[发明专利]基于血清exosomal lncRNAs的食管癌诊断特异性表达图谱及检测分析系统有效
申请号: | 201810444780.7 | 申请日: | 2018-05-10 |
公开(公告)号: | CN108342487B | 公开(公告)日: | 2020-07-28 |
发明(设计)人: | 王传新;杜鲁涛;闫素真;蒋秀梅;李娟 | 申请(专利权)人: | 山东大学第二医院 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;C12N15/11 |
代理公司: | 济南圣达知识产权代理有限公司 37221 | 代理人: | 王志坤 |
地址: | 250033 山东*** | 国省代码: | 山东;37 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 基于 血清 exosomal lncrnas 食管癌 诊断 特异性 表达 图谱 检测 分析 系统 | ||
本发明涉及分子生物学检测技术领域,具体涉及一种基于血清exosomallncRNAs的食管癌诊断特异性表达图谱及检测分析系统。所述表达图谱由表达上调的UCA1和POU3F3构成。所述早期食管癌lncRNAs特异表达谱检测分析系统,包括定量检测模块、输入模块、分析模块和输出模块。所述分析模块包括logit模型计算和ROC曲线分析;所述logit模型为:logit(P=ESCC)=‑1.1338+0.3957*U+0.2561*P;所述U为UCA1表达量数值,P为POU3F3表达量数值。本发明检测分析系统对食管癌具有较高的诊断效率,高于传统的血清SCCA,此模型能够诊断食管癌早期患者(I和II)。
技术领域
本发明涉及分子生物学检测技术领域,具体涉及一种基于血清exosomallncRNAs的食管癌诊断特异性表达图谱及检测分析系统。
背景技术
食管癌是全球常见的消化道肿瘤之一,严重威胁人类健康。因此,早期诊断和早期治疗是提高食管癌患者预后生存及降低死亡率的关键。目前,用于食管癌的诊断方法主要包括钡餐、胃镜、组织活检及血清传统肿瘤标志物等检查。临床上,影像学钡餐检查是食管癌早期筛查最常用的手段,但由于其敏感性低不易发现食管内微小的病变,对食管癌早期诊断具有一定的局限性;胃镜及组织活检检查虽然具有较高的诊断效能,但该检查方法的有创性限制了其在食管癌筛查中的广泛应用;目前血清中SCCA和CEA是临床常用食管癌检查的传统标志物,但其对食管癌早期诊断的敏感性和特异性均较低。因此,寻找敏感性高和特异性好的早期肿瘤标志物,建立一种安全有效的血清学食管癌诊断方法是临床亟待解决的难题。
长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)是一类转录本长度大于200个核苷酸,缺乏编码蛋白功能的RNA分子,对基因的表达调控起着关键的作用。目前,已有研究证实lncRNA可在表观遗传学、转录水平、转录后水平与大分子相互结合,并在多个重要节点调控肿瘤的进展。lncRNA异常表达与肿瘤的发生、发展和转移均密切相关,提示其可作为肿瘤诊断的新型生物标志物。Exosome(外泌体)是一类粒径为30~150nm的脂质体囊泡,可由多种细胞分泌并在血液、尿液等其他体液中被检出,其包裹了蛋白质、mRNA、微小RNA、lncRNA、DNA及脂质等多种物质。研究发现exosome在细胞间通讯、肿瘤免疫、肿瘤治疗、组织损伤修复、疾病诊断中具有重要的意义。对不同来源的exosome携带的lncRNAs进行分析并筛选其特异性的分子标志物,将为相关疾病的诊断及其发生发展的研究提供非常重要的帮助。随着exosome分离和分析检测技术的发展,越来越多分子标志物被发现,尤其是exosome中存在丰富且稳定的lncRNAs作为分子标志物,通过比较分析肿瘤患者和对照组血清exosomallncRNAs表达谱,发现不同肿瘤具有其特定的lncRNAs表达谱,有望为恶性疾病的早期诊断、预后判断提供新的依据。因此,确定食管癌lncRNAs特异表达谱,筛选差异表达的lncRNAs,建立食管癌血清exosomallncRNAs诊断模型,有助于实现对食管癌的早期诊断。
发明内容
针对上述现有技术的不足,本发明提供了一种基于血清exosomallncRNAs的食管癌诊断特异性表达图谱及检测分析系统,为食管癌的早期发现和早期治疗提供支持。
为实现上述目的,本发明采用下述技术方案:
本发明目的之一,提供一种早期食管癌lncRNAs特异表达谱,由表达上调的UCA1和POU3F3构成。
本发明目的之二,提供一组用于检测以上所述早期食管癌lncRNAs特异表达谱的引物,包括以下引物:UCA1的上游引物的序列如SEQ ID NO:1所示,下游引物的序列如SEQID NO:2所示;POU3F3的上游引物的序列如SEQ ID NO:3所示,下游引物的序列如SEQ IDNO:4所示;内参GAPDH的上游引物序列如SEQ ID NO:5所示,下游引物的序列如SEQ ID NO:6所示;
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