[发明专利]基于进化信息构建嵌合SaCas9用于增强和扩展PAM位点的识别有效
申请号: | 201810731984.9 | 申请日: | 2018-07-05 |
公开(公告)号: | CN110684755B | 公开(公告)日: | 2021-12-31 |
发明(设计)人: | 谢震;马大程;张昭煜;许志锰 | 申请(专利权)人: | 清华大学 |
主分类号: | C12N9/22 | 分类号: | C12N9/22;C12N15/55;C12N5/10;C12N15/85 |
代理公司: | 北京清亦华知识产权代理事务所(普通合伙) 11201 | 代理人: | 赵天月 |
地址: | 10008*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 基于 进化 信息 构建 嵌合 sacas9 用于 增强 扩展 pam 识别 | ||
1.一种Cas9蛋白突变体,其特征在于,其具有:
框架区;和
PAM识别区,所述PAM识别区识别下列核酸序列的至少之一:
5’-NNNRRT-3’,N=A、T、G或C、R=A或G;
5’-NNNRRN-3’,N=A、T、G或C、R=A或G;
5’-NNNRCN-3’,N=A、T、G或C、R=A或G;
5’-NNNRTN-3’,N=A、T、G或C、R=A或G;
5’-NNNCAA-3’,N=A、T、G或C;
5’-NNNCAT-3’,N=A、T、G或C;
5’-NNNCGT-3’,N=A、T、G或C;
5’-NNNCGC-3’,N=A、T、G或C;
5’-NNNGTN-3’,N=A、T、G或C;
5’-NNNTCN-3’,N=A、T、G或C;
5’-NNNTTC-3’,N=A、T、G或C;
5’-NNNTTG-3’,N=A、T、G或C;
5’-NNNTTT-3’,N=A、T、G或C,
其中,相对于saCas9,所述PAM识别区与982IGVNNDLLNRIEV 994相比具有下列突变的至少之一:
第982位突变为T、K、R或L,
第983位突变为A、C或S,
第984位突变为T、D,
第985位突变为F、S、A、N,
第986位突变为E、D、H、A、M,
第987位突变为S、G、N、S、D、E、P,
第988位突变为D、K、T、S、T、D、K、R、E、A,
第989位突变为R、A、N、Q、G、E、T、K、S、G、H、V,
第990位突变为S,
第991位突变为I、V、L、K、T、M,
第992位突变为V、L,
第993位突变为Q,
第994位突变为L、M、C、I、A;
其中,所述PAM识别区的氨基酸序列如SEQ ID NO:3~SEQ ID NO:43所示;所述框架区的氨基酸序列如SEQ ID NO:1~2、130所示;所述Cas9蛋白突变体的氨基酸序列如SEQ IDNO:44~84、131所示。
2.一种核酸,其特征在于,所述核酸编码权利要求1所述的Cas9蛋白突变体。
3.根据权利要求2所述的核酸,其特征在于,所述核酸具有SEQ ID NO:85~125、132任一所述的核苷酸序列。
4.一种试剂盒,其特征在于,包括:
第一核酸分子,所述第一核酸分子编码权利要求1所述的Cas9蛋白突变体;以及
第二核酸分子,所述第二核酸分子编码gRNA。
5.根据权利要求4所述的试剂盒,其特征在于,所述第一核酸分子具有SEQ ID NO:85~125、132任一所述的核苷酸序列。
6.根据权利要求4所述的试剂盒,其特征在于,所述第二核酸分子是SEQ ID NO:127~129任一所述的核苷酸序列。
7.根据权利要求4所述的试剂盒,其特征在于,所述第一核酸分子、第二核酸分子负载在同一表达载体上。
8.根据权利要求7所述的试剂盒,其特征在于,所述同一表达载体为腺病毒载体。
9.一种对细胞进行基因改造的方法,其特征在于,将第一核酸分子和第二核酸分子引入待改造的细胞中,所述第一核酸分子和所述第二核酸分子是如权利要求4~8任一项所述的,所述方法用于非疾病诊断或治疗目的。
10.根据权利要求9所述的方法,其特征在于,所述Cas9蛋白突变体的PAM识别区序列和所述gRNA序列是基于待改造的基因序列确定的。
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