[发明专利]半滑舌鳎外泌体piR-mmu-31018127应用有效
申请号: | 201811020132.5 | 申请日: | 2018-09-03 |
公开(公告)号: | CN108998545B | 公开(公告)日: | 2021-04-27 |
发明(设计)人: | 张博;赵娜;贾磊;车金远;高磊;李仰真;鲍宝龙;刘克奉 | 申请(专利权)人: | 天津渤海水产研究所 |
主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12Q1/6879 |
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地址: | 300457 天津市*** | 国省代码: | 天津;12 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 舌鳎 外泌体 pir mmu 31018127 应用 | ||
1.一种半滑舌鳎性别标签piR-mmu-31018127在性别鉴定中的应用,所述的性别标签piR-mmu-31018127来源于半滑舌鳎的精浆外泌体piRNA,序列为GCATGTGGTTCAGTGGTAGAATTCTCGCCG。
2.根据权利要求1所述的一种半滑舌鳎性别标签piR-mmu-31018127在性别鉴定中的应用,其特征在于所述精浆外泌体piRNA的筛选方法,具体步骤如下:
1)精浆外泌体分离鉴定后,对精浆外泌体smallRNA进行测序分析,Small RNA 种类繁多,将 clean reads 依次和 Rfam 数据库、cDNA 序列、物种重复序列库、piRBase 数据库进行比对,以对测序结果中的smallRNA 进行分类注释;将注释后的序列和 piRBase 数据库比对,进行已知 piRNA 的统计;使用未注释上的序列进行新的 piRNA 预测,piRNA差异表达分析,差异表达piRNA靶基因的通路富集分析和功能富集分析,最后与雄鱼、伪雄鱼样品进行相关性匹配,筛选出一种或者多种对雄鱼和伪雄鱼两种样品具有指示作用的piRNA作为候选的生物标记物;
2)提取随机两组验证样本:经外周血染色体鉴定后的雄鱼及伪雄鱼精浆来源外泌体总RNA,利用MicroRNA定量分析试剂盒定量检测候选piRNA的差异表达情况,筛选出最具标签指示作用的piRNA作为最终的标签piRNA;根据统计学分析原理,P值小于0.05为显著差异;筛选到在雄鱼与伪雄鱼中差异表达的piRNA生物标记物piR-mmu-31018127,序列为GCATGTGGTTCAGTGGTAGAATTCTCGCCG。
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