[发明专利]一种影响猪日增重性状的SNP标记及其应用

说明书

本发明属于分子生物技术和分子标记技术领域，特别涉及一种猪SNP分子标记在猪日增重性状研究和猪育种中的应用。所述的猪SNP分子标记位点为SEQ ID NO.1所示，位于该序列片段第321核酸单碱基突变，命名为：g15588826CT。该SNP分子标记对应于国际猪参考基因组10.2版本3号染色体上第15588826个核苷酸位点CT突变。本发明通过优选该SNP分子标记的优势等位基因，能够增加大白日增重性状的遗传进展，减少大白的日增重性状的育种时间，从而有效提高种猪育种的经济效益。

技术领域

本发明属于分子生物技术和分子标记技术领域，特别涉及一种猪SNP分子标记在猪日增重性状研究和猪育种中的应用。

背景技术

日增重性状是评估猪生长性能的重要指标，因此是种猪遗传改良研究中的重点。近百年来，西方猪种的育种目标往往集中在提升瘦肉率和降低背膘厚，这在一定程度上提高了日增重的遗传进展，但也一直缺乏较为直接的选育方法。传统的育种方法对于表型难以鉴定的性状(如日增重)收效甚微，而分子标记辅助选择(marker assisted selection，MAS)则打破了这一技术壁垒。该方法可用于改良肉质(如肌内脂肪)和抗病性状(如抗腹泻)等活体很难度量或活体测量花费很大(如日增重)的性状，以及繁殖(如产仔数)等在生命活动中表达较晚的限性性状。而且MAS不易受环境影响、性别、年龄影响，因此能进行早期选择，进而能起到缩短世代间隔、提高选选种效率的目的(柳小春等，2008年)。因此如能利用MAS技术改良种猪的日增重性状，将具备广阔的应用前景。

大白猪是世界上著名的瘦肉型猪种之一。在现代猪的繁育体系中，大白以繁殖力高、生长育肥性好、适应性强等优点而著称。由于其综合性能优秀，故可以作为诸多合成系商品猪的父本或母本，应用范围十分广泛。因此，对大白猪的日增重性状进行改良，可以有效地缩短商品猪的育肥时间从而节约养殖成本。

发明内容

为了克服现有技术对日增重遗传选育的不足和缺点，本发明的目的在于提供一种猪SNP分子标记在猪日增重性状研究和猪育种中的应用。

本发明的目的通过下述技术方案实现：

一种猪SNP分子标记在猪日增重性状研究和猪育种中的应用；所述的猪SNP分子标记的SNP位点对应于国际猪参考基因组10.2版本3号染色体上第15588826bp处的CT突变；所述分子标记的SNP位点为SEQ ID NO.1所示，其中序列中的M是T或C，导致日增重性状的不同；

所述的猪为大白和其合成系中的至少一种；

用于鉴定上述猪SNP分子标记的引物优选为PCR-F和PCR-R；

上游引物PCR-F：5'-CAGGTAGGACACCTCCACT-3'；

下游引物PCR-R：5'-TGACAGCAGCACTAAATGAC-3'；

所述的猪日增重性状研究优选为利用上述猪SNP分子标记鉴定猪日增重性状；

所述的猪日增重性状研究优选还包括利用上述猪SNP分子标记调节猪日增重；

所述的育种优选为分子标记辅助育种；

一种检测猪日增重性状的方法，包含如下步骤：

检测猪3号染色体上上述猪SNP分子标记的单核苷酸是C还是T；

所述的猪为大白和其合成系中的至少一种；

一种猪的遗传改良的方法，包含如下步骤：

确定种猪核心群中种猪的上述猪SNP分子标记，并根据猪SNP分子标记做出相应的选择：种猪的继代选育国际猪参考基因组10.2版本3号染色体上15588826bp处的CT型和TT型个体，淘汰该点的CC型个体；以逐代提高该位点的等位基因T的频率，从而提高后代猪的日增重；