[发明专利]一种检测非小细胞肺癌的特异性表达图谱及检测分析系统在审
申请号: | 201810444751.0 | 申请日: | 2018-05-10 |
公开(公告)号: | CN108611418A | 公开(公告)日: | 2018-10-02 |
发明(设计)人: | 王传新;谢玉姣;张一;杜鲁涛;蒋秀梅 | 申请(专利权)人: | 山东大学第二医院 |
主分类号: | C12Q1/6886 | 分类号: | C12Q1/6886;C12N15/11 |
代理公司: | 济南圣达知识产权代理有限公司 37221 | 代理人: | 王志坤 |
地址: | 250033 山东*** | 国省代码: | 山东;37 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 非小细胞肺癌 特异表达 血清 检测分析 诊断 特异性表达 检测引物 种检测 图谱 分析 | ||
本发明公开了一种非小细胞肺癌血清lncRNAs特异表达谱,由表达上调lncRNA SOX2OT、ANRIL构成。所述非小细胞肺癌血清lncRNAs特异表达谱中特异表达lncRNAs的检测引物如SEQ ID NO:1~4所示。本发明还提供了一种非小细胞肺癌检测分析系统,利用以下公式:logit(P=NSCLC)=1.7787‑0.5362*S‑0.7764*A;计算,用于非小细胞肺癌的诊断,经ROC曲线分析,此血清lncRNAs模型对非小细胞肺癌具有较高的诊断效率,同时此模型能够诊断非小细胞肺癌早期患者(TNM I期)。
技术领域
本发明涉及分子生物学检测技术领域,具体涉及一种检测非小细胞肺癌的特异性表达图谱及检测分析系统。
背景技术
肺癌是全世界范围内最常见的恶性肿瘤之一,也是肿瘤性死亡的首要原因。而非小细胞肺癌是肺癌的主要病理类型,约占非小细胞肺癌的80%。尽管早期诊断的非小细胞肺癌患者可以通过手术联合放化疗或者靶向药物治疗进行干预,但非小细胞肺癌患者早期症状与体征并不明显,导致非小细胞肺癌早期诊断异常困难,患者总体的五年生存率仍然不容乐观,仅仅21%左右。目前常用的检查手段,如影像学检查(X光片、数字CT)、血清肿瘤标志物(CEA、SCCA、CYFRA21-1等)、支气管镜检查等,因特异性差、敏感性不强、病人依从性差等原因存在各种不足。因此,寻找一种新型非侵入性、高灵敏度和高特异性的诊断标志物用于非小细胞肺癌的诊断是当前的研究热点和难点。
Long noncoding RNA(lncRNAs)是一类长度超过200个核苷酸的非编码RNA,可通过转录调控、染色质修饰、X染色体沉默、核内运输多种机制调控靶基因的表达,进而参与肿瘤细胞分化、生长、代谢和凋亡等过程。已经有研究证实,lncRNAs在肿瘤中异常表达,与肿瘤的发生、发展、转移和预后存在密切的联系。近年来研究发现,血清中存在丰富且稳定的lncRNAs,通过对比分析肿瘤患者和对照组血清中lncRNAs表达谱,发现不同肿瘤具有其特定的lncRNAs表达谱,为肿瘤的无创性诊断提供了新的依据。因此,确定非小细胞肺癌lncRNAs特异表达谱,筛选差异表达的lncRNAs,建立非小细胞肺癌血清lncRNAs诊断模型,有助于实现对非小细胞肺癌的早期诊断。
本发明在前期研究中发现,单个的基因检测非小细胞肺癌灵敏度和特异性均比较低,如SOX2OT、ANRIL、CEA、CYFRA21-1和SCCA的AUC分别为0.740、0.723、0.622、0.622和0.607。而将五个基因联用,通过见建立模型:Logit(P)=1.6487-(0.002×CEA)-(0.0249×CYFRA21-1)-(0.095×SCCA)-(0.5474×SOX2OT)-(0.6174×ANRIL),所得AUC为0.853。lncRNAs与肿瘤标志物联合虽然可以提高检测的灵敏度和特异性,但是多个基因的联用不仅会增大检测成本,而且增大了数据分析,同时在检测过程中针对不同的基因采用相同的检测分析条件,无疑会增大误差。因此,还需探究更为灵敏、准确的检测方法。
发明内容
本发明主要目的是,提供一种检测非小细胞肺癌的特异性表达图谱及检测分析系统。本发明在前期研究基础上,发现将SOX2OT和ANRIL作为特异性表达图谱,通过设计合适的引物联合用于检测非小细胞肺癌,建立非小细胞肺癌检测分析系统,可使检测灵敏度和特异性大幅提高。
为实现上述目的,本发明采用以下技术方案:
本发明目的之一,提供一种非小细胞肺癌lncRNAs特异表达谱,由上调表达的SOX2OT和ANRIL构成。
本发明目的之二,提供上述的lncRNAs特异性表达谱在制备非小细胞肺癌检测试剂中的应用。
本发明目的之三,提供一组用检测以上所述非小细胞肺癌lncRNAs特异表达谱的引物,所述SOX2OT的上游引物如SEQ ID NO:1所示,下游引物如SEQ ID NO:2所示;所述ANRIL的上游引物如SEQ ID NO:3所示,下游引物如SEQ ID NO:4所示。
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