[发明专利]一种检测呼吸道病毒的方法有效
| 申请号: | 201810004952.9 | 申请日: | 2018-01-03 |
| 公开(公告)号: | CN109988865B | 公开(公告)日: | 2021-03-05 |
| 发明(设计)人: | 廖逸群;李庆阁;许晔;许海坡;林明芳 | 申请(专利权)人: | 厦门大学 |
| 主分类号: | C12Q1/70 | 分类号: | C12Q1/70;C12N15/11 |
| 代理公司: | 中国贸促会专利商标事务所有限公司 11038 | 代理人: | 林远成 |
| 地址: | 361005 福建*** | 国省代码: | 福建;35 |
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| 摘要: | |||
| 搜索关键词: | 一种 检测 呼吸道 病毒 方法 | ||
1.一种探针组(probe set),其包含一种检测探针,以及至少两种的媒介子探针,其中,
所述媒介子探针各自独立地从5'至3'方向包含媒介子序列和靶特异性序列,所述靶特异性序列包含与特异于一种呼吸道病毒的一种靶核酸序列或一种对照序列互补的序列,所述媒介子序列包含不与所述靶核酸序列或对照序列互补的序列,并且,所有媒介子探针所包含的媒介子序列彼此不同;和
所述检测探针从3'至5'方向包含,与每一种媒介子序列或其部分互补的捕获序列,以及模板序列(templating sequence);并且,所述检测探针标记有报告基团和淬灭基团,其中,所述报告基团能够发出信号,并且,所述淬灭基团能够吸收或淬灭所述报告基团发出的信号;并且,所述检测探针在与其互补序列杂交的情况下发出的信号不同于在未与其互补序列杂交的情况下发出的信号。
2.权利要求1的探针组,其中,所述探针组具有选自下列的一个或多个特征:
(1)所述探针组包含2种、3种、4种、5种、6种、7种、8种、9种、10种或更多种媒介子探针;
(2)所有媒介子探针所包含的媒介子序列彼此不同;并且,所有媒介子探针所包含的靶特异性序列彼此不同;
(3)所有媒介子探针各自靶向不同的靶核酸序列;
(4)至少一条媒介子探针或其所包含的靶特异性序列靶向对照序列;
(5)所述呼吸道病毒选自,甲型流感病毒、乙型流感病毒、甲型呼吸道合胞病毒、乙型呼吸道合胞病毒、鼻病毒、腺病毒、副流感病毒I型、副流感病毒II型、副流感病毒III型、副流感病毒IV型、人偏肺病毒、肠道病毒、轮状病毒、博卡病毒、冠状病毒SARS、冠状病毒HKU1、冠状病毒OC43、冠状病毒NL63、冠状病毒229E,或其任何组合;
(6)所述探针组还包含上游寡核苷酸序列,所述上游寡核苷酸序列包含与所述靶核酸序列互补的序列;并且,当与所述靶核酸序列杂交时,所述上游寡核苷酸序列位于所述媒介子探针的靶特异性序列的上游;
(7)所述探针组还包含下游寡核苷酸序列,所述下游寡核苷酸序列包含与所述靶核酸序列互补的序列;并且,当与所述靶核酸序列杂交时,所述下游寡核苷酸序列位于所述媒介子探针的靶特异性序列的下游。
3.权利要求2的探针组,其中,所述媒介子探针或其所包含的靶特异性序列靶向2种、3种、4种、5种、6种、7种、8种、9种、10种或更多种呼吸道病毒的特异性核酸序列。
4.权利要求2的探针组,其中,所述不同的靶核酸序列各自特异于相同或不同的呼吸道病毒。
5.权利要求2的探针组,其中,所述对照序列为宿主特异性序列。
6.权利要求2的探针组,其中,所述宿主特异性序列为人特异性序列。
7.权利要求2的探针组,其中,所述鼻病毒为鼻病毒B。
8.权利要求2的探针组,其中,所述腺病毒为腺病毒B。
9.权利要求2的探针组,其中,所述探针组针对每一种靶核酸序列和媒介子探针,提供一种上游寡核苷酸序列。
10.权利要求2的探针组,其中,所述探针组针对每一种靶核酸序列和媒介子探针,提供一种下游寡核苷酸序列。
11.权利要求2的探针组,其中,所述探针组包含所述上游寡核苷酸序列和下游寡核苷酸序列,并且所述的上游寡核苷酸序列和下游寡核苷酸序列的5'端含有一段相同的寡核苷酸序列。
12.权利要求11的探针组,其中,所述探针组进一步包含通用引物,其具有与所述相同的寡核苷酸序列互补的序列。
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