[发明专利]一种用于预测膀胱癌的肿瘤标志物在审

专利信息
申请号: 201810565627.X 申请日: 2018-06-04
公开(公告)号: CN108676884A 公开(公告)日: 2018-10-19
发明(设计)人: 张淑芳;文小红;刘熹;王顺兰;黄邓高 申请(专利权)人: 海口市人民医院(中南大学湘雅医学院附属海口医院)
主分类号: C12Q1/6886 分类号: C12Q1/6886;C12N15/11
代理公司: 海口翔翔专利事务有限公司 46001 代理人: 张耀婷
地址: 570000 海*** 国省代码: 海南;46
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摘要:
搜索关键词: 膀胱癌 肿瘤标志物 正常组织 高通量测序技术 验证 基因扩增引物 基因上游引物 基因靶点 石蜡切片 下游引物 高表达 基因 预测 蛋白 检测 应用 发现
【说明书】:

发明公开了一种用于预测膀胱癌的肿瘤标志物,该肿瘤标志物为DDX46,DDX46基因扩增引物的基因靶点序列为5’‑GATTGTGATTGAAGAAGAA‑3’,DDX46基因上游引物序列为5’‑AAAATGGCGAGAAGAGCAACG‑3’,DDX46基因下游引物序列为5’‑CATCATCGTCCTCTAAACTCCAC‑3’。本发明应用高通量测序技术对8例早期初诊膀胱癌患者的膀胱癌组织和正常组织进行检测,结果发现DDX46基因在膀胱癌组织中高表达,进一步通过RT‑PCR的方法验证了9例患者的膀胱癌组织和正常组织中DDX46mRNA表达,IHC的方法验证了56例膀胱癌及10例正常组织石蜡切片中DDX46蛋白的表达。

技术领域

本发明属于基因工程技术领域,涉及一种基因及其扩增引物,尤其涉及一种DDX46基因扩增引物及其作为膀胱癌分子标志物中的应用。

背景技术

膀胱癌作为泌尿系统最常见的恶性肿瘤之一,居中国泌尿系肿瘤的首位,在西方仅次于前列腺癌,且膀胱癌的发病呈现逐年上升和年轻化的趋势。据2015年中国癌症调查数据显示,在男性最常见的十种肿瘤中,膀胱癌的发病率2000~2011年期间有上升的趋势,但死亡率保持相对稳定。膀胱癌在初次诊断时,约70%~75%为非肌肉浸润性膀胱癌,然而局部复发率高达70%,其中约20%的初诊非肌层浸润性膀胱癌会进展为肌层浸润性膀胱癌,具有易复发的特点。由于膀胱癌病因复杂,其发生发展是一个多因素,多层面,多通路的复杂过程,发病机制并不明确,临床上亟待找到能早期诊断、复发检测的分子标志物及靶向治疗的作用靶点。

DDX46基因,属于DEAD-box家族成员,位于染色体5q31.1上。有研究表明DDX46可通过调节mRNA前体的可变剪切影响消化器官和脑部的发育,还与造血细胞的分化发育密切相关。最近有学者指出,DDX46基因高表达与食管鳞状细胞癌、结肠癌及骨肉瘤的发生发展密切相关。但是,DDX46基因在膀胱癌中的作用尚不清楚,且未见有文献报道。

发明内容

本发明的目的是提供了一种用于预测膀胱癌的肿瘤标志物,通过寻找DDX46基因的靶点序列,设计DDX46基因的引物序列,构建了干扰DDX46基因表达的慢病毒载体,通过敲低膀胱癌细胞系(5637、T24)中DDX46基因表达发现抑制了膀胱癌细胞的增殖、侵袭和迁移,诱导细胞凋亡;动物实验阐明DDX46基因抑制膀胱癌T24细胞成瘤的能力。

为了实现上述目的,本发明的技术方案为:提供一种用于预测膀胱癌的肿瘤标志物,该肿瘤标志物为DDX46,DDX46基因扩增引物的基因靶点序列为5’-GATTGTGATTGAAGAAGAA-3’,DDX46基因上游引物序列为5’-AAAATGGCGAGAAGAGCAACG-3’,DDX46基因下游引物序列为5’-CATCATCGTCCTCTAAACTCCAC-3’。

所述DDX46基因扩增引物在鉴定膀胱癌中的应用。

本发明应用高通量测序技术对8例早期初诊膀胱癌患者的膀胱癌组织和正常组织进行检测,结果发现DDX46基因在膀胱癌组织中高表达,进一步通过RT-PCR的方法验证了9例患者的膀胱癌组织和正常组织中DDX46mRNA表达,IHC的方法验证了56例膀胱癌及10例正常组织石蜡切片中DDX46蛋白的表达。

附图说明

图1为慢病毒敲低膀胱癌T24和5637细胞DDX46基因表达;

图2为Celigo细胞计数检测细胞增殖图;

图3为MTT实验检测细胞活力图;

图4为克隆形成实验检测细胞增殖图;

图5为Transwell侵袭实验及划痕实验图;

图6为流式细胞术检测细胞凋亡图。

图7为裸鼠成瘤实验动物及瘤体图。

具体实施方式

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