[发明专利]一种AHNAK2基因在作为结直肠癌干细胞标记物中的应用及试剂盒

说明书

本发明公开了一种AHNAK2基因在作为结直肠癌干细胞标记物中的应用及试剂盒，所述试剂盒包括用于检测结直肠癌干细胞标记物的探针，其中探针由序列为SEQ ID No.1或SEQ ID No.2的核苷酸片段制备得到。本发明中肠癌干细胞特异性突变基因AHNAK2在Chr14:105410531和Chr14：105410533的异常与肠癌的发生密切相关，因此两个突变位点可以应用于结直肠癌干细胞标记物，用于辅助诊断结直肠癌，对于直肠癌的诊断具有非常重要的意义，而且本发明中尤其Chr14：105410533AT突变对应的S3753P位点所在的新生抗原亲和力高，HLA‑I覆盖度高，且AHNAK2在细胞表面表达。

技术领域

本发明属于医疗技术领域，具体涉及一种AHNAK2基因在作为结直肠癌干细胞标记物中的应用及试剂盒。

背景技术

结直肠癌是最常见的恶性肿瘤之一，全球每年新发病人约八百万，占所有恶性肿瘤的10％～15％，其发病率和死亡率居恶性肿瘤的第三位。

结直肠癌目前，主要采用外科手术和放射的综合治疗，含有5-Fu的联合化疗，以及与传统放化疗结合的免疫治疗等。但是总体治疗效果差，复发转移率高且肿瘤治疗副作用大、精准性差。其中结直肠癌的发生与饮食、环境、遗传等密切相关，是多因素协同作用的结果。结直肠癌的防治研究引起人们的高度重视，生物标志物的发现与检测，对预测结肠癌的发生、发展、治疗效果及顸后判断有一定的临床指导意义。

结直肠癌干细胞(colorectal cancer stem cells,CRCSCs)是癌组织中一小部分增殖缓慢、具有自我更新和多向分化能力的干细胞样肿瘤细胞；是肠癌发生、转移复发和治疗抵抗等恶性生物学行为的根源。探明CRCSCs的特异性突变基因，将其作为进一步的准确的分子标志物，有利于更好的识别和控制肠癌干细胞，有利于精准治疗，从而可以制定合理的治疗方案，采取有针对性的干预措施，提高生存率等方面都至关重要。

发明内容

为了解决上述问题，本发明提供了一种AHNAK2基因在作为结直肠癌干细胞标记物中的应用，用于辅助诊断结直肠癌。

本发明的技术方案为：一种AHNAK2基因在作为结直肠癌干细胞标记物中的应用。

本发明发现在结直肠癌患者的癌细胞表面蛋白AHNAK2基因两个突变位点(Chr14:105410531AG和Chr14：105410533AT)中至少一个的突变，而在普通肿瘤细胞中未发现AHANK2基因在相同位点处突变。而且本发明发现AHNAK2基因的这两个突变位点位于第7个外显子区域，对应氨基酸为V3752D和S3753P，属于第4个TamB和第5个TamB连接的中间区域。

由上述可知，本发明可以将上述AHNAK2基因可以应用于作为结直肠癌干细胞标记物，可以应用于辅助诊断结直肠癌。

本发明还提供了一种用于制备检测结直肠癌干细胞标记物的探针的核苷酸片段，所述核苷酸片段为SEQ ID No.1或SEQ ID No.2。

本发明中的探针用于检测AHNAK2(Chr14:105410531和Chr14:105410533)的位点。本发明可以选取AHNAK2基因“Chr14:105404389-105421146”和“Chr14:105404367-105421167”的序列通过设计网站设计得到探针，例如本发明可以于Agilent在线panel设计网站(https://earray.chem.agilent.com/suredesign/index.htm？sessiontimeout＝true)设计探针。AHNAK2基因“Chr14:105404389-105421146”和“Chr14:105404367-105421167”的序列设计得到的探针均可用于检测Chr14:105410531和Chr14:105410533的位点。

本发明还提供了一种用于检测结直肠癌干细胞标记物的基因芯片，包括上述的探针。