[发明专利]一种基于Wafergen Smartchip系统的高效极微量TE建库方法在审

专利信息
申请号: 201810066751.1 申请日: 2018-01-24
公开(公告)号: CN108411374A 公开(公告)日: 2018-08-17
发明(设计)人: 徐子静;傅延;张鸿;张慧 申请(专利权)人: 安徽微分基因科技有限公司
主分类号: C40B50/06 分类号: C40B50/06;C12Q1/6806
代理公司: 暂无信息 代理人: 暂无信息
地址: 238014 安徽省合肥市巢湖经济开发区龙泉路*** 国省代码: 安徽;34
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摘要:
搜索关键词: 分液 聚合酶链式反应 芯片放置 极微量 酶试剂 建库 喷入 反应试剂 软件设置 试剂成本 需求配置 样品试剂 样品DNA 通量 自带 调试 芯片 节约 失败 配置
【说明书】:

发明公开了一种基于Wafergen Smartchip系统的高效极微量TE建库方法,其具体操作步骤如下:步骤一:调试好MSND分液设备,并利用MSND分液设备自带软件设置分液程序;步骤二:根据需求配置反应试剂;步骤三:向384板内加入已混合好的对应酶试剂及样品DNA;步骤四:将芯片放置入MSND中,将配置有样品及酶试剂的384孔板放置到MSND分液设备上,执行分液程序,将384孔板内样品喷入芯片中;步骤五:将已喷入样品试剂反应液的芯片放置入SmartChipTM TE PCR Cycler中,执行PCR(聚合酶链式反应)的程序;步骤六:PCR(聚合酶链式反应)完成后。本发明可以大大节约试剂成本,提高反应通量,同时,还能减少人为问题导致的误差或失败。

技术领域

本发明涉及Target Enrichment(TE)技术领域,特别涉及一种基于WafergenSmartchip系统的高效极微量TE建库方法。

背景技术

目标区域富集建库技术可以短时间内实现大批量样品的二代PCR(聚合酶链式反应)文库构建。其原理是设计一段针对特定位点的引物序列扩增目标区域,而后运用带有测序接头序列的通用引物对扩增序列进行二次扩增,通过二次扩增将二代测序所需的接头序列添加到目标区域,以完成文库构建的目的。目前该技术可以运用到16S\18S\ITS等基于PCR(聚合酶链式反应)技术的二代文库构建当中。但传统PCR(聚合酶链式反应)区域富集技术的每个反应所需试剂量一般都为10ul及以上,并且剂量都是人为控制,这样容易导致误差或失败,增大了试剂的成本,同时也减少了反应通量。

因此,发明一种基于Wafergen Smartchip系统的高效极微量TE建库方法来解决上述问题很有必要。

发明内容

本发明的目的在于提供一种基于Wafergen Smartchip系统的高效极微量TE建库方法,以解决上述背景技术中提出的问题。

为实现上述目的,本发明提供如下技术方案:一种基于WafergenSmartchip系统的高效极微量TE建库方法,其具体操作步骤如下:

步骤一:调试好MSND(WaferGen Biosystems SmartChip MultisampleNanodispenser)分液设备,并利用MSND(WaferGen Biosystems SmartChip MultisampleNanodispenser)分液设备自带软件设置分液程序;

步骤二:根据需求配置反应试剂;

步骤三:向384板内加入已混合好的对应酶试剂及样品DNA;

步骤四:将芯片放置入MSND(WaferGen Biosystems SmartChip MultisampleNanodispenser)分液设备中,将配置有样品及酶试剂的384孔板放置到MSND(WaferGenBiosystems SmartChip Multisample Nanodispenser)分液设备上,执行分液程序,将384孔板内样品喷入芯片中;

步骤五:将已喷入样品试剂反应液的芯片放置入SmartChipTM TE PCR Cycler中,执行PCR(聚合酶链式反应)的程序;

步骤六:PCR(聚合酶链式反应)完成后,使用离心回收装置将芯片中反应液收集到洁净离心管内;

步骤七:使用磁珠纯化离心管内PCR(聚合酶链式反应)的产物,质控合格后即可作为二代文库上机测序

优选的,所述步骤二中的反应试剂包括酶试剂和引物。

优选的,所述步骤三中384板上的每个孔加入10~20ul酶试剂,5~15ul样品DNA。

本发明的技术效果和优点:

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