[发明专利]图像清晰度分析及对焦方法、测序仪、系统与存储介质有效
| 申请号: | 201810084468.1 | 申请日: | 2018-01-29 |
| 公开(公告)号: | CN110111842B | 公开(公告)日: | 2021-06-29 |
| 发明(设计)人: | 沈蕾;李美;黎宇翔 | 申请(专利权)人: | 深圳华大智造科技股份有限公司 |
| 主分类号: | G16B25/00 | 分类号: | G16B25/00 |
| 代理公司: | 深圳市赛恩倍吉知识产权代理有限公司 44334 | 代理人: | 彭辉剑;徐丽 |
| 地址: | 518083 广东省深圳*** | 国省代码: | 广东;44 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 图像 清晰度 分析 对焦 方法 测序仪 系统 存储 介质 | ||
1.一种图像清晰度分析方法,用于分析生物芯片荧光图像清晰度,其特征在于,所述方法包括以下步骤:
获取生物芯片的至少一荧光图像,所述生物芯片上设置有多个位点,所述位点用于结合核酸分子,所述核酸分子携带荧光基团;
将所述荧光图像进行离散傅里叶变换;
获取离散傅里叶变换后所述荧光图像的傅里叶幅值图;
根据所述傅里叶幅值图获取所述荧光图像对应的傅里叶谱;
获取所述傅里叶谱在中高频率区域的至少一峰值,所述峰值选自所述傅里叶谱在中高频率区域的局部极大值集合,所述峰值为所述局部极大值集合中的最大值与次大值;
获取所述傅里叶谱在低频率区域的均值;
计算所述傅里叶谱中所述局部极大值集合中的所述最大值与所述次大值之和与所述均值的比值,得到所述峰值与所述均值的差异程度;
当所述差异程度大于一预设阈值时,判定所述荧光图像清晰。
2.根据权利要求1所述的图像清晰度分析方法,其特征在于,所述将所述荧光图像进行离散傅里叶变换包括:
获取所述荧光图像在第一方向以及第二方向上的像素数目,所述第一方向垂直于所述第二方向;
获取所述荧光图像原始的二维图像;
利用所述像素数目与所述原始的二维图像将所述荧光图像进行离散傅里叶变换。
3.根据权利要求1所述的图像清晰度分析方法,其特征在于,所述根据所述傅里叶幅值图获取所述荧光图像对应的傅里叶谱包括:
将所述傅里叶幅值图从笛卡尔坐标系变换到极坐标系;
通过对所述极坐标系中的角度进行积分处理获取所述傅里叶谱。
4.一种自动对焦方法,其特征在于,所述自动对焦方法包括:
获取位于第一位置的生物芯片的至少一荧光图像,所述生物芯片上设置有多个位点,所述位点用于结合核酸分子,所述核酸分子携带荧光基团;
根据权利要求1-3任一项所述的图像清晰度分析方法判断所述荧光图像是否清晰;
若判断结果为否,则获取位于第二位置的生物芯片的荧光图像。
5.一种基因测序系统,其特征在于,所述基因测序系统包括:
图像获取模块,用于获取生物芯片的至少一荧光图像,所述生物芯片上设置有多个位点,所述位点用于结合核酸分子,所述核酸分子携带荧光基团;
离散傅里叶变换模块,用于将所述荧光图像进行离散傅里叶变换;
傅里叶幅值获取模块,用于获取离散傅里叶变换后所述荧光图像的傅里叶幅值图;
傅里叶谱获取模块,用于根据所述傅里叶幅值图获取所述荧光图像对应的傅里叶谱;
峰值获取模块,用于获取所述傅里叶谱在中高频率区域的至少一峰值,所述峰值选自所述傅里叶谱在中高频率区域的局部极大值集合,所述峰值为所述局部极大值集合中的最大值与次大值;
均值获取模块,用于获取所述傅里叶谱在低频率区域的均值;
差异程度计算模块,用于计算所述傅里叶谱中所述局部极大值集合中的所述最大值与所述次大值之和与所述均值的比值,得到所述峰值与所述均值的差异程度;
判断模块,用于在所述差异程度大于一预设阈值时,判定所述荧光图像清晰。
6.一种基因测序仪,其特征在于,所述基因测序仪包括处理器,所述处理器用于执行存储器中存储的计算机程序时实现如权利要求1-3任意一项所述的图像清晰度分析方法的步骤。
7.一种非易失性计算机可读存储介质,其上存储有计算机程序,其特征在于,所述计算机程序被处理器执行时实现如权利要求1-3任意一项所述的图像清晰度分析方法的步骤。
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