[发明专利]用于评估药物治疗后复发转移风险的计算机系统在审
申请号: | 201810134563.8 | 申请日: | 2018-02-09 |
公开(公告)号: | CN108389625A | 公开(公告)日: | 2018-08-10 |
发明(设计)人: | 袁大巍;田埂;郎继东;闫娜;梁乐彬 | 申请(专利权)人: | 元码基因科技(北京)股份有限公司 |
主分类号: | G16H50/30 | 分类号: | G16H50/30;G16H20/10;C12Q1/6858 |
代理公司: | 北京科石知识产权代理有限公司 11595 | 代理人: | 高元吉 |
地址: | 100102 北京市朝*** | 国省代码: | 北京;11 |
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摘要: | |||
搜索关键词: | 复发 计算机系统 抗雌激素药物 非甾体类 药物治疗 评估 多态性分析 病理特征 临床医生 酶类基因 算法模型 统计学 构建 代谢 数学 预测 治疗 | ||
1.一种用于评估非甾体类抗雌激素药物治疗后复发转移风险的计算机系统,其包括:
用于接收对象数据的输入装置,其中所述对象数据包括来自所述对象的临床病理数据和基因多态性数据;
具有数据库的存储器,其用于存储至少所述临床病理数据和所述基因多态性数据;
处理器,其与存储器进行通信,且被配置为:
在所述临床病理数据和所述基因多态性数据中确定多个自变量,根据赋值规则计算各个自变量的数值,并利用所述数值通过算法模型计算风险评估值;和
配置为根据所述风险评估值发送通知的输出装置。
2.根据权利要求1所述的计算机系统,其中所述临床病理数据包括来自年龄、是否绝经、ER、PR、Ki67、HER2、LN转移数目、肿瘤大小和组织分级的数据;且所述基因多态性数据包括来自CYP3A5、CYP2D6和CYP2C19的数据。
3.根据权利要求2所述的计算机系统,其中所述基因多态性数据包括来自CYP2D6*2、CYP2D6*3、CYP2D6*4、CYP3A5*3、CYP2D6*10、CYP2D6*41、CYP2C19*2、CYP2C19*3、CYP2C19*17和CYP2D6*5的基因多态性数据。
4.根据权利要求3所述的计算机系统,其中通过飞行时间质谱检测CYP2D6*2、CYP2D6*3、CYP2D6*4、CYP3A5*3、CYP2D6*10、CYP2D6*41、CYP2C19*2、CYP2C19*3和CYP2C19*17的基因多态性数据。
5.根据权利要求3所述的计算机系统,其中通过扩增电泳检测CYP2D6*5的片段性缺失数据。
6.根据权利要求3所述的计算机系统,其中所述算法模型通过下述步骤获得:
在所述临床病理数据和所述基因多态性数据中确定多个自变量,根据赋值规则对各个自变量进行赋值,然后进行重要性评估,并进行排序,选取相关性绝对值大于阀值的变量,进行逻辑回归分析得出各个自变量权重并形成算法模型。
7.根据权利要求3所述的计算机系统,其中所述算法模型为:
TAMRORs(1)=-43.28+0.89CYP2D6*10+0.37CYP2C19*3+20.77LN-21.17Age+0.83ER-22.31HER2+64.71Grade;
TAM RORs(2)=1/(1+e-TAMRORs(1))。
8.根据权利要求7所述的计算机系统,其中当TAM RORs(2)趋近于1时,所述输出装置发送复发转移风险高的通知;和当TAM RORs(2)趋近于0时,所述输出装置发送复发转移风险低的通知。
9.根据权利要求1或6所述的计算机系统,其中所述临床病理数据的赋值规则为:
年龄大于40岁为0,40岁以下为1;
绝经为0,未绝经为1;
ER大于50%为0,50%以下为1;
PR大于50%为0,50%以下为1;
Ki6720%以下为0,大于20%为1;
HER2阴性为0,阳性(3+orFish+)为1;
LN转移数4个以上为1,小于4个为0;
肿瘤最大直径小于2cm为0,肿瘤最大直径2cm以上为1;
组织分级小于等于2级为0,大于2级为1。
10.根据权利要求1或6所述的计算机系统,其中所述基因多态性数据的赋值规则为:
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