[发明专利]一种与菠菜果实形态相关的InDel分子标记及检测引物与应用

说明书

本发明属于分子遗传育种技术领域，具体公开了一种与菠菜果实形态相关的InDel分子标记及检测引物与应用。所述分子标记位于菠菜全基因组的Chr3：54314645‑54314844，其分子标记存在7bp的片段插入/缺失，与菠菜果实表面是否有刺相关。本发明是基于序列的插入/缺失片段设计引物，用于鉴定菠菜果实形态。该技术可以高通量检测多个样本，并且操作简单，准确性高，缩短菠菜自交系选育时间，提高育种效率。

技术领域

本发明属于分子遗传育种技术领域，具体地说，涉及一种与菠菜果实形态相关的InDel分子标记及检测引物与应用。

背景技术

菠菜(Spinacia oleracea L.)，别名波斯草、赤根菜，黎科菠菜属，二倍体(2n＝12)雌雄异株植物，栽培历史悠久，是我国重要的蔬菜作物之一。菠菜营养丰富，抗寒性强，适应性广，生产周期短，复种指数高，产量产值高，深受生产者和消费者欢迎。

菠菜生产中播种用的“种子”实为果实。菠菜果实形态是其重要的农艺性状之一，可分为有刺型和无刺型两种。菠菜原产于亚洲西部的伊朗，在引种传播过程中，由于生态条件、栽培方式、生活习惯的不同形成了有刺的东方类型和无刺的欧美类型。目前，国内外在菠菜杂交种子生产过程中，多采用果实无刺类型为母本，有刺类型为父本进行杂交制种。这种配组方式不仅杂种优势明显，且便于种子贮存、包装、运输、生产播种等操作(Sneep，1958)。菠菜为雌雄异株作物，果实形态受母本基因型控制，雄株携带的果实形态基因型只有在下一代采种时才能表现，因此在菠菜优良种质创制过程中，果实形态不易稳定纯化，给优良种质的纯化及品种选育造成了很大影响。

菠菜的果实在成熟过程中，果皮干燥不脱落包围着种子，形成胞果，子房仅有1个心室，内含胚珠1枚，受精后只形成1粒种子。按照果实是否有刺可以将菠菜分为有刺型菠菜和无刺型菠菜。有刺型菠菜的花萼发育成角状突起，俗称“刺”，一般有2～3个刺，少数有1个或4～6个刺，而无刺型菠菜的花萼不发育成角状突起(图1)。菠菜果实表面的刺由花萼发育而来，这也就决定了果实刺的有无由母本的基因型决定(即F1“种子”形态是由母本的基因型决定)。Sneep(1958)的研究表明，果实形态受单基因调控，其中有刺型对无刺型表现为显性性状。

尽管，目前已知菠菜的果实形态受单基因控制，但至今未见果实形态相关基因克隆或者分子标记的报道，严重影响了菠菜自交系的纯化和品种选育的进程。

发明内容

为了解决现有技术中存在的问题，本发明的目的是提供与菠菜果实形态相关的分子标记及检测引物与应用

为了实现本发明目的，本发明的技术方案如下：

本发明首先提供一种与菠菜果实形态相关的分子标记，该分子标记为与菠菜果实形态紧密连锁的InDel标记YC15，可用于检测菠菜果实表面是否有刺。

基于序列的插入/缺失而开发的用于鉴定菠菜果实形态的InDel标记，其位点位置信息如表1所示。

表1