[发明专利]用于犬的STR基因座集及用途在审
| 申请号: | 201810687031.7 | 申请日: | 2018-06-28 |
| 公开(公告)号: | CN110656183A | 公开(公告)日: | 2020-01-07 |
| 发明(设计)人: | 李生斌;梁雪;伏东科;李梦瑶;王帅;许骄 | 申请(专利权)人: | 深圳市华大司法技术协同创新研究院;深圳华大法医科技有限公司 |
| 主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12Q1/686;C12N15/11 |
| 代理公司: | 11201 北京清亦华知识产权代理事务所(普通合伙) | 代理人: | 赵天月 |
| 地址: | 518083 广东省深*** | 国省代码: | 广东;44 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 个体识别 基因分型 亲缘鉴定 方法和设备 基因座 试剂盒 引物组 遗传学 扩增 | ||
1.一种STR基因座集,其特征在于,选自下列至少之一:
D1S653、D1S317、D2S374、D3S174、D4S768、D7S109、D13S170、D16S585、D19S512、D20S531、D31S244、D34S45;
任选地,进一步包括下列至少之一:
DRAS2、SC24A2、ATP2B2、FH2010、CTNND2、DAMEL。
2.一种引物组,其特征在于,所述引物组适于特异性扩增含有权利要求1所述STR基因座集中的至少之一的核酸序列;
任选地,所述引物组根据权利要求1中所述的基因座集的至少之一的核心序列两端250bp以内的保守序列设计而成;
任选地,所述核酸序列位于基因组中;
任选地,所述引物组选自下列至少一对:SEQ ID NO:1至SEQ ID NO:36。
3.根据权利要求2所述的引物组,其特征在于,所述引物组中的至少一个引物上连接有可检测标记,所述可检测标记包括荧光标记。
任选地,所述引物组中包括多种不同的可检测标记。
4.一种试剂盒,其特征在于,所述试剂盒包括权利要求2或3所述的引物组;
任选地,进一步包括等位基因分型标准物,所述等位基因分型标准物包括权利要求1所述的每一个基因座的纯合子DNA。
5.检测权利要求1所述的基因座集的试剂在制备试剂盒中的用途,所述试剂盒用于犬类个体识别和亲缘鉴定。
6.一种基因分型的方法,其特征在于,包括:
对待测样品内的基因座集中的至少一个基因座进行扩增,得到经扩增的等位基因,所述基因座集为权利要求1所述的STR基因座集;
对所述经扩增的等位基因进行分析,以确定在所述待测样品内的基因座集中的至少一个基因座上存在的等位基因;
任选地,利用多重扩增反应对所述待测样品内的基因座集中的至少两个基因座进行共扩增,得到经扩增的等位基因;
任选地,对所述待测样品内的DNA上的基因座集中的至少一个基因座进行扩增;
任选地,所述待测样品来自于犬;
任选地,所述待测样品来自于血液、精液、阴道细胞、毛发、唾液、尿、骨、口腔样品、含有胎盘细胞的羊膜水、含有胎儿细胞的羊膜水中的一种或多种;
任选地,在进行所述分析之前,还包括对所述经扩增的等位基因进行分离;
任选地,通过毛细管凝胶电泳对所述经扩增的等位基因进行分离;
任选地,使用引物组特异性扩增含有权利要求1所述STR基因座集中的至少之一的核酸序列,所述引物组为权利要求2或3所述的引物组。
7.一种基因分型系统,其特征在于,所述系统包括:
扩增单元,所述扩增单元用于对待测样品内的基因座集中的至少一个基因座进行扩增,得到经扩增的等位基因,所述基因座集为权利要求1所述的STR基因座集;
等位基因确定单元,所述等位基因确定单元与所述扩增单元相连,所述等位基因确定单元用于对所述经扩增的等位基因进行分析,以确定在所述待测样品内的基因组座集中的至少一个基因座上存在的等位基因;
任选地,所述扩增单元利用多重扩增反应对所述待测样品内的基因座集中的至少两个基因座进行共扩增,得到经扩增的等位基因;
任选地,所述扩增单元用于对所述待测样品内的DNA上的基因座集中的至少一个基因座进行扩增;
任选地,所述待测样品来自于犬;
任选地,所述待测样品来自于血液、精液、阴道细胞、毛发、唾液、尿、骨、口腔样品、含有胎盘细胞的羊膜水、含有胎儿细胞的羊膜水中的一种或多种;
任选地,所述系统还包括分离单元,所述分离单元分别与所述扩增单元和所述等位基因确定单元相连,所述分离单元用来对所述经扩增的等位基因进行分离;
任选地,所述分离单元通过毛细管凝胶电泳对所述经扩增的等位基因进行分离;
任选地,所述扩增单元使用引物组特异性扩增含有权利要求1所述STR基因座集中的至少之一的核酸序列,所述引物组为权利要求2或3所述的引物组。
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