[发明专利]用于虎斑、拟目与剑尖枪乌贼种间鉴定的分子标记及应用在审
| 申请号: | 201810270801.8 | 申请日: | 2018-03-29 |
| 公开(公告)号: | CN108611422A | 公开(公告)日: | 2018-10-02 |
| 发明(设计)人: | 宋微微;赵云;王春琳;李荣华;母昌考 | 申请(专利权)人: | 宁波大学 |
| 主分类号: | C12Q1/6888 | 分类号: | C12Q1/6888;C12Q1/686;C12N15/11 |
| 代理公司: | 宁波诚源专利事务所有限公司 33102 | 代理人: | 张一平;叶桂萍 |
| 地址: | 315211 浙*** | 国省代码: | 浙江;33 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 剑尖枪乌贼 标签序列 分子标记 乌贼 种间 物种 物种基因组 基因组DNA 高分辨率 鉴定技术 近缘物种 扩增产物 熔解曲线 设计引物 近缘种 准确率 测序 应用 | ||
1.一种用于虎斑、拟目与剑尖枪乌贼种间鉴定的SNP分子标记,其特征在于:所述SNP分子标记的正向引物F1为5'CTTAGTACAGTTAAAATACCGCAGC 3';反向引物F2为5'TAAATAAAGAGTTGGGCCTGCTC 3'。
2.一种根据权利要求1所述的SNP分子标记在基于高分辩率溶解曲线在鉴定虎斑、拟目与剑尖枪乌贼中的应用。
3.根据权利要求2所述的SNP分子标记在基于高分辩率溶解曲线鉴定虎斑、拟目与剑尖枪乌贼中的应用,其特征在于:所述虎斑乌贼目标扩增片段中的SNP为:
TAAATAAAGAGTTGGGCCTGCTCAGTGATATAAATTTAACAGCTGCGGTATTTTAACTGTACTAAG。
4.根据权利要求2所述的SNP分子标记在基于高分辩率溶解曲线鉴定虎斑、拟目与剑尖枪乌贼中的应用,其特征在于:所述拟目乌贼目标扩增片段中的SNP为:
TAAATAAAGAGTTGGGCCTGCTCTGTGATGTAAATTTAACAGCTGCGGTATTTTAACTGTACTAAG。
5.根据权利要求2所述的SNP分子标记在基于高分辩率溶解曲线鉴定虎斑、拟目与剑尖枪乌贼中的应用,其特征在于:所述剑尖枪乌贼目标扩增片段中的SNP为:
TAAATAAAGAGTTGGGCCTGCTCGGTGAAACGTTTTAACAGCTGCGGTATTTTAACTGTACTAAG。
6.一种基于高分辨率溶解曲线鉴定虎斑、拟目与剑尖枪乌贼的方法,其特征在于:
以虎斑、拟目与剑尖枪乌贼基因组DNA为模板,根据虎斑、拟目与剑尖枪乌贼的基因组的标签序列设计引物进行PCR扩增,利用扩增产物在高分辨率熔解曲线中的Tm值差异进而区分;以待鉴定乌贼基因组DNA为模板,根据乌贼的基因序列设计引物进行PCR扩增,利用扩增产物在高分辨率熔解曲线中的Tm值差异进而区分乌贼相近物种。
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