[发明专利]一种细胞分类器的构建方法、装置及系统在审
| 申请号: | 201810351529.6 | 申请日: | 2018-04-19 |
| 公开(公告)号: | CN108520249A | 公开(公告)日: | 2018-09-11 |
| 发明(设计)人: | 赵乐;吴佳妮 | 申请(专利权)人: | 赵乐;吴佳妮 |
| 主分类号: | G06K9/00 | 分类号: | G06K9/00;G06K9/62 |
| 代理公司: | 北京中索知识产权代理有限公司 11640 | 代理人: | 宋涛 |
| 地址: | 250012 山东省济南*** | 国省代码: | 山东;37 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 高维数据 细胞分类 样本点 准确率 构建 装置及系统 质谱 自动化 细胞 标签标识 机器学习 细胞类型 细胞识别 分类器 贴标签 申请 标签 分类 分析 | ||
本申请实施例公开了一种细胞分类器的构建方法、装置及系统,所述方法包括通过质谱细胞术对M个单细胞样本点进行分析,获得M个单细胞样本点的高维数据;对所述M个单细胞样本点的高维数据贴标签,获得N组带有标签的高维数据,其中,同一组高维数据的标签标识的细胞类型相同;通过SVM对所述N组高维数据进行两两分类训练,构建N(N‑1)/2个分类器。在本申请实施例中,将质谱细胞术这种单细胞识别准确率更高的技术与SVM这种机器学习的方法相结合,建立了高准确率、自动化的细胞分类器,不仅可以实现高准确率的细胞识别,而且可以实现识别过程的自动化。
技术领域
本申请涉及细胞分类技术领域,特别是涉及一种细胞分类器的构建方法、装置及系统。
背景技术
随着医疗卫生和人们健康需求的发展,疾病预防和检测正引起广泛的关注与研究。而细胞检测可以为一些重大疾病,如癌症和自身免疫性疾病提供诊断依据,因此细胞检测成为研究领域的热门话题。细胞分类作为细胞检测的重要分支,已经具备了丰富的理论基础和实践经验,一些典型的分类模型和特征提取方法已经得到了广泛的应用。
例如,传统的流式细胞仪可以快速测量、存贮、显示悬浮在液体中的分散细胞的一系列重要的生物物理、生物化学方面的特征参量,并可以根据预选的参量范围把指定的细胞亚群从中分选出来,在临床医学中得到了广泛应用。但是,由于传统流式细胞仪使用的标记物是荧光基团,其发射光谱比较宽,通道之间容易发生光谱重叠,在后续的数据处理部分要进行复杂的补偿计算,这在一定程度上限制了流式细胞仪的检测通道的数量,进而影响细胞分类精度。
随着疾病预防和检测领域对细胞分类精度的需求不断提升,一种精度更高的细胞分类技术亟待出现。
发明内容
本申请实施例中提供了一种细胞分类器的构建方法、装置及系统,以利于解决现有技术中细胞分类精度较低的问题。
第一方面,本申请实施例提供了一种细胞分类器的构建方法,所述方法包括:
通过质谱细胞术对M个单细胞样本点进行分析,获得M个单细胞样本点的高维数据;
对所述M个单细胞样本点的高维数据贴标签,获得N组带有标签的高维数据,其中,同一组高维数据的标签标识的细胞类型相同;
通过SVM对所述N组高维数据进行两两分类训练,构建N(N-1)/2个分类器。
可选地,所述对所述M个单细胞样本点的高维数据贴标签,包括:
对所述M个单细胞样本点的高维数据进行降维可视化处理,获得可视化图像;
对所述可视化图像内的数据进行聚类处理,获得P个聚类区域;
将所述聚类区域与N个经不同标记物染色后的染色区域进行对比,其中,每一种标记物的染色区域对应一种细胞类型;
若所述染色区域与所述聚类区域相匹配,则为相应的聚类区域对应的高维数据添加标签,其中,若第一染色区域与第一聚类区域相匹配,则为所述第一聚类区域对应的高维数据添加第一标签,所述第一标签表征所述第一染色区域对应的细胞类型。
可选地,所述第一染色区域与第一聚类区域相匹配,具体包括:
所述第一聚类区域包含所述第一染色区域。
可选地,所述方法还包括:
若所述聚类区域与所述染色区域不匹配,则调整聚类参数,对所述可视化图像内的数据重新进行聚类处理。
第二方面,本申请实施例提供了一种细胞分类器的构建装置,所述装置包括:
分析模块,用于通过质谱细胞术对M个单细胞样本点进行分析,获得M个单细胞样本点的高维数据;
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