffold547、scaffold1214、scaffold1343、scaffold1141、scaffold94、scaffold738和scaffold629中的一个或多个位点；具有如下表所示的位点信息：

优选地，所述SSR分子标记还包括scaffold879。

优选地，所述SSR分子标记还包括scaffold2036、scaffold2058、scaffold1000和scaffold1649中的一个或几个位点；