[发明专利]一种淋巴瘤miRNA芯片、制备方法、检测方法和用途在审

专利信息
申请号: 201810549902.9 申请日: 2018-05-31
公开(公告)号: CN108676883A 公开(公告)日: 2018-10-19
发明(设计)人: 高波;潘云;李正金;赵立仙;田林波;路会侠;毕磊;王敏;李耀康;张春梅;王丽霞;张晓婷;邓刚;陈继樑 申请(专利权)人: 高波
主分类号: C12Q1/6886 分类号: C12Q1/6886;C12Q1/6837
代理公司: 北京知呱呱知识产权代理有限公司 11577 代理人: 武媛;吕学文
地址: 671000 云南省大理白族自治州大*** 国省代码: 云南;53
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摘要:
搜索关键词: 淋巴瘤 制备 弥漫大B细胞淋巴瘤 艾滋病 组织表达谱分析 淋巴结反应 生物学效应 统计学意义 表达差异 差异表达 发病机制 靶基因 试剂盒 检测 增生 芯片 研究
【说明书】:

发明公开了一种淋巴瘤miRNA芯片、制备方法、用途、检测的方法以及含有淋巴瘤miRNA芯片的试剂盒,其中该芯片包含HIV‑DLBCL(艾滋病相关性弥漫大B细胞淋巴瘤)和HIV‑RH(艾滋病患者淋巴结反应性增生)组织表达谱分析的39个表达差异有统计学意义的miRNA,为进一步研究差异表达miRNA在HIV‑DLBCL发病机制中的作用及其靶基因的生物学效应奠定了基础。

技术领域

本发明涉及基因芯片技术领域,具体涉及一种淋巴瘤miRNA芯片、制备方法、检测方法和用途。

背景技术

人免疫缺陷病毒感染/获得性免疫缺陷综合征相关淋巴瘤[humanimmunodeficiency virus(HIV)/acquired immunodeficiency syndrome(AIDS)-relatedlymphoma]简称ARL,是一组与HIV感染有关的淋巴组织异质性肿瘤。近年来流行病学资料显示,HIV相关淋巴组织肿瘤已逐渐取代Kaposi肉瘤,成为最为常见的AIDS相关恶性肿瘤。据估计,HIV/AIDS患者发生淋巴瘤的相对危险性是普通人群的60-200倍。ARL具有独特的临床特征,包括涵盖几乎所有的B细胞类型,倾向系统性播散和结外器官病变,临床经常呈侵袭性进展。ARL亚型多样性可能与以下因素有关:(1)HIV感染和免疫监视系统的破坏;(2)病毒感染:EB病毒感染或其他病毒的感染;(3)基因突变;(4)细胞因子调节失调;(5)组织起源不同。肿瘤发生是多基因突变、多步骤积累的过程,揭示肿瘤的DNA/RNA变化是肿瘤研究的重要手段。

淋巴瘤的标本难以收集,主要原因是由于活检后一经确诊,病人不再进行手术治疗,而是非手术的化放疗,致标本来源非常困难。由于ARL组织来源稀少而珍贵,导致研究工作受到极大限制,经文献检索,我国仅见ARL散发病例报道。主要原因:(1)艾滋病伴发淋巴瘤大多为中晚期患者,取材存在风险性,患者及家属不愿在知情同意书上签字;(2)临床医师不愿意冒取材所面临的种种风险,一旦考虑艾滋病伴发淋巴结肿大,首先采取抗结核治疗,无效患者则采取试验性化疗方法来推断诊断。AIDS及其相关肿瘤是人类探讨肿瘤形成与免疫监视系统关系的独特模型,对ARL的认识、临床表现、病理诊断及鉴别诊断、分子发病机制以及治疗已经成为医学研究面临的实际问题。

基因芯片所揭示的重要信息,如某些信号转导通路已经被确认为肿瘤治疗标靶并进入临床测试阶段。miRNA芯片的检测原理就是,用Cy-3对总RNA样品进行标记,然后与miRNA芯片杂交,通过扫描芯片上绿光信号的强度,计算出该样品中miRNA的表达量,从而了解该样品中哪些miRNA的表达量出现了异常。然而,基因/RNA芯片技术在ARL中的研究和应用目前还是一项空白。

发明内容

本发明的目的之一在于提供一种淋巴瘤miRNA芯片,用以解决现有技术中缺少检测HIV感染相关性弥漫大B细胞淋巴瘤患者组织中miRNA表达谱的专用miRNA芯片,该芯片包含HIV-DLBCL(艾滋病相关性弥漫大B细胞淋巴瘤)和HIV-RH(艾滋病患者淋巴结反应性增生)组织表达谱分析的39个表达差异有统计学意义的miRNA,为进一步研究差异表达miRNA在HIV-DLBCL发病机制中的作用及其靶基因的生物学效应奠定了基础。

为实现上述目的,本发明的技术方案为:

一种淋巴瘤miRNA芯片,所述miRNA芯片包括固相载体和有序固定在固相载体上的miRNA探针,所述的miRNA探针中包括SEQ ID NO:1-SEQ ID NO:39所示的序列。

上述淋巴瘤miRNA芯片中,所述固相载体可以选择硝酸纤维素膜、尼龙膜、玻璃片或硅片。

上述淋巴瘤miRNA芯片中,所述互补结合区是与SEQ ID NO:1-SEQ ID NO:39所示的序列互补的序列。

进一步地,上述淋巴瘤miRNA芯片中,所述探针还包含1-5个错配碱基。

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