[发明专利]一种基于Wafergen Smartchip系统的高效极微量基因分型技术

说明书

本发明公开了一种基于Wafergen Smartchip系统的高效极微量基因分型技术，具体包括以下步骤：步骤一，调试好MSND(WaferGen Biosystems SmartChip Multisample Nanodispenser)分液设备，利用MSND(WaferGen Biosystems SmartChip Multisample Nanodispenser)自带软件进行分液程序的设置；步骤二，根据需求配置反应酶试剂，然后将反应酶试剂分别加入到384孔板中，每个孔位加入5‑10微升酶试剂，步骤三，将DNA样品分别加入到384孔板内已加有酶试剂的孔位，每个孔位5‑8微升。本发明通过采用一张具有5184个纳米孔的芯片，每个纳米孔可以进行100nl级别的PCR反应，一张芯片一次可以做5184个SNP分型检测，相较于其他SNP分型技术，能够极大程度降低检测所需试剂，提升检测自动化水平，同时本发明以Smartchip为基础，减少SNP基因分型当中PCR试剂用量，从而有效提升检测通量。

技术领域

本发明涉及基因分型技术领域，特别涉及一种基于Wafergen Smartchip系统的高效极微量基因分型技术。

背景技术

SNP(single nucleotide polymorphism，SNP)指基因组上由于单个核苷酸差异导致的DNA序列多样性。人类基因中存在许多SNP位点，SNP差异性直接导致不同人之前表型的差异，进一步反应到对环境当中致病因素的敏感差异，因而利用SNP检测技术可以对个体疾病进行风险预测。目前市面上利用探针或PCR方式的SNP检测技术一般是探针捕获、QPCR等，这些技术都存在单次检测成本较高或者通量较低问题，Wafergen smartchip平台可以很好的解决这些问题，具有低成本、高通量、高准确度的优势。

因此，发明一种基于Wafergen Smartchip系统的高效极微量基因分型技术来解决上述问题很有必要。

发明内容

本发明的目的在于提供一种基于Wafergen Smartchip系统的高效极微量基因分型技术，以解决上述背景技术中提出的问题。

为实现上述目的，本发明提供如下技术方案：一种基于Wafergen Smartchip系统的高效极微量基因分型技术，具体包括以下步骤：

步骤一，调试好MSND(WaferGen Biosystems SmartChip MultisampleNanodispenser)分液设备，利用MSND(WaferGen Biosystems SmartChip MultisampleNanodispenser)自带软件进行分液程序的设置；

步骤二，根据需求配置反应酶试剂，然后将反应酶试剂分别加入到384孔板中，每个孔位加入5-10微升酶试剂；

步骤三，将DNA样品分别加入到384孔板内已加有酶试剂的孔位，每个孔位5-8微升；

步骤四，将芯片放置入MSND(WaferGen Biosystems SmartChip MultisampleNanodispenser)中，将配置有样品及酶试剂的384孔板放置到MSND(WaferGen BiosystemsSmartChip Multisample Nanodispenser)上方，然后执行分液程序，将384孔板内的样品喷入芯片中；

步骤五，配置检测位点assay引物试剂，加入到一块新的384孔板内，每孔10-12微升；

步骤六，将加有assay引物试剂的384孔板放入MSND(WaferGen BiosystemsSmartChip Multisample Nanodispenser)中，执行分液程序，将384孔板内assay引物试剂喷入之前已喷入样品酶试剂的芯片中；