[发明专利]综合应用第三代超长测序读段和第二代链接式读段从头组装基因组的方法在审
| 申请号： | 201810927933.3 | 申请日： | 2018-08-11 |
| 公开（公告）号： | CN110858503A | 公开（公告）日： | 2020-03-03 |
| 发明（设计）人： | 马占山;张亚平;李连伟;彭旻晟 | 申请（专利权）人： | 中国科学院昆明动物研究所 |
| 主分类号： | G16B30/20 | 分类号： | G16B30/20 |
| 代理公司： | 暂无信息 | 代理人： | 暂无信息 |
| 地址： | 650223 云*** | 国省代码： | 云南;53 |
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| 摘要： | |||
| 搜索关键词： | 综合 应用 第三代 超长 测序读段 第二代 链接 式读段 从头 组装 基因组 方法 | ||
【权利要求书】：
1.一种综合应用第三代超长测序读段(Ultra-long reads)和第二代链接式读段(Linked-reads)高效、高质量、低成本从头组装基因组的方法。
2.按照权利要求1所述的方法，其特征在于第三代超长测序读段是通过PacBio、Nanopore测序技术或其他第三代测序技术测得的超长测序读段。
3.按照权利要求1所述的方法，其特征在于第二代测序数据是10x Genomics测序平台测序产生的链接式测序读段。
4.按照权利要求1所述的方法，其特征在于使用混合组装软件——DBG2OLC和SPARC对第三代超长测序读段和第二代链接式读段从头组装。
5.按照权利要求1-4任意一条或多条所述的方法，其特征在于：以任何软件、固件和(或)硬件(包括各种医疗仪器、观测仪器)形式实现其概念、算法和功能，从而提供服务的产品。
6.按照权利要求1、2、3所述的综合方法，开发出的任何算法和软件。
7.按照权利要求1、2、3、6任意一条或多条所述的方法，其特征在于：以任何软件、固件和(或)硬件(包括各种医疗仪器、观测仪器)形式实现其概念、算法和功能，从而提供服务的产品。
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