[发明专利]与母鸡储精能力相关的SNP分子标记及其应用

说明书

本发明提供了一种与母鸡储精能力相关的SNP分子标记及其应用，通过全基因组关联分析（GWAS）和限制性内切酶长度多态性（PCR‑RFLP）技术方法，在母鸡基因组上筛选到1个与母鸡储精能力相关联的SNP分子标记，位于母鸡1号染色体。该SNP位点的多态性与母鸡储精能力DN（授精一次至母鸡产出最后一枚受精蛋之间间隔的天数）和FN（授精一次后母鸡所产受精蛋的个数）显著关联，所述SNP分子标记多态性位点表现为CC基因型，则是母鸡储精能力的有利标记，可以用于母鸡储精能力的筛选和改良。

技术领域

本发明属于家畜分子标记技术领域，具体涉及1个与母鸡储精能力相关的SNP分子标记及其应用。

背景技术

母鸡的储精能力是指母鸡在自然交配或者人工授精(Artificial insemination，AI)之后能够储存精子并持续产受精蛋的能力(Duration of fertility)。在许多品种或品系的群体中，研究者发现母鸡的储精能力均会存在明显的个体差异，反映为一次自然交配或者人工授精后母鸡产受精蛋个数(FN，The number of fertile eggs after AI)或持续天数(DN，The days post-insemination until the last fertile egg)的差异。在家禽育种和种蛋生产过程中，母鸡的储精能力长短是决定进行人工授精频率的关键因素，如火鸡的储精性状长达一至两个月，因此在火鸡种蛋的生产过程中，对其人工授精只需要一个月进行一次，甚至对于即将要开产的火鸡，可提前半个月进行人工授精来提高种蛋的获得(Bakst,2010)。而白来航(White leghorn)和京红母鸡(JingHong brown layers)的储精性状一般只有两周左右，麻鸭(Anas platyrhyncha domestica)的储精性状也只有13天左右(Lake and Stewart,1978；Blackburn et al.,2009；Liu et al.,2015)，生产上为了保证90％以上的种蛋受精率，对它们进行人工授精一般需要一周进行一次。在目前大规模集约生产中人工授精技术被普遍采用的情况下，选择储精能力长的母鸡，对母鸡储精性状进行改良，能够有效地降低种蛋生产过程中人工授精的频率，进而减少种公鸡的饲养量，从而减少饲养成本，同时减少母鸡对人工授精产生的应激反应，增加生产效益。利用全基因组关联分析(GWAS)检测与性状相关联的SNPs及基因组区域，可大大提高工作效率和统计效力。本研究是利用鸡全基因组SNP芯片(600K，Affymetrix)对鸡储精能力进行全基因组关联分析，在全基因组范围内检测与母鸡储精性状相关联SNPs及基因组区域的报道。该项研究工作在国家基金(项目编号：31372301，项目名称：鸡贮精能力差异相关新基因的筛选及其分子机制初探)和西藏自治区重点研发及转化计划(项目编号：CGZH2017000237)及自主创新基金重大培育项目：利用吐-莱资源群体发掘鸡抗热高产基因及其组合(项目编号：2662018PY088)资助下完成。

发明内容

本发明的目的在于提供一个与母鸡储精能力相关的SNP分子标记及其应用，通过全基因组关联分析首次在母鸡基因组1号染色体上找到1个与储精能力关联的SNP分子标记。

本发明通过以下技术方案实现：

一种与母鸡储精能力相关的SNP分子标记，位于1号染色体，该分子标记的核苷酸序列(SEQ ID NO.1)如下所示：

AAAAGCATTTGCATGAGATATATTARCATTTTATTCATGACAAAAGGAAAT

上述序列第26位的碱基R是A或C，导致多态性。

通过下述方法筛选获得：

1)实验样品采集：采集试验鸡血样用于DNA提取；

2)母鸡储精能力的测定：测量试验鸡一次人工授精后母鸡产受精蛋个数(FN)和持续天数(DN)，重复测量三次，取三次所测结果的平均值，作为该试验鸡的储精能力；