[发明专利]一种利用超分辨成像检测端粒酶活性的方法在审
申请号: | 201810490109.6 | 申请日: | 2018-05-21 |
公开(公告)号: | CN108642139A | 公开(公告)日: | 2018-10-12 |
发明(设计)人: | 宗慎飞;宗君珠;王著元;崔一平 | 申请(专利权)人: | 东南大学 |
主分类号: | C12Q1/6834 | 分类号: | C12Q1/6834;C12Q1/48;C12N15/11 |
代理公司: | 南京众联专利代理有限公司 32206 | 代理人: | 叶涓涓 |
地址: | 211189 *** | 国省代码: | 江苏;32 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 检测 超分辨成像 端粒酶活性 端粒酶 信号探针 杂交反应 捕获探针 高分辨率 高灵敏度 互补序列 检测结果 微弱信号 信号扩增 延伸反应 检测端 酶活性 染料 端粒 修饰 图像 细胞 | ||
1.一种利用超分辨成像检测端粒酶活性的方法,其特征在于,包括如下步骤:
第一步,利用CHAPS法提取待测细胞中的端粒酶;
第二步,利用捕获探针和端粒酶进行延伸反应,反应产物与信号探针溶液进行杂交反应;所述的捕获探针为掺杂染料的二氧化硅纳米球表面修饰端粒酶底物;所述的信号探针为修饰了染料分子的端粒互补序列;
第三步,用超分辨成像技术对杂交反应产物进行检测,根据获得的两个通道的图像上点的重合情况以及DNA探针的荧光信号所获得的图像上点的大小判断端粒酶的活性。
2.根据权利要求1所述的利用超分辨成像检测端粒酶活性的方法,其特征在于,所述第二步中延伸反应步骤为:取200-300μL捕获探针,与5μL 10mM dNTPs、1-2μL RNA酶抑制剂、5μL第一步中得到的端粒酶提取物混合,于30℃下振荡1-2小时进行端粒延伸反应;所述反应产物与信号探针的杂交反应步骤包括:延伸反应产物以2500-3000转,15分钟离心提纯1次;去除上清后,将沉淀分散至200-300μL的PBS溶液中,再加入0.3-0.9μL10μM的信号探针进行杂交反应;该混合液30℃振荡2-3小时,以2500g,15min离心提纯,去除上清液,将杂交产物的沉淀分散至500-800μLPBS中。
3.根据权利要求1所述的利用超分辨成像检测端粒酶活性的方法,其特征在于,所述捕获探针的制备方法包括如下步骤:
配制10mM EDC(1-(3-二甲氨基丙基)-3-乙基碳二亚胺盐酸盐)溶液和10mM NHS(N-羟基琥珀酰亚胺)溶液,取10-20μL 10μM TS Primer(端粒酶引物,序列为5'-COOH-TTTTTTTTTTAATCCGTCGAGCAGAGTT-3')溶于PBS溶液中,再分别加入10-20μL EDC溶液和10-20μLNHS溶液,加入50-60μL掺杂FITC(异硫氰酸荧光素)的二氧化硅纳米球溶液,置于摇床中振荡反应12-16小时;将反应物以2500-4000转,15分钟离心1-2次提纯;去除上清,沉淀分散于2mLPBS溶液中,即得到捕获探针。
4.根据权利要求1所述的利用超分辨成像检测端粒酶活性的方法,其特征在于,所述掺杂FITC的二氧化硅纳米球的制备方法包括如下步骤:
在1mL无水乙醇中加入0.5-1mg FITC粉末和50-100μL的APTMS(3-氨丙基三甲氧基硅烷),涡旋搅拌均匀后于摇床中振荡反应6-8小时后获得FITC-APTMS(偶联了APTMS的FITC),该产物保存于4℃待用;之后,在50mL无水乙醇中加入1-1.5mL去离子水,1.5-2mL 98%TEOS(正硅酸四乙酯)和100-120μL的FITC-APTMS,在缓慢搅拌的条件下滴入3-3.5mL 25%氨水,反应3-3.5小时后加入1mL 98%TEOS,继续反应三小时;将反应产物以3000-5000转,15分钟离心3-5次;每次离心后去除上清,将沉淀分散至3mL无水乙醇中,避光保存。
5.根据权利要求1所述的利用超分辨成像检测端粒酶活性的方法,其特征在于:所述信号探针为5'-Cy5-CCCTAACCCTAA-3'。
6.根据权利要求1所述的利用超分辨成像检测端粒酶活性的方法,其特征在于:所述信号探针的制备方法包括:将5'端修饰了Cy5染料的端粒互补序列的粉末离心后加入PBS溶液即获得10μM的DNA探针溶液。
7.根据权利要求1所述的利用超分辨成像检测端粒酶活性的方法,其特征在于:所述第一步具体包括如下过程:将1×106个对数生长期的细胞用冰PBS缓冲液离心清洗若干次后分散至100μL RNA酶抑制剂处理过的冰镇CHAPS裂解液中,冰上孵育一段时间后,将裂解液以12000rpm,20min离心,取出上清即得端粒酶提取物。
8.根据权利要求1所述的利用超分辨成像检测端粒酶活性的方法,其特征在于:所述端粒酶引物序列为5'-COOH-TTTTTTTTTTAATCCGTCGAGCAGAGTT-3'。
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