[发明专利]通用隔断超快扩增镁、钠切割型功能核酸可视化检测方法在审
| 申请号: | 201810637034.X | 申请日: | 2018-06-20 |
| 公开(公告)号: | CN108949918A | 公开(公告)日: | 2018-12-07 |
| 发明(设计)人: | 许文涛;罗云波;黄昆仑;杜再慧;田晶晶 | 申请(专利权)人: | 中国农业大学 |
| 主分类号: | C12Q1/6851 | 分类号: | C12Q1/6851 |
| 代理公司: | 北京路浩知识产权代理有限公司 11002 | 代理人: | 王文君;黄爽 |
| 地址: | 100193 *** | 国省代码: | 北京;11 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 可视化检测 钠离子 扩增 功能核酸 切割型 四链体 隔断 过氧化物酶活性 检测结果 扩增产物 设计引物 传统PCR 通用 探针 显色 灵敏 | ||
1.一种快速检测镁、钠离子的系统,其特征在于,包括:(1)切割体系,(2)sPCR扩增体系,(3)HCR体系,(4)包含ABTS显色液的检测体系;
所述检测体系用于对待测样品依次经由所述切割体系、sPCR扩增体系和HCR体系进行反应后所得产物进行显色检测;
其中,所述切割体系包括底物链I和酶链I以及底物链II和酶链II:
底物链I:5′-CTCTATCTATrA-GGAAGTACCGCCGC-3′
酶链I:5′-GCGGCGGTACCAGGTCAAAGGTGGGTGAGGGGACGCCAAGAGTCCCCGCGGTTAGATAGAG-3′
其中,rA表示核糖核酸;-表示钠离子切割位点;
底物链II:5′-GTCACGAGTCACTATrA-GGAAGATGGCGAAA-3′
酶链II:5′-TTTCGCCATCTTCTCCGAGCCGGTCGAAATAGTGACTCGTGAC-3′
其中,rA表示核糖核酸;-表示镁离子切割位点;
所述sPCR扩增体系包括:正向隔断引物I、反向引物I、正向隔断引物II、反向引物II、模板:
正向隔断引物I:5′-AGACGAAGCACTGGTTGAAACTCC-隔断物-GGAGTTTCAACCAGTGCTTCGTCTTCATCGCACCGTCAAAGGAACC-3′
反向引物I:5′-GGAAGTACCGCCGCGGAGGGA-3′
正向隔断引物II:5′-AGTCTAGGATTCGGCGTCCCTTAA-隔断物-TTAAGGGACGCCGAATCCTAGACTTCATCGCACCGTCAAAGGAACC-3′
反向引物II:5′-GGAAGATGGCGAAATTCGGGGC-3′
模板:5′-TCATCGCACCGTCAAAGGAACCTCAGTATCAGTGCTATACGTCGATCAGTAGCCCCGAATTTCGCCATCTTCCTCCCTCCGCGGCGGTACTTCC-3′;
所述HCR体系包括4条探针:
探针1:5′-AGGGCGGGTGGGTGGAGTTTCAACCAGTGCTTCGTCTCCCCAGACGAAGCACTGGTTGATGGGT-3′
探针2:5′-TGGGTAGACGAAGCACTGGTTGAAACTCCTCAACCAGTGCTTCGTCTGGGGTGGGTAGGGCGGG-3′
探针3:5′-AGGGCGGGTGGGTTAAGGGACGCCGAATCCTAGACTCAAAGTAGTCTAGGATTCGGCGTCGGGT-3′
探针4:5′-GGGTAGTCTAGGATTCGGCGTCCCTTAAGACGCCGAATCCTAGACTACTTTGAGGGCGGGTGGG-3′。
2.根据权利要求1所述的系统,其特征在于,所述正向隔断引物中的隔断物为聚六乙二醇。
3.根据权利要求1或2所述的系统,其特征在于,所述检测体系包括:酶活缓冲液和氯高铁血红素溶液。
4.权利要求1-3任一项所述的系统在检测镁、钠离子方面中的应用。
5.根据权利要求4所述的应用,其特征在于,所述检测为定性检测或定量检测。
6.基于权利要求1-3任一项所述系统的通用隔断超快扩增镁、钠切割型功能核酸可视化定性检测方法,其特征在于,包括如下步骤:
S1、向所述切割体系中加入待测样品,进行切割反应;
S2、将S1所得切割产物加入所述sPCR扩增体系中进行超快聚合酶链式反应,得sPCR产物;
S3、将所述sPCR产物加入所述HCR体系中进行HCR反应,得HCR产物;
S4、利用所述检测体系对所述HCR产物进行检测。
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