[发明专利]位于白菜A04染色体上的抗霜霉病基因BrRLP48及与其相连锁的SNP标记

说明书

本发明公开了位于白菜A04染色体上的抗霜霉病基因BrRLP48及与其相连锁的SNP标记。本发明利用白菜抗病自交系“MM”和感病自交系“白阳”的DH群体和F₂群体在白菜第4号染色体上成功定位到与白菜霜霉病抗性相关的QTL位点Br‑DM04，可以解释22.3％的表型变异，并找到抗霜霉病基因及与其连锁的SNP分子标记A04_5326733。基于KASP技术的分子标记A04_5326733可用于白菜霜霉病抗性品种鉴定及分子育种。

技术领域

本发明属于生物技术领域，具体涉及位于白菜A04染色体上的抗霜霉病基因BrRLP48及 与其相连锁的SNP标记。

背景技术

大白菜原产我国，是我国栽培面积最大的蔬菜作物，目前已逐渐成为世界性的蔬菜作物。 据农业部统计，我国大白菜年种植面积近4000万亩，占全国蔬菜总播种面积的15％左右，可 见大白菜在我国菜篮子工程中举足轻重。植物病害是影响植物正常生长重大威胁之一。尤其 在农业生产中，病害会直接影响农作物的产量和质量。霜霉病是由专性寄生霜霉菌 (Hyaloperonosporaparasitica)引起的真菌病害，是危害大白菜的三大病害(病毒病、霜 霉病和软腐病)之一，该病流行范围广、发病速度快，对白菜的产量和品质造成严重影响， 流行年份发病率高达80-90％，减产30-50％。生产中通常使用杀菌剂进行霜霉病防治，不仅 增加了生产成本，造成环境污染，还可能引起霜霉菌生理小种的变异及病原菌的抗药性。因 此，霜霉病抗性品种的培育成为降低病害损失的最安全高效的方法之一。

遗传学研究表明，白菜霜霉病抗性是一个复杂的数量性状，涉及多种抗病基因，依靠传 统的育种方法获得抗病白菜的周期较长。随着分子生物学的发展，分子辅助育种技术可以在 早世代进行准确、稳定的选择，从而加速育种进程，提高育种效率，但该技术的基础是必须 具有优良的目标基因及与其紧密连锁的分子标记。

发明内容

本发明的第一个目的是提供检测白菜基因组中A04_5326733位点的多态性或基因型的物 质或A04_5326733位点的新用途。

本发明提供了检测白菜基因组中A04_5326733位点的多态性或基因型的物质或A04_5326733位点在如下(1)-(6)任一中的应用：

(1)鉴定或辅助鉴定白菜霜霉病抗性；

(2)筛选或辅助筛选抗霜霉病的白菜品种；

(3)白菜育种；

(4)制备鉴定或辅助鉴定白菜霜霉病抗性的产品；

(5)制备筛选或辅助筛选抗霜霉病的白菜品种的产品；

(6)制备白菜育种的产品；

所述A04_5326733位点为白菜基因组中序列1自5’端起第101位核苷酸，A04_5326733 位点为T/A多态。

上述应用中，所述检测白菜基因组中A04_5326733位点的多态性或基因型的物质包括由 引物1、引物2和引物3所组成的引物组；

所述引物1为如下a1)或a2)：

a1)序列2所示的单链DNA分子；

a2)将a1)限定的单链DNA分子进行一个或几个碱基的缺失、插入和/或改变得到的与 a1)限定的单链DNA分子具有相同功能的单链DNA分子；

所述引物2为如下b1)或b2)：

b1)序列3所示的单链DNA分子；

b2)将b1)限定的单链DNA分子进行一个或几个碱基的缺失、插入和/或改变得到的与 b1)限定的单链DNA分子具有相同功能的单链DNA分子；

所述引物3为如下c1)或c2)：