[发明专利]一种罗非鱼细小病毒TiPV LAMP检测引物及应用有效
申请号: | 201811121683.0 | 申请日: | 2018-09-26 |
公开(公告)号: | CN109234452B | 公开(公告)日: | 2020-06-19 |
发明(设计)人: | 刘文枝;曾令兵;范玉顶 | 申请(专利权)人: | 中国水产科学研究院长江水产研究所 |
主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12Q1/6844;C12N15/11;C12R1/93 |
代理公司: | 武汉宇晨专利事务所 42001 | 代理人: | 龚莹莹 |
地址: | 430223 湖北省武*** | 国省代码: | 湖北;42 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 一种 罗非鱼 细小 病毒 tipv lamp 检测 引物 应用 | ||
本发明属于病毒检测领域,具体公开了一种罗非鱼细小病毒LAMP检测引物及应用,发明人从患病罗非鱼成鱼中分离出了一种细小病毒,该病毒为罗非鱼细小病毒(Tilapia parvovirus)TiPV,保藏编号为:CCTCC NO:V201856,对于罗非鱼细小病毒的研究具备开拓性的意义。针对该病毒特异性序列设计引物,可对罗非鱼细小病毒进行检测,该引物的特异性好,灵敏度高。
技术领域
本发明属于病毒分子检测技术领域,具体涉及一种罗非鱼细小病毒TiPV LAMP检测引物及应用。
技术背景
细小病毒(Parvovirus)是目前为止发现的最小的单股DNA病毒,病毒粒子直径为18~30nm的二十面体,无囊膜,等轴对称。细小病毒在自然界分布极广,可以感染人、脊椎动物及无脊椎动物,并与多种疾病相关。其中人类细小病毒B19(Human parvovirus B19,B19)为人所熟知,能引起幼儿一系列严重的自身免疫性疾病,孕期感染会导致胎儿水肿、流产或先天性感染,对新生儿及幼儿危害较大,引起了世界范围的广泛关注。因此,对细小病毒进行深入研究具有重要意义。此外,细小病毒还能引起家畜多种急性传染病,如犬细小病毒,猪博卡病毒,鹅细小病毒病等。国际病毒分类委员会(International Committee on Taxonomy of Viruses,ICTV)于2014年发表了最新的病毒分类报告,将细小病毒科(Pavoviradae)划分为8个属:Amdoparvovirus、Aveparvovirus、Bocaparvovirus、Copiparvovirus、Dependo parvovirus、Erythroparvovirus、Protoparvovirus、Tetraparvovirus。目前划分的细小病毒属中未出现鱼类感染细小病毒的相关报道,本申请专利中新鉴定的罗非鱼细小病毒属于新病毒,造成我国罗非鱼在短时间内大量死亡,对我国罗非鱼的养殖和出口带来巨大的经济损失。
本申请人曾在罗非鱼中分离过细小病毒,但该病毒未使得罗非鱼有明显发病症状;而本发明公开的细小病毒可致罗非鱼眼珠、鳃盖、下颌和腹部有明显的出血症状。因此基于本发明提供的病毒及其设计的检测引物更具备实际意义,对监测养殖罗非鱼的健康状况显得尤为重要。
发明内容
本发明的目的在于提供了一种罗非鱼细小病毒TiPV的特异性基因,所述的基因为SEQ ID NO.1所示,利用该基因与其他病毒的基因差异设计的引物,可用于检测罗非鱼细小病毒TiPV,所述的罗非鱼细小病毒TiPV的保藏编号为CCTCC NO:V201856。
本发明的另一个目的在于提供了基于SEQ ID NO.1所示序列设计的LAMP引物,所述的引物为F3:5'-CAACTAAAGACCCGGTTCC-3',B3:5'-GCCTTGGTAGCGTAAGTTCA-3';FIP:5'–GCTATCTCCTCGTTGCTCGGTG-ATCCAGCAATTCCGGAGACA-3',BIP:5'-AGGACGGCCCGGAAGTACTG-TCAAATCCGAGCTGTGTAGC-3'。
本发明的最后一个目的在于提供了利用包括SEQ ID NO.1所示多核苷酸,或者基于SEQ ID NO.1所示多核苷酸设计的引物在制备成罗非鱼细小病毒检测试剂盒中的应用。
为了达到上述目的,本发明采取以下技术措施:
一种罗非鱼细小病毒TiPV的特异性基因,所述基因为SEQ ID NO.1所示,所述的罗非鱼细小病毒TiPV的保藏编号为CCTCC NO:V201856。
基于该基因与其他病毒的基因差异设计的引物也属于本发明的保护范围。
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