[发明专利]一种立克次氏体巢式PCR特异性引物及检测试剂盒与巢式PCR检测方法在审

专利信息
申请号: 201810048122.6 申请日: 2018-01-18
公开(公告)号: CN108034738A 公开(公告)日: 2018-05-15
发明(设计)人: 王素华;帅江冰;张晓勇;吕继洲;袁淑辉;张晓峰;吴绍强 申请(专利权)人: 王素华
主分类号: C12Q1/689 分类号: C12Q1/689;C12Q1/6848;C12Q1/04;C12N15/11
代理公司: 温州金瓯专利事务所(普通合伙) 33237 代理人: 王坚强
地址: 325000 浙江省温州*** 国省代码: 浙江;33
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摘要:
搜索关键词: 一种 立克次氏体 pcr 特异性 引物 检测 试剂盒 方法
【权利要求书】:

1.一种立克次氏体巢式PCR特异性引物,其特征在于,包括设计的两对特异性引物,具体为:

外引物EF1∶5′-TTT-CCC-TAT-GAT-ACA-GAA-GGT-AAC-3′;

内引物ER1:5′-AAA-GCA-AGG-ATT-GTG-ATC-TGG-ACC-3′;

外引物EF2:5′-ACT-AGT-AGA-AAT-TGC-ACA-ATC-TAT-3′;

内引物ER2:5′-TGA-TAA-CTT-GGT-GCG-GGA-AAT-CCT-T-3″。

2.一种立克次氏体巢式PCR检测试剂盒,其特征在于,所述的巢式PCR检测试剂盒包括以下组分:

(一)权利要求1所述的两对特异性引物;

(二)阳性对照:所述的阳性对照为含有目的基因片段的重组质粒,该质粒含立克次氏体993bp基因片段;

(三)阴性对照:所述的阴性对照为去离子水;

(四)Taq酶。

3.根据权利要求2所述的立克次氏体巢式PCR检测试剂盒,其特征在于,所述的阳性对照通过将扩增产物克隆至pUCm-T转化DH5-α感受态细胞,经酶切鉴定及测序后获得为阳性重组质粒的阳性对照。

4.一种采用权利要求1所述的特异性引物的立克次氏体巢式PCR检测方法,其特征在于,包括以下步骤:

(1)被检标本DNA提取:取花蜱数只,酒精清洗,每只蜱放入单独的1.5ml EP dof管,200μL PBS液浸没蜱,用样品破碎仪破碎蜱的虫体,吸取破碎后的溶液,加入Trizol试剂裂解,采用常规的酚/氯仿抽提,乙醇沉淀,干燥后用三羟甲基氨基甲烷-乙二胺四乙酸溶解,-20℃保存备用;

(2)以权利要求1中的外引物EF1、ER1扩增:在EP dof管中加入处理后的蜱标本DNA,同时设阴、阳性对照,10×PCR Buffer,Mgcl2,dNTP,Taq酶,25pmol/μL EF1,25pmol/μL ER1,DNA模板,ddH2O混匀后稍离心的50μL反应体系中进行第一轮PCR;

(3)以权利要求1中的内引物EF2、ER2扩增:以第一轮PCR产物DNA为模板,以EF2、ER2为第二套引物,在10×PCR Buffer 5μL,Mgcl2 2μL,dNTP 4μL,Taq酶0.5μL,25pmol/μL EF2 1μL,25pmol/μL ER2 1μL,DNA模板2μL,ddH2O 34.5μL混匀后稍离心的50μL反应体系进行第二轮PCR;

(4)PCR产物鉴定:取第二轮PCR产物2μL进行1.5%琼脂糖凝胶电泳鉴定;

(5)测序:将第二轮PCR产物送测序公司进行序列测定。

5.根据权利要求4所述的立克次氏体巢式PCR检测方法,其特征在于,所述的步骤(2)中的第一轮PCR反应条件为:

94℃预热5min;

94℃保持lmin,55℃保持1min,72℃保持2min,该步骤进行共30个循环;

末次延伸至72℃,保持10min。

6.根据权利要求4所述的立克次氏体巢式PCR检测方法,其特征在于,所述的步骤(2)中的第二轮PCR反应条件为:

94℃预热5min;

94℃保持1min,55℃保持1min,72℃保持2min,该步骤进行共30个循环;

末次延伸至72℃,保持10min。

7.根据权利要求4所述的立克次氏体巢式PCR检测方法,其特征在于,所述的步骤(2)中第一轮PCR 50μL反应体系中蜱样品基因组DNA模板量为5μl,10×PCR Buffer为5μL,Mgcl2为2μL,dNTP为4μL,Taq酶为0.5μL,25pmol/μL EF1为1μL,25pmol/μL ER1为1μL,ddH2O为31.5μL。

8.根据权利要求2所述的立克次氏体巢式PCR检测方法,其特征在于,所述的步骤(4)中第二轮PCR 50μL反应体系中第一轮PCR产物DNA模板量为2μl,10×PCR Buffer为5μL,Mgcl2为2μL,dNTP为4μL,Taq酶为0.5μL,25pmol/μL EF2 1μL,25pmol/μL ER2为1μL,ddH2O为34.5μL。

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