[发明专利]一种提取红麻花药总RNA的方法在审
申请号: | 201810842872.0 | 申请日: | 2018-07-27 |
公开(公告)号: | CN108841821A | 公开(公告)日: | 2018-11-20 |
发明(设计)人: | 廖小芳;赵艳红;何海旺;周瑞阳;周步进;孔祥军;侯文焕 | 申请(专利权)人: | 广西壮族自治区农业科学院 |
主分类号: | C12N15/10 | 分类号: | C12N15/10 |
代理公司: | 郑州优盾知识产权代理有限公司 41125 | 代理人: | 张志军 |
地址: | 530000 广西壮族*** | 国省代码: | 广西;45 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 红麻 总RNA 花药 降解 易被 氯化钠 生物化学技术 次生代谢物 改良CTAB法 异硫氰酸胍 操作流程 试剂成本 有效抑制 多酚 饱和 替代 申请 污染 研究 | ||
本发明涉及生物化学技术领域,特别是指一种提取红麻花药总RNA的方法。解决了现有技术中红麻花药RNA提取过程易被降解难,产物易被红麻次生代谢物多糖多酚污染的技术问题。本研究用饱和异硫氰酸胍替代氯化钠,采用改良CTAB法提取红麻花药总RNA,本申请的提取方法能有效抑制红麻总RNA降解,提高红麻总RNA纯度和完整性,而且试剂成本低,操作流程简单。
技术领域
本发明涉及生物化学技术领域,特别是指一种提取红麻花药总RNA的方法。
背景技术
红麻是重要的韧皮纤维经济作物,与我国所倡导的低碳社会相适应,其育性对该作物的经济价值影响颇大。它的韧皮部包含近75%的纤维和7%的木质素,在生物降解和环境保护方面有很大的利用价值。红麻具有多种多样的用途包括造纸,建筑材料,地毯,衣服等。随着全球对纤维的需求量的增大,森林资源的短缺,世界各国都在积极寻求新型纤维资源,红麻就成为一种重要的替代资源。随着红麻基因组测序的进行,对红麻基因功能的研究如火如荼;红麻总RNA的提取作为一项最基础的实验,如果RNA的质量不行对后续实验的影响巨大,而红麻花药成分中含有大量的多糖、多酚以及其特有的次生代谢产物,这些物质很容易与RNA结合,在提取RNA的过程中被同时抽提出来,从而阻碍具有生物活性红麻RNA的分离,影响RNA提取的质量;为了将多糖、多酚以及其特有的次生代谢产物在提取过程中去除,现有的RNA提取方法有多种,常规的CTAB提取法采用饱和氯化钠进行沉淀,得到的RNA由于RNA酶没有得到有效抑制,使其容易发生降解,并且多糖去除不彻底,RNA污染严重;采用试剂盒进行提取时,时间虽然相对于常规CTAB法缩短了,但通过试剂盒提取到的红麻花药总RNA中常常被糖类、盐类、蛋白或酚类物质污染,得到的RNA的纯度和完整性较差。
发明内容
本发明提出一种提取红麻花药总RNA的方法,解决了现有技术中红麻花药RNA提取难,产物易被污染的技术问题。
本发明的技术方案是这样实现的:
一种提取红麻花药总RNA的方法,步骤为:
(1)称取0.2-0.5 g新鲜或经液氮冷冻处理后存放在-80℃冰箱的花药立即置于预先冰冻后的研钵中,加入足量液氮迅速将花药研成粉末,快速将粉末转入RNase-free离心管中;
(2)向离心管中加入1mL 65℃预热的改良CTAB裂解液,涡旋震荡30-60 s,65 ℃,水浴10 min;
(3)加入体积比为25:24:1的水饱和酚、氯仿和异戊醇混合液,充分混匀,4℃,12,000rpm,离心10min,取上清Ⅰ;
(4)以上清Ⅰ体积为基准,按照上清液:异硫氰酸胍=1.7:1的比例加入饱和异硫氰酸胍,再加入0.5倍的无水乙醇,颠倒混匀;
(5)吸取混合液Ⅱ,将混合Ⅱ转移到RNA纯化柱中,冰上静置2 min;
(6)4℃,12000 rpm,处理30 s,弃去RNA纯化柱的收集管内的液体,重复此步骤直至将混合液Ⅱ全部转移完;
(7)向经步骤(6)处理的RNA纯化柱中加入700 μL 75%乙醇,4℃,12000 rpm处理30 s,弃去收集管内的滤液,重复该步骤1次;
(8)将经步骤(7)处理的RNA纯化柱,于4℃,12000 rpm,离心空甩2 min;
(9)将经步骤(8)处理的RNA纯化柱放入新的1.5 ml RNase-free EP管,向RNA纯化柱中央加入30 μl RNase-free ddH20,于冰上静置2 min;
(10)将经步骤(9)处理的RNA纯化柱和EP管于4℃,12000 rpm,离心1 min,弃去RNA纯化柱,EP管中收集的液体即为纯化的红麻花药总RNA。
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