[发明专利]萝卜肉质根相关性状的QTLs及其定位方法

说明书

本发明公开的萝卜肉质根相关性状的13个QTLs，分别位于染色体Chr1、Chr2、Chr4、Chr5、Chr6、Chr7和Chr8，其基因序列如SEQ ID NO.1～SEQ ID NO.48所示，还公开了上述QTLs定位的方法，包括(1)F₂分离群体的构建；(2)父母本、F₁及F₂分离群体肉质根相关表型性状(根长、根粗、根重)数据的采集及统计分析；(3)父母本、子代F₁和F₂的DNA的提取；(4)多态性SSR引物的筛选与父母本、子代个体的基因型鉴定；(5)遗传图谱的构建；(6)利用MapQTL4.0软件进行QTLs分析。本发明的优点在于，首次将萝卜的连锁图谱与其基因组物理图谱联系起来，且首次定位到控制萝卜根长的2个QTLs位点,进而提高品种的选育效率。

技术领域

本发明属于分子生物学技术领域，具体为萝卜肉质根相关性状的QTLs及其定位方法。

背景技术

萝卜(Raphanus sativus L.,2n＝2×＝18)是世界范围内重要的根类蔬菜。其肉质根含有多种对人类健康有益的成分。肉质根的发育对于决定萝卜产品器官的产量和品质至关重要。与其他根类植物类似，萝卜肉质根的发育同样受到遗传、环境和生理因素等诸多因子调控。目前，对于萝卜肉质根发育的遗传和分子机理受到关注。

肉质根田间性状调查费时费力，使得萝卜肉质根的遗传改良受到限制。基于DNA序列开发分子标记如AFLP、CAPS、SCAR和SSR等是对植物无损害的收集肉质根性状信息的方法。一些控制萝卜肉质根发育相关性状的QTLs通过AFLP、SSR、CAPS和STS等分离标记被初步鉴定出来。如3个控制肉质根根形的QTLs被鉴定出来，它们位于LG 3、LG 8和LG 9连锁群上，LOD值介于2.42～3.22之间，共解释42.4％的表型变异率；2个控制肉质根直径的QTLs位于LG 4和LG 8，其中位于LG 8上QTL的LOD值为4.51，可解释23.8％的表型变异率；控制萝卜肉质根根重的QTLs在两个自交系‘rat tail’和日本萝卜‘Harufuku’构建的RIL群体被鉴定出来，它们可解释14.6～33.9％的表型变异率。通过QTLs位点的鉴定及分子标记辅助选育(MAS)可提高品种选育的效率。

但是萝卜肉质根根长QTLs定位尚未被研究，而且以往的萝卜连锁图谱并没有与萝卜基因组物理图谱联系起来，不便于肉质根相关性状的控制基因的发掘。

发明内容

为解决现有技术中萝卜肉质根根长相关QTLs位点尚未研究，且以往的萝卜连锁图谱并没有与萝卜基因组物理图谱联系的缺陷，本发明提供了萝卜肉质根相关性状的QTLs及其定位方法，实现的目的为，本发明通过将不能形成肉质根的长荚萝卜‘PP12Q-4-2’与可以正常形成肉质根的栽培萝卜‘36-2’作为亲本，将萝卜的连锁图谱与其基因组物理图谱整合，定位到控制萝卜肉质根性状包括根长、根粗和根重的QTLs位点，进而提高品种的选育效率。

为了实现上述目的，本发明提供以下技术方案：本发明发现的萝卜肉质根相关形状的13个QTLS，分别位于染色体Chr1、Chr2、Chr4、Chr5、Chr6、Chr7和Chr8；