[发明专利]SNP组合及在制备检测药物反应相关基因的产品中的应用

说明书

本发明提供一种用于飞行质谱检测的SNP位点组合和用于扩增所述SNP位点的引物对以及延伸引物，其能够准确检测39个与药物在人体内作用、转运与代谢相关的基因，通过基因检测技术，能够准确判断某些药物可能存在的不良反应、能够准确的预测出每个个体对于某种药物的代谢能力以及药效。接着提供一种用于检测药物反应相关基因的试剂盒，包括上述引物对以及延伸引物，所述引物对的上游引物的序列如SEQ ID No.1‑39所示，所述引物对的下游引物的序列如SEQ ID No.40‑78所示，所述延伸引物的序列如SEQ ID No.79‑117所示。采用上述试剂盒，可以取得快速、简单、准确的基因型检测，同时具有其他其它SNP检测方法所没有的优势。

技术领域

本发明涉及基因检测技术领域。尤其是涉及基于飞行质谱平台的药物反应相关基因的检测技术及用途。

背景技术

药物体内代谢、转运及药物作用靶点基因的遗传变异及其表达水平的变化可通过影响药物的体内浓度和敏感性，导致药物反应性个体差异。近年来随着人类基因组学的发展，药物基因组学领域得到了迅猛发展，越来越多的药物基因组生物标记物及其检测方法相继涌现。药物基因组学已成为指导临床个体化用药、评估严重药物不良反应发生风险、指导新药研发和评价新药的重要工具，部分上市的新药仅限于特定基因型的适应症患者。美国FDA已批准在140余种药物的药品标签中增加药物基因组信息，涉及的药物基因组生物标记物42个。此外，部分行业指南也将部分非FDA批准的生物标记物及其特性(如MGMT基因甲基化)的检测列入疾病的治疗指南。药物反应相关基因及其表达产物的分子检测是实施个体化药物治疗的前提。

SNP分型的方法多种多样，分子量阵列技术是Sequenom公司推出的世界上领先的基因分析工具，通过引物延伸或切割反应与灵敏、可靠的MALDITOF质谱技术相结合，实现基因分型检测。基于分子量阵列平台的iPLEX GOLD技术可以设计最高多达40重PCR反应和基因型检测，实验设计非常灵活，分型结果准确性高。根据应用需要，对于数十到数百个SNP位点进行数百至数千份样本检测时，具有最佳性价比。特别适合于对全基因组研究发现的结果进行验证，或者是有限数量的研究位点已经确定的情况。

质谱是带电原子、分子或分子碎片按分子量(质荷比)的大小顺序排列的图谱。质谱仪可通过对物质的分子量(质荷比)进行检测，达到区分、鉴别物质的目的。SNP位点两个等位基因之间存在分子量差异，通过分型实验将差异放大，然后以质谱仪进行检测即可达到SNP 分型的目的。带电物质无电场的真空管(Drift region)中的飞行速度与分子量负相关，分子量越小，飞行速度越快，到达检测器(Detector)的时间越早，反之亦然。

发明内容