[发明专利]一种用于检测可可球二孢的特异性引物及快速检测方法有效
申请号: | 201810386044.0 | 申请日: | 2018-04-26 |
公开(公告)号: | CN108531639B | 公开(公告)日: | 2019-07-19 |
发明(设计)人: | 周游;黄俊生;杨腊英;汪军;郭立佳;刘磊;梁昌聪 | 申请(专利权)人: | 中国热带农业科学院环境与植物保护研究所 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12Q1/04;C12N15/11;C12R1/645 |
代理公司: | 广州三环专利商标代理有限公司 44202 | 代理人: | 陈欢 |
地址: | 571101 *** | 国省代码: | 海南;46 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 特异性引物 快速检测 引物 植物病害 真菌 条带 病原菌 翻译延长因子 葡萄座腔菌 关键作用 区间序列 特异扩增 特异性强 灵敏度 检测 可用 扩增 物种 基因 发现 | ||
1.一种用于检测可可球二孢的特异性引物对,其特征在于,包括上游引物ZYLTF1和下游引物ZYLTR1,所述ZYLTF1和ZYLTR1的核苷酸序列分别为:
ZYLTF1:5'-acgcatgtcgttttttaa-3',
ZYLTR1:5'-tacatgagtggtcagagcat-3',
所述可可球二孢的拉丁名为Lasiodiplodia theobromae;
所述引物通过以下方式得到:利用一段翻译延长因子序列的变异区间序列设计上游引物ZYLTF1,所述变异区间序列为:acgcatgtcgttttttaacccctctcga,并根据翻译延长因子其它碱基序列设计下游引物ZYLTR1。
2.根据权利要求1所述的一种用于检测可可球二孢的特异性引物对,其特征在于,所述引物ZYLTF1和ZYLTR1对可可球二孢特异性扩增出216bp的产物。
3.一种可可球二孢快速检测方法,其特征在于,以待测样品的DNA为模板,利用权利要求1所述的引物对进行PCR扩增,反应结束后对扩增产物进行琼脂糖凝胶电泳分析,根据扩增产物的大小判定结果,如果能特异性地扩增出216bp的产物,即判定样品中存在可可球二孢。
4.根据权利要求3所述的一种可可球二孢快速检测方法,其特征在于,所述待测样品为可可球二孢或者疑似感染了可可球二孢的植物组织。
5.根据权利要求3所述的一种可可球二孢快速检测方法,其特征在于,引物扩增的反应体系为:10μmol/L上游引物和下游引物各1μL,2×Taq PCR Master Mix 12.5μL,模板DNA 1μL,无菌超纯水9.5μL;所述2×Taq PCR Master Mix包括0.05U/μL的Taq DNA聚合酶、10×Buffer、4mmol/L的Mg2+和0.4mmol/L的dNTPs。
6.根据权利要求3所述的一种可可球二孢快速检测方法,其特征在于,扩增的反应程序为:
94℃预变性3min;94℃变性45s,58℃退火45s,72℃延伸1min;循环35次;72℃终延伸10min。
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