[发明专利]玉米分子标记及其在检测玉米耐盐相关性状中的应用在审
申请号: | 201810296301.1 | 申请日: | 2018-04-04 |
公开(公告)号: | CN108546769A | 公开(公告)日: | 2018-09-18 |
发明(设计)人: | 陈化榜;赵丽 | 申请(专利权)人: | 中国科学院遗传与发育生物学研究所 |
主分类号: | C12Q1/6895 | 分类号: | C12Q1/6895;C12N15/11 |
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地址: | 100101 北*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 玉米耐盐 性状 分子标记 检测 玉米分子 耐盐 引物 玉米基因组DNA 分子标记辅助 材料选育 玉米育种 可用 应用 敏感 进程 | ||
1.玉米分子标记在检测或辅助检测玉米耐盐相关性状中的应用:
所述玉米分子标记为下述A1)或A2)或A3):
A1)序列表中序列1的第52-55位所示的DNA片段;
A2)将A1)的DNA片段经过一个或几个核苷酸的取代和/或缺失和/或添加得到的与A1)限定的核苷酸序列具有90%或90%以上同一性的DNA片段;
A3)包含A1)或A2)的DNA片段。
2.根据权利要求1所述的应用,其特征在于:A3)为序列表中序列1或序列2所示的DNA片段。
3.检测玉米基因型的方法,所述基因型为AA基因型、Aa基因型和aa基因型;所述方法包括如下a)或b):
a)检测待测玉米基因组DNA中对应于序列表中序列1的第52-55位的序列,如所述待测玉米基因组中两条染色体均为下述a1)的染色体,所述待测玉米为AA基因型;如所述待测玉米基因组中两条染色体均为下述a2)的染色体,所述待测玉米为aa基因型;如所述待测玉米基因组中两条染色体中一条为下述a1)的染色体,另一条为下述a2)的染色体,所述待测玉米为Aa基因型;
a1)含有序列表中序列1的第52-55位;
a2)不含有序列表中序列1的第52-55位;
b)检测待测玉米基因组DNA中对应于序列表中序列1的DNA片段,如所述待测玉米基因组中两条染色体均为下述b1)的染色体,所述待测玉米为AA基因型;如所述待测玉米基因组中两条染色体均为下述b2)的染色体,所述待测玉米为aa基因型;如所述待测玉米基因组中两条染色体中一条为下述b1)的染色体,另一条为下述b2)的染色体,所述待测玉米为Aa基因型;
b1)对应于序列表中序列1的序列为序列1;
b2)对应于序列表中序列2的序列为序列2。
4.根据权利要求3所述的方法,其特征在于:b中所述检测待测玉米基因组DNA中对应于序列表中序列1的DNA片段可通过引物对P1/P2对所述待测玉米的基因组DNA进行PCR扩增,所述引物对P1/P2由序列表中序列1的第1-19位所示的单链DNA和由序列表中序列1的第64-83位反向互补的单链DNA组成。
5.权利要求1-3中所述玉米分子标记,为以玉米基因组DNA为模板,采用权利要求4所述引物对进行PCR扩增所得的DNA片段。
6.一种用于检测权利要求1-3任一项所述分子标记的试剂盒,其特征在于,包括权利要求4所述的引物对。
7.权利要求1或2或5所述的分子标记或权利要求3所述的检测玉米基因型的方法或权利要求4所述的引物对或权利要求6所述的试剂盒在如下1)或2)或3)中的应用:
1)检测玉米是否耐盐;
2)从玉米群体材料中获得耐盐个体和/或盐敏感个体;
3)玉米育种。
8.根据权利要求7所述的应用,其特征在于,对待测玉米进行权利要求1或2或5所述的分子标记的检测,根据检测结果判断其是否耐盐,根据检测结果从玉米群体材料中获得耐盐个体和/或盐敏感个体,根据检测结果选取玉米材料作为亲本进行玉米育种。
9.根据权利要求8所述的方法,其特征在于,按照权利要求3所述的方法检测玉米的基因型。
10.根据权利要求9所述的基因型,其特征在于,包括:
如果基因型是AA或Aa,则为耐盐型;如果基因型是aa,则为盐敏感型;
如果基因型是AA,则所述玉米群体材料中的个体为耐盐个体,且该所述耐盐个体自交后代中的所有个体的基因型为AA;如果基因型是aa,则所述玉米群体材料中的个体为盐敏感个体,且该所述盐敏感个体自交后代中的所有个体的基因型为aa;如果基因型是Aa,则所述玉米群体材料中的个体为耐盐个体,且该所述耐盐个体自交后代中的个体的基因型为AA或Aa或aa;
根据不同目的,选择AA、Aa或aa基因型的玉米作为亲本进行育种。
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