[发明专利]用于检测人类EGFR基因T790M突变的引物、检测方法及试剂盒在审
申请号: | 201811044900.0 | 申请日: | 2018-09-07 |
公开(公告)号: | CN109306379A | 公开(公告)日: | 2019-02-05 |
发明(设计)人: | 陈渊能;何浪平;陈韵姿 | 申请(专利权)人: | 广州健天基因技术有限公司 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;C12N15/11 |
代理公司: | 广州市南锋专利事务所有限公司 44228 | 代理人: | 张小黎 |
地址: | 510663 广东省广州市高新技术产业*** | 国省代码: | 广东;44 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 突变 检测 试剂盒 人类EGFR基因 荧光信号 扩增 引物 等位基因特异性 实时荧光PCR 超灵敏检测 特异性结合 野生型序列 保守序列 非特异性 检测引物 扩增片段 突变位点 突变序列 准确检测 灵敏度 野生型 阻断剂 检出 样本 | ||
1.用于检测人类EGFR基因T790M突变的检测方法,包括以下步骤:将用于检测人类EGFR基因T790M突变的引物、阻断剂、检测荧光信号基团、待测基因样品混合,进行实时荧光定量PCR,获得检测结果;
其中,所述用于检测人类EGFR基因T790M突变的引物,包括突变上游引物和突变下游引物,突变上游引物包括1-10条针对不同突变位点的引物,其长度为15-40个碱基,靠近3’末端的第1、2、3、4或5位的碱基为突变位点,与待测EGFR突变型基因的一条链互补;突变下游引物为一条共用的下游引物,其长度为15-40个碱基,与待测EGFR突变型基因的另一条链互补;
所述阻断剂能与EGFR基因T790M突变位点野生型序列特异结合,抑制野生型非特异扩增;
所述检测荧光信号基团能与PCR扩增片段结合并发出荧光信号。
2.如权利要求1所述的用于检测人类EGFR基因T790M突变的检测方法,其特征在于,包括1条针对突变位点的引物,其长度为33个碱基,其中3’末端的第3位碱基为突变位点,与待测EGFR突变型基因的一条链互补。
3.如权利要求1所述的用于检测人类EGFR基因T790M突变的检测方法,所述突变下游引物,其长度为24个碱基,与待测EGFR突变型基因的另一条链互补。
4.如权利要求1所述的用于检测人类EGFR基因T790M突变的检测方法,其特征在于,所述引物序列包括:
突变位点EGFR(c.2369C>T)
突变上游引物:
TCTGCCTCACCTCCACCGTGCAGCTCATCATGC(SEQ ID NO.1)
突变下游引物:
AATATTGTCTTTGTGTTCCCGGAC(SEQ ID NO.2)。
5.如权利要求1所述的用于检测人类EGFR基因T790M突变的检测方法,其特征在于,所述阻断剂包括:匹配EGFR野生型基因的核酸序列,所述核酸序列修饰有化学基团;
其中,所述阻断剂中匹配EGFR野生型基因的核酸序列包括:AGCTCATCACGCAGCTCAT(SEQID NO.3);所述化学基团包括:胺基、磷酸基团、生物素、生物素-TEG及C3-spacer中的一种或多种。
6.如权利要求1所述的用于检测人类EGFR基因T790M突变的检测方法,其特征在于,所述检测荧光信号基团包括:FAM、Cy3、HEX、Texas Red、JOE、VIC、TAMRA、Cy5、SYTO9、SYBR MIX中的一种或多种。
7.用于检测人类EGFR基因T790M突变的引物,其特征在于,包括突变上游引物和突变下游引物,突变上游引物包括1-10条针对不同突变位点的引物,其长度为15-40个碱基,靠近3’末端的第1、2、3、4或5位的碱基为突变位点,与待测EGFR突变型基因的一条链互补;突变下游引物为一条共用的下游引物,其长度为15-40个碱基,与待测EGFR突变型基因的另一条链互补。
8.用于检测人类EGFR基因T790M突变的阻断剂,其特征在于,所述阻断剂能与人类EGFR基因T790M突变位点野生型序列特异结合,抑制野生型非特异扩增。
9.用于检测人类EGFR基因T790M突变的试剂盒,其特征在于,包括如权利要求7所述的用于检测人类EGFR基因T790M突变的引物、如权利要求8所述的用于检测人类EGFR基因T790M突变的阻断剂,还包括检测荧光信号基团。
10.如权利要求1所述的用于检测人类EGFR基因T790M突变的检测方法、权利要求7所述的用于检测人类EGFR基因T790M突变的引物和/或权利要求8所述的用于检测人类EGFR基因T790M突变的试剂盒在检测人类EGFR基因突变中的应用,所述应用在突变型基因浓度不低于1%、0.1%、0.01%或0.001%的样品检测人类EGFR基因突变中的应用。
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