[发明专利]半滑舌鳎性别标签piR-mmu-72274的应用有效
| 申请号: | 201811020134.4 | 申请日: | 2018-09-03 |
| 公开(公告)号: | CN109112194B | 公开(公告)日: | 2021-04-16 |
| 发明(设计)人: | 张博;贾磊;高磊;赵娜;刘克奉;鲍宝龙;李仰真;车金远 | 申请(专利权)人: | 天津渤海水产研究所 |
| 主分类号: | C12Q1/6879 | 分类号: | C12Q1/6879;C12Q1/6851 |
| 代理公司: | 暂无信息 | 代理人: | 暂无信息 |
| 地址: | 300457 天津市*** | 国省代码: | 天津;12 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 舌鳎 性别 标签 pir mmu 72274 应用 | ||
1.一种半滑舌鳎性别标签piR-mmu-72274在半滑舌鳎性别鉴定中的应用,所述的性别标签piR-mmu-72274来源于半滑舌鳎的精浆外泌体piRNA,序列为GCATTGGTGGTTCAGTGGTAGAATTCTCGCCT。
2.根据权利要求1所述的一种半滑舌鳎性别标签piR-mmu-72274在半滑舌鳎性别鉴定中的应用,其特征在于所述精浆外泌体piRNA的筛选方法,具体步骤如下:
1)精浆外泌体分离鉴定后,对精浆外泌体smallRNA进行测序分析,Small RNA 种类繁多,将 clean reads 依次和 Rfam 数据库、cDNA 序列、物种重复序列库、piRBase 数据库进行比对,以对测序结果中的smallRNA 进行分类注释;将注释后的序列和 piRBase 数据库比对,进行已知 piRNA 的统计;使用未注释上的序列进行新的 piRNA 预测,piRNA差异表达分析,差异表达piRNA靶基因的通路富集分析和功能富集分析,最后与雄鱼、伪雄鱼样品进行相关性匹配,筛选出一种或者多种对雄鱼和伪雄鱼两种样品具有指示作用的piRNA作为候选的生物标记物;
2)提取随机两组验证样本:经外周血染色体鉴定后的雄鱼及伪雄鱼精浆来源外泌体总RNA,利用MicroRNA定量分析试剂盒定量检测候选piRNA的差异表达情况,筛选出最具标签指示作用的piRNA作为最终的标签piRNA;根据统计学分析原理,P值小于0.05为显著差异;筛选到在雄鱼与伪雄鱼中差异表达的piRNA生物标记物piR-mmu-72274,序列为GCATTGGTGGTTCAGTGGTAGAATTCTCGCCT。
3.一种半滑舌鳎雄鱼及伪雄鱼检测试剂盒,其特征在于:所述试剂盒包括性别标签piR-mmu-72274定量检测引物,引物序列为F:GCATTGGTGGTTCAGTGGT ,R:TCGTATCCAGTGCAGGGTC,PCR逆转录引物序列piR-mmu-72274- RT :GTCGTATCCAGTGCAGGGTCCGAGGTATTCGCACTGGATACGAAGGCGAGA,以及其它逆转录试剂和qPCR荧光定量试剂,内参piR为U6。
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