[发明专利]FLT1基因多态性作为猪产仔数性状的遗传标记及应用

说明书

本发明属于家畜遗传标记筛选与应用技术领域，具体涉及FLT1基因多态性作为猪产仔数性状的SNP遗传标记及应用。本发明的遗传标记从猪FLT1基因内含子14上克隆得到，其核苷酸序列如序列表SEQ ID NO：1或SEQ ID NO：2所示。在FLT1基因内含子14上存在一个等位基因(C/G)突变，该突变引起BsaJI‑RFLP酶切多态性。本发明的筛选步骤包括：从猪血液或毛发中提取基因组DNA，从测序结果里寻找SNP位点，确定该SNP位点的内切酶，设计特异引物进行PCR扩增，利用单核苷酸多态性检测，对基因型与产仔数性状间进行相关性分析。本发明还公开了遗传标记在猪标记辅助选择中的应用。

技术领域

本发明涉及猪遗传标记制备技术领域，具体涉及FLT1基因多态性作为猪产仔数性状的 SNP遗传标记及应用，本发明还包括猪FLT1基因突变位点的检测方法及关联分析。

背景技术

母猪的繁殖性能是猪重要的经济性状，猪产仔数是衡量母猪繁殖性能的一个指标。由于产仔数是低遗传力性状，通过常规的育种方法很难在短期内获得较大进展，随着分子生物学和分子遗传学理论技术的不断发展，遗传标记技术可以解决这一难题，并能有效的加快产仔数性状的选择进展。

FMS相关酪氨酸激酶1(fms related tyrosine kinase 1,FLT1)基因是血管内皮生长因子的受体基因，血管内皮生长因子在卵巢中广泛表达(Stouffer R L etal.Regulation and action of angiogenic factors in the primate ovary.Archivesof Medical Research,2001,32(6):567-575)； FLT1基因作为血管内皮生长因子的其中一个受体，也被发现在卵巢中表达(Pavelock K et al. Differential expression andregulation of the vascular endothelial growth factor receptors neuropilin-1and neuropilin-2in rat uterus.Endocrinology，2001,142(2):613-622)。有研究表明，血管内皮生长因子(VEGF)与其受体在妊娠过程中发挥重要作用,如参与卵泡生长发育(Geva E,Jaffe R B.Role of vascular endothelial growth factor in ovarianphysiology and pathology. FertilitySterility,2000,74(3):429)及胚胎植入(Merviel P et al.The molecular basis of embryo implantation inhumans.Zentralblatt Fur Gynakologie,2001,123(6):328)等过程。总的来说，FLT1 基因在母猪繁殖过程中发挥重要作用，因此申请人将FLT1基因作为影响母猪的产仔数的候选基因进行研究。

发明内容

本发明的目的在于获得一种猪产仔数性状相关的遗传标记及其应用，根据测序结果，寻找FLT1基因的突变位点，检测FLT1基因的多态性，为猪的标记辅助选择提供一种新的遗传标记，基因分型和选择方法。

本发明的技术方案如下所述：

本发明获得了一种猪产仔数性状的遗传标记，它是基于大白猪、梅山猪排卵前卵泡组织 RNA测序的结果，在测序结果里发现FLT1基因上存在多态位点，其中第14内含子(这个第14 内含子是针对FLT1基因的全序列而言，在FLT1基因的全序列的第14内含子上，申请人设计引物扩增第14内含子部分片段测序，获得406bp片段)上的一个C/G等位基因突变可以导致 PCR-BsaJI-RFLP多态性。