[发明专利]用于进行扩增子挽救多重聚合酶链式反应(PCR)的系统和方法

说明书

本公开的实施方案大体上涉及用于进行扩增子挽救多重聚合酶链式反应(arm‑PCR)的系统和方法。在一个实施方案中，所述系统包含耦合到控制元件的处理器和读取器。所述控制元件被配置成基于多种设置来控制所述处理器和所述读取器的操作。所述处理器被配置成接纳用于对从机体样本获得的DNA和/或RNA进行PCR扩增的自含式盒。所述处理器与所述盒啮合并操纵所述盒内的试剂以扩增并检测来自所述样本的DNA。所述处理器还使所述盒将所述DNA存放于所述盒内的微阵列上。读取器被配置成在所述盒已被所述处理器处理后接纳该盒并捕获用于传送到所述控制元件的所述微阵列的图像。

本申请是申请日为2012年11月12日的PCT国际专利申请PCT/US2012/064713进入中国国家阶段的中国专利申请号201280063646.3、发明名称为“用于进行扩增子挽救多重聚合酶链式反应(PCR)的系统和方法”的分案申请。

相关申请的交叉引用

本申请要求标题为“Systems and Methods for Performing Amplicon RescueMultiplex Polymerase Chain Reaction”且于2011年11月11日提交的美国临时专利申请号61/558,791的优先权，该临时专利申请以引用方式并入本文中。本申请还要求标题为“Systems and Methods for Performing Amplicon Rescue Multiplex PolymeraseChain Reaction(PCR)”且于2012年1月30日提交的美国临时专利申请号61/592,372的优先权，该临时专利申请以引用方式并入本文中。

技术领域

本申请涉及多重聚合酶链式反应的系统和方法。更具体地，本申请涉及用于扩增子挽救多重聚合酶链式反应(arm-PCR)的系统和方法。

背景技术

聚合酶链式反应(PCR)的开发使得能够使用DNA扩增用于多种应用，包括分子诊断测试。然而，存在许多与PCR用于分子识别诊断(Molecular differential diagnositc,MDD)测定的用途相关的挑战。PCR利用了特异性的引物或引物组、温度条件和酶。PCR反应可能容易受到污染，引物结合对于不同的引物可能需要不同的条件，引物应该对于靶序列特异以便仅扩增该靶序列，等等。这使得更难从单个样品扩增多个序列。

在过去，诊断测试临床样品以发现一种或多种致病性病原物(agent)需要分离和培养微生物。然而，这可能需要几天，而在许多情况下，如果要挽救患者的生命，必须在几小时内做出诊断。目标是在大约几小时内对临床样品内的一种或多种致病性病原物做出识别，并且已经开发了许多方法来较好地实现该目标。例如，已经开发了多重PCR和靶标富集多重PCR(tem-PCR)技术以扩增样品内的多种核酸以便产生足够的DNA/RNA从而使得能够检测和识别多种生物体。多重PCR和tem-PCR技术提供了一次对单个样品进行多次测定的能力，但它们必须通过牺牲大的灵敏度才能实现这一目的，所述灵敏度可以通过单一扩增反应使用单组靶特异性引物实现。仍然需要对所述技术进行改进以便提供具有更大灵敏度和更短诊断时间的诊断测试。还需要整合扩增步骤和检测步骤，使得可以消除开管杂交步骤以减少由PCR产物的携带污染引起的假阳性。

发明内容

本公开的实施方案大体上涉及用于进行扩增子挽救多重聚合酶链式反应(arm-PCR)的系统和方法。在一个实施方案中，所述系统包含耦合到控制元件的处理器和读取器。所述控制元件被配置成基于多种设置来控制所述处理器和所述读取器的操作。所述处理器被配置成接纳用于对从机体样本获得的DNA和/或RNA进行PCR扩增的自含式盒。所述处理器与所述盒啮合并操纵所述盒内的试剂以扩增并检测来自所述样本的DNA。所述处理器还使所述盒将所述DNA存放于所述盒内的微阵列上。读取器被配置成在所述盒已被所述处理器处理后接纳该盒并捕获用于传送到所述控制元件的所述微阵列的图像。

附图说明