[发明专利]SNP标志物在II型糖尿病诊断中的应用

说明书

本发明公开了SNP标志物在II型糖尿病诊断中的应用。本发明首次发现了肠道微生物B.coprocola菌株EDV01869.1基因SNP位点基因型与II型糖尿病有关，通过检测粪便基因组中EDV01869.1基因424位的SNP的基因型，可以判断患者是否患有II型糖尿病，提示可将上述SNP位点应用于II型糖尿病的早期临床诊断。

技术领域

本发明属于生物医药领域，具体涉及SNP标志物在II型糖尿病诊断中的应用，具体的涉及EDV01869.1基因的SNP标志物

背景技术

糖尿病是一种常见的代谢性疾病,发病率与遗传因素、生活方式、饮食结构及年龄等因素有关。根据患者显示的病理学特点，糖尿病可分为两类:I型糖尿病，亦称胰岛素依赖性糖尿病和II型糖尿病(Diabetes mellitus type 2，T2DM)，亦称非胰岛素依赖性糖尿病,其中后者占90％以上。II型糖尿病的主要特征为:胰腺β细胞的胰岛素分泌量下降和胰岛素作用下降，即胰岛素抵抗(insulin resistance，IR)。

单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism，SNP)，即染色体基因组中单个核苷酸的突变而引起的DNA序列的多态性，它以单个碱基的颠换、转换、插入和缺失等形式存在。作为第三代分子标记，SNP标记具有很大的发展潜力，被广泛应用于生物、农学、医学、生物进化等众多领域域，在分子遗传学、药物遗传学、法医学以及疾病的诊断和治疗等方面发挥着重要作用。

目前，II型糖尿病的诊断主要依靠尿糖、尿酮、尿白蛋白、血电解质、血尿素氮和肌酐等实验室检查和各种辅助检查，但是目前基于血糖检测来诊断II型糖尿病费用高且不适于普遍筛查，基于现有技术对II型糖尿病早期诊断的局限性，研发一种用于通过易感位点检测II型糖尿病的产品对于II型糖尿病的早期诊断具有重要的意义。

发明内容

为了弥补现有技术的不足，本发明的目的在于提供一种可用于诊断II型糖尿病易感性的SNP位点。通过检测SNP基因型来诊断II型糖尿病具有预警性。

为了实现上述目的，本发明采用了如下技术方案：

本发明提供了一种SNP标志物，所述SNP位点为肠道B.coprocola菌株EDV01869.1基因的第424位。

进一步，所述SNP标志物的突变为c.A424G。

本发明提供了SNP标志物在制备诊断II型糖尿病易感性的产品中的应用，所述SNP位点为B.coprocola菌株EDV01869.1基因的第424位。

进一步，在II型糖尿病患者中，EDV01869.1基因的第424位由A突变为G。

进一步，所述产品包括检测SNP标志物的第424位基因型的试剂。

进一步，所述试剂包括特异性扩增EDV01869.1的引物，和/或非特异性扩增EDV01869.1的引物。

进一步，所述特异性扩增EDV01869.1基因的引物序列如SEQ ID NO.1～6所示，非特异性扩增EDV01869.1基因的引物序列如SEQ ID NO.7～8所示。

本发明提供了一种诊断II型糖尿病的产品，所述产品包括检测SNP标志物的试剂，所述试剂能够检测B.coprocola菌株EDV01869.1基因的第424位的基因型。

进一步，所述产品包括芯片、试剂盒或核酸膜条。

进一步，所述试剂选自：

识别所述SNP标志物的寡核苷酸探针；或

扩增所述SNP标志物的引物。

进一步，所述引物包括特异性扩增引物，和/或非特异性扩增引物。